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南瓜種質資源農藝性狀的主成分及聚類分析

2015-12-07 10:10:40袁建民木萬福李易蓉王文學楊龍但忠蘇銀玲楊子祥
長江蔬菜 2015年16期
關鍵詞:資源

袁建民 ,木萬福 ,李易蓉 ,王文學 ,楊龍 ,但忠 ,蘇銀玲 ,楊子祥

(1.云南省農業科學院熱區生態農業研究所,昆明,651300;2.云南省雙柏縣農業局)

南瓜屬(Cucurbita)是一個大族群,起源于中、南美洲[1],包括 5 個栽培種:中國南瓜(Cucurbita moschata)、美洲南瓜(C.pepo)、印度南瓜(C.maxima)、灰籽南瓜(C.mixta)和黑籽南瓜(C.ficifolia)。有研究表明,南瓜營養豐富,富含南瓜多糖、抗壞血酸、β-胡蘿卜素等,同時保健藥用價值高,具備顯著降脂、降糖、防癌、抗癌等功效[2,4]。據聯合國糧農組織(FAO)數據統計顯示,2011年世界南瓜種植面積約為177萬 hm2,產量約2 430萬 t。中國和印度均為南瓜屬作物主產國,中國南瓜栽培面積約37萬 hm2,位居世界第2位,僅次于印度(51萬hm2);中國南瓜總產量約697萬t,位居世界第1位。

植物遺傳多樣性的研究是種質資源創新和品種改良的基礎,研究種質間的親緣關系和系統分類具有重要意義。利用分子標記技術和同工酶分析對植物種質資源進行評價、鑒定和分類在南瓜屬植物中已有報道[5~8],然而形態學水平的評價和鑒定仍是種質資源研究最古老、最直接、最簡便的途徑和方法,不可忽視。本試驗以37份南瓜種質為材料,對其27個農藝性狀進行觀察記錄和評價,采用主成分分析及聚類分析,為南瓜種質資源的收集、保存、鑒定、創新和開發利用提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

供試南瓜種質材料共37份,均由云南省農業科學院園藝作物研究所龍榮華老師提供,其編號、來源地見表1,除4份材料為商品種外,其余均為云南的地方資源。

1.2 試驗方法

所有供試材料于2010年種植于云南省農業科學院熱區生態農業研究所蔬菜研究基地。隨機區組設計,每小區定植10株,3次重復。采用白色地膜覆蓋栽培、滴管灌溉,單行種植、爬地栽培、自交授粉,常規栽培管理。試驗數據觀察記錄參考《南瓜種質資源描述規范和數據標準》[9],每小區隨機選取5株,共記錄7個質量性狀和20個數量性狀。

1.3 數據處理與分析

質量性狀依據《南瓜種質資源描述規范和數據標準》進行賦值(表2)。數量性狀按照原始數值進行統計分析。對南瓜種質27個農藝性狀賦值后,采用SAS 9.0軟件對平均值、最小值、最大值、極差、標準差及變異系數等基本統計量進行分析。

在計算Shannon多樣性信息指數之前,先對數量性狀進行分級,共分為10級,1級<X-2s,10級>X+2s,中間每級間隔0.5s,X代表平均值,s代表標準差。Shannon多樣性信息指數,其中,Pi代表1個農藝性狀有s個不同類型,第i個類型個體數目在總個體數目中所占的比率。

1.4 主成分分析與聚類分析

對37份南瓜種質資源的27個形態學性狀的數據進行標準化處理,采用SAS 9.0統計軟件中的PRINCOMP過程進行主成分分析,再采用SAS 9.0軟件中的類平均法(UPGMA)進行系統聚類分析。

2 結果與分析

2.1 南瓜種質農藝性狀的基本統計量分析

37份南瓜種質的27個農藝性狀基本統計量分析結果表明,不同種質之間變異較大,各性狀在不同種質之間呈現不同程度的遺傳多樣性(表3)。27個性狀中,瓜形變異系數最大,為69.44%,全生育期變異系數最小,僅為5.50%,平均變異系數為26.86%。

①植株性狀 南瓜種質植株性狀平均變異系數為21.38%。葉片寬8.10~36.30 cm,變異系數最大(32.65%);其次為第1雌花節位(30.46%)。

③果實性狀 南瓜種質果實性狀平均變異系數為32.82%,表明南瓜在果實性狀方面多樣性程度較高。參試材料瓜形共有8種,變異系數最大,為69.44%;其次為老瓜肉色,為49.37%;嫩瓜皮色變異系數最小,為12.10%。

②種子性狀 南瓜種質性狀平均變異系數為21.23%,變異程度較低,其中種皮色變異系數最大,為48.31%,包括白色、灰白、黃白、黃、黃褐及黑色6種;其次為種子寬度,為14.73%,種子長度和種形指數變異系數較小。

表1 供試南瓜種質材料編號及來源地

綜上可知,果實性狀平均變異系數(32.82%)明顯高于植株性狀 (21.38%)和種子性狀(21.23%),而后面二者之間差異不大。

表2 南瓜種質質量性狀調查

2.2 南瓜種質農藝性狀多樣性比較分析

Shannon多樣性信息指數作為反映種質間各性狀變異的一個重要指標,其值越高,說明表型性狀的多樣性越豐富。由表3可知,37份南瓜種質的多樣性信息指數平均值為1.667。7個質量性狀中,瓜形的多樣性信息指數最高 (1.535),其次是果實橫切面形狀(1.319)、嫩瓜皮色(1.229)、老瓜肉色(1.216)、種皮色(1.208)、老瓜皮色(1.160),瓜面特征多樣性信息指數最低(0.785)。20個數量性狀中,老瓜縱徑多樣性信息指數最高(2.273),其次是老瓜橫徑(2.166)、老瓜肉厚(2.063)、葉柄粗(2.025)、葉柄長(2.023),第 1 雄花節位多樣性信息指數最低(0.912)。總體來看,數量性狀的平均Shannon多樣性指數(1.828)顯著高于質量性狀(1.207),植株性狀平均多樣性信息指數(1.746)>種子性狀(1.665)>果實性狀(1.607)。

2.3 主成分分析

由表4可知,第 1、第2、第3主成分的方差貢獻率依次為20.89%、13.64%和10.28%,前3個主成分累積貢獻率為44.81%,基本可概括這些性狀的總信息。由表5可知,第1主成分對應的特征向量絕對值大的比較多且分布較平均,葉片長、葉片寬、葉柄長和葉柄粗的系數較大,依次為0.373 128、0.329 750、0.318 170、0.330 777,表明第 1 主成分主要反映植株葉片的數量性狀,可認為是生長勢因子;第2主成分表達式中,種子長度、寬度和種皮顏色的系數較大,分別為0.350 336、0.265 651和0.439 240,表明第2主成分主要反映的是種子性狀,可以認為是種性因子;第3主成分表達式中,第1雌花節位、第1果實節位、老瓜縱徑、瓜形、老瓜橫切面形狀的系數較大,表明第3主成分主要反映果實方面的性狀,可以認為是果實因子。可見,運用形態學性狀對南瓜種質進行分類時,可以先考慮植株葉片的相關性狀,然后是種子性狀,再是果實的相關性狀。

2.4 性狀聚類分析

由圖1可知,在遺傳距離大約1.20處,可以將37份南瓜種質分為3類:第1類為46號(黑籽南瓜),為云南特有,常用作砧木,與其余36份材料有較大的遺傳距離,說明與其他材料的親緣關系較遠;第2類為24號,其特點是主蔓、葉柄、瓜梗較粗,葉片大且寬,老瓜肉橙黃色,種皮黃褐色;其余材料為第3類,它們之間的很多表型相似,親緣關系比較相近。

表3 37份南瓜種質27個農藝性狀的基本統計量分析

在遺傳距離約1.10處,第3類種質又可以分為3個亞類:第1亞類,包括CK、錦栗南瓜、15號、金祥1號、17號和中栗3號,共6份資源,共同特點是生育期較短,葉柄長中等,葉柄較細,單瓜質量較接近,扁圓形,老瓜皮色艷麗,為紅色、橙紅色或墨綠色,極具觀賞價值。

第2亞類,包括1號和25號,兩者農藝性狀有很多相似之處,與其他種質主要區別在于果實縱徑遠遠大于果實橫徑,屬于長形中國南瓜。

第3亞類,包括2號、6號、23號、26號、27號、28號、30號、11號、38號、12號、4號、5號、10號、19 號、22 號、43號、35 號、29號、31 號 、36 號 、47號、20號、16號、48號、3號、41號、37號,共 27份資源,它們之間存在較多相似之處。共同特點是生育期較長,中晚熟,單瓜質量中等,老瓜皮色多數為棕黃色,瓜形基本為扁圓形、近圓形或橢圓形,種皮色多數為灰白或黃白色。

表4 37份南瓜種質27個農藝性狀主成分的特征值和貢獻率

3 討論與結論

云南南瓜種質資源相當豐富,類型多樣,然而對云南南瓜種質的研究仍不夠深入。通過形態學鑒定、主成分分析和聚類分析等方法,開展云南南瓜種質不同地方資源之間的遺傳多樣性研究,對云南南瓜起源和演化、資源合理利用以及新品種選育等研究具有重要意義[10,11]。

研究結果表明,27個農藝性狀的平均變異系數為26.86%。27個農藝性狀的Shannon多樣性信息指數平均值為1.667,變化幅度為0.785~2.273。試驗發現,變異系數最大的是瓜形,其Shannon多樣性信息指數為1.535,低于平均水平,而多樣性信息指數最大的老瓜縱徑,其變異系數卻為44.90%,并非最高,表明變異系數和Shannon多樣性信息指數在反映種質遺傳多樣性的內涵是不同的。因此,為更加準確有效地反映種質資源之間的遺傳變異,最好將二者結合起來分析。

表5 前7個主成分對應的特征向量

對27個農藝性狀的主成分分析結果表明,第1主成分反映植株葉片的性狀,第2主成分反映種子性狀,第3主成分主要反映果實性狀,基本可以分別歸納為生長勢因子、種性因子和果實因子。3個主成分的累積貢獻率為44.81%,而生長勢因子的貢獻率最高,為20.89%,這與杜曉華等[3]的研究結果一致。

本研究聚類分析結果表明,37份南瓜種質可以分為三大類。前人研究認為,南瓜種質資源的分類可能與生態型或地域來源密切相關[8]。而本研究發現,材料1號和25號聚集為一類,其來源地卻不相同,分別來源于楚雄和曲靖;而來源地相同的一些材料卻未能按生態區域聚集在一起,類似的研究結果在茄子、西瓜等作物中也有報道[12,13],具體原因需進一步研究探討。

圖1 37份南瓜種質資源聚類分析

[1]林德佩.南瓜植物的起源和分類[J].中國西瓜甜瓜,2000(1):36-38.

[2]李俊麗.南瓜種質資源遺傳多樣性與多糖多樣性的研究[D].武漢:華中農業大學,2006.

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