湖南地區(qū)漢族人群20個非CODIS STR基因座多態(tài)性

周健，吳曉雪

（湘西自治州公安局，湖南吉首 416000）

·研究簡報·

湖南地區(qū)漢族人群20個非CODIS STR基因座多態(tài)性

周健，吳曉雪

（湘西自治州公安局，湖南吉首 416000）

法醫(yī)遺傳學(xué)；多態(tài)現(xiàn)象，遺傳；短串聯(lián)重復(fù)序列；湖南；漢族

本研究采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒，對湖南湘西自治州300名漢族無關(guān)個體的20個非CODIS STR基因座進(jìn)行群體遺傳學(xué)調(diào)查，以獲取20個STR基因座在該地區(qū)的相關(guān)群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)，為該地區(qū)的法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，現(xiàn)報道如下。

1 材料與方法

湖南漢族人群血樣在知情同意原則下采自健康志愿者，包括男性180名，女性120名。采用Chelex-100法[1]提取DNA。Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒購自基點認(rèn)知（北京）公司。PCR反應(yīng)體系為10 μL，循環(huán)條件：95℃11 min；94℃30 s，60℃60s，70℃60s，30個循環(huán)；60℃30min。PCR產(chǎn)物變性后在3130XL型遺傳分析儀（美國AB公司）上進(jìn)行毛細(xì)管電泳，用GeneMapper ID v3.2.1軟件對STR基因座進(jìn)行分型。對基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗。采用PowerStats軟件分別計算20個基因座的雜合度（H）、個人識別率（DP）、非父排除率（PE）、多態(tài)信息含量（PIC）等群體遺傳學(xué)參數(shù)。

2 結(jié)果與討論

目前市場上的商業(yè)化試劑盒中大多數(shù)基因座是CODIS基因座結(jié)合個別非CODIS基因座，由于STR基因座的突變率較高，在親權(quán)鑒定中對于非CODIS基因座的需求比較大。本研究采用的Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒則涵蓋了20個非CODIS基因座，這20個STR基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)見表1。

經(jīng)對每個基因座的基因型分布進(jìn)行χ2檢驗，符合Hardy-Weinberg平衡定律（P>0.05）。20個STR基因座的DP值均大于0.85，在群體中的累積個體識別率為1-3.2264×10-26。該20個STR基因座在二聯(lián)體和三聯(lián)體中的累積非父排除率均大于0.99999。以上表明，這20個STR基因座在湖南漢族人群中具有良好的多態(tài)性，能夠用于日常法醫(yī)學(xué)實踐。

表1 20個STR基因座在湖南漢族人群中的群體遺傳學(xué)參數(shù)（n=300）

[1]Walsh PS，Metzger DA，Higushi R.Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material.BioTechniques 10（4）：506-513（April 1991）[J].Biotechniques，2013，54（3）：134-139.

DF795.2

B

10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.017

1004-5619（2015）06-0478-01

2015-08-24）

（本文編輯：李成濤）

周健（1982—），男，法醫(yī)師，主要從事法醫(yī)物證學(xué)鑒定；E-mail：45159121@qq.com