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ACE基因單核苷酸多態(tài)性與冠心病易感性的關(guān)聯(lián)性分析

2015-11-28 07:36:00賈一揚(yáng)周麗婷李春艷王樹越

吳 娟,賈一揚(yáng),劉 特,周麗婷,孫 迪,徐 縉,李春艷,王樹越,于 雷,葉 琳

(1.吉林大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)教研室,吉林 長春 130021;2.吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院急診科,吉林 長春 130033;3.吉林大學(xué)第二醫(yī)院放療科,吉林 長春 130041)

冠心病 (coronary heart disease,CHD)是一種原因尚不明確的心血管疾病,其危險因素主要包括遺傳因素、年齡、性別、血脂異常、高血壓、糖尿病、肥胖與超重、不良生活飲食習(xí)慣和精神壓力等。CHD的形成涉及到遺傳因素、環(huán)境因素及其交互作用,動脈粥樣硬化是其病變的主要病理生理學(xué)機(jī)制[1-2],在動脈粥樣硬化的發(fā)生發(fā)展過程中腎素-血管 緊 張 素-醛 固 酮 系 統(tǒng) (renin-angiotensinaldosterone system,RAAS)起著重要的作用[3]。RAAS是體內(nèi)重要的內(nèi)分泌系統(tǒng),在血壓及心血管穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)中占有重要的地位,其過度激活與CHD、充血性心力衰竭和高血壓等疾病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[4]。血管緊張素轉(zhuǎn)換酶 (angiotensin converting enzyme,ACE)是RAAS系統(tǒng)中參與構(gòu)成血管內(nèi)皮細(xì)胞的一種金屬肽酶,是ACE基因的表達(dá)產(chǎn)物[5-6]。目 前國內(nèi)外 有關(guān) ACE 基 因 與CHD相關(guān)性的研究多集中于ACE基因插入/缺失多態(tài)性 (I/D)[7-9],關(guān)于 ACE 基因單核苷酸多態(tài)性 (single nucleotide polymorphism,SNPs)與CHD關(guān)聯(lián)性的研究少有報道。本研究擬通過病例對照研究,選取ACE基因rs4267385和rs4316位點(diǎn),旨在探討ACE基因與中國北方漢族人群CHD易感性的關(guān)系。

1 資料與方法

1.1 研究對象 選擇2009—2013年在吉林大學(xué)第一醫(yī)院確診并住院治療的CHD患者246例作為病例組,研究對象臨床表現(xiàn)及心電圖變化均符合WHO制定的CHD診斷標(biāo)準(zhǔn)。對照組為同期在吉林大學(xué)第一醫(yī)院體檢中心體檢的健康個體251名。個體間均無血緣關(guān)系且2組人群均為中國北方漢族人。

1.2 主要試劑和儀器 DNA提取試劑盒、TaqDNA聚合酶引物、PCR引物、限制性內(nèi)切酶、瓊脂糖和DL 2000DNA Marker(Takara公司,日本),溴化乙錠 (大連寶生物工程有限公司)。離心機(jī) (Eppendorf公司,德國),微量加樣器(Gilson公司,美國),PCR擴(kuò)增儀和紫外凝膠成像系統(tǒng) (Bio-Rad公司,美國),電泳儀 (北京六一儀器廠),恒溫培養(yǎng)箱 (上海賀德實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司)。

1.3 基因組DNA的提取 在研究對象知情同意的情況下,抽取外周靜脈血5mL,EDTA抗凝,-20℃凍存以備基因組DNA的提取。按照DNA提取試劑盒實(shí)驗(yàn)步驟從EDTA抗凝全血中提取DNA,采用紫外分光光度計檢測DNA含量,A280/A260比值均在1.6~2.0。

1.4 SNPs的選擇 在Hapmap數(shù)據(jù)庫中查詢中國北方漢族人群ACE基因的SNPs數(shù)據(jù),運(yùn)用Haploview 4.2軟件對位點(diǎn)進(jìn)行篩選,選取最小等位基因頻率 (MAF)大于0.1、連鎖不平衡系數(shù) (r2)大于0.8、連鎖不平衡程度隨距離而改變的程度 (D′)為1的2個SNPs位點(diǎn) (rs4267385和rs4316)作為研究位點(diǎn),采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性 (PCR-RFLP)方法進(jìn)行基因型檢測。

1.5 基因型檢測 引物設(shè)計:在NCBI的SNP庫里查詢ACE基因rs4267385和rs4316位點(diǎn)的模板序列,利用Primer 5.0軟件設(shè)計引物。rs4267385,上游引物 5′-GGGAAGTGAGTCTGAGGG-3′,下游 引 物 5′-TGGAAGCCAGGTTATCTC-3′;rs4316,上 游 引 物 5′-CGGGCTCCGCTCTTATTG-3′, 下 游 引 物 5′-GGGCTCTGGGCTGATGTCT-3′。反應(yīng)體系為20μL,含有2×Taq PCR MasterMix 10μL,上下游引物各2μL,二餾滅菌水 (ddH2O)4μL,模板DNA 2μL;反應(yīng)條件:94℃ 預(yù) 變 性 5min;94℃、30s,58℃(rs4267385)/56℃ (rs4316)、30s,72℃、1min,34個循環(huán);72℃延伸10min;4℃保存。酶切體系及反應(yīng)條件:酶切體系為20μL,包含PCR擴(kuò)增產(chǎn)物10μL,限制性內(nèi)切酶 (rs4267385用PmlⅠ,rs4316用 Xsp Ⅰ)0.8μL,ddH2O 7.2μL,10×Buffer/10×Buffer TangoTM2μL。酶切體系在37℃恒溫箱中酶切4~16h后,用2.5%瓊脂糖凝膠電泳30min,凝膠成像分析系統(tǒng)觀察酶切圖譜,判斷位點(diǎn)的基因型。

1.6 統(tǒng)計學(xué)分析 采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,采用擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)分析病例組和對照組基因型頻數(shù)分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律,采用χ2檢驗(yàn)分析SNPs基因型、等位基因頻數(shù)分布與CHD的關(guān)聯(lián)性。

2 結(jié) 果

2.1 研究對象的基本情況 病例組共246例,其中男性130例,女性116例,平均年齡 (64.74±11.35)歲。對照組共251例,其中男性124例,女性127例,平均年齡 (62.39±12.16)歲。病例組與對照組研究對象年齡和性別比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義 (t年齡=1.614,P=0.205;χ2性別=0.150,P=0.904),說明病例組與對照組人群年齡和性別均匹配,具有可比性。

2.2 rs4267385和rs4316位點(diǎn)酶切電泳結(jié)果rs4267385位點(diǎn)帶有C基因型被酶切成336和52bp 2個片段;帶有T基因型不能被酶切,電泳時只有388bp片段;CT雜合子同時具有3個片段。rs4316位點(diǎn)帶有T基因型被酶切成140和116bp 2個片段;而帶有C基因型不能被酶切,電泳時只有256bp片段;CT雜合子同時具有3個片段。見圖1。

2.3 Hardy-Weinberg平衡定律檢測 采用擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)對病例組和對照組rs4267385、rs4316位點(diǎn)的基因型頻數(shù)分布進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),結(jié)果顯示:病例組和對照組研究對象2個位點(diǎn)基因型分布均符合 Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。見表1。

2.4 病例組和對照組人群ACE基因rs4267385和rs4316位點(diǎn)的基因型和等位基因頻數(shù)分布比較病例組和對照組rs4267385位點(diǎn)CC、CT和TT基因型頻數(shù)分布比較差異均有統(tǒng)計學(xué)意義 (P<0.05),OR (CC/CT)=0.660 (95%CI:0.398~1.118), OR (TT/CT) = 1.402 (95%CI:0.954~2.052),OR (CC+ TT/CT) =1.139(95%CI:0.798~1.626);C、T等位基因頻數(shù)分布比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (P<0.05),OR (C/T)=0.640 (95%CI:0.495~0.827)。見表2。

圖1 rs4267385(A)和rs4316(B)位點(diǎn)酶切電泳圖Fig.1 Electrophoregram of digestion of rs4267385(A)and rs4316(B)sites

病例組和對照組rs4316位點(diǎn)CC、CT和TT基因型頻數(shù)分布比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05), OR (CC/CT) = 0.926 (95%CI:0.581~1.475),OR (TT/CT)=1.100(95%CI:0.717~1.686),OR (CC+TT/CT)=1.019(95%CI:0.715~1.454);C、T等位基因頻數(shù)分布比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),OR (C/T)=0.928 (95%CI:0.723~1.191)。見表3。

表1 2個SNPs位點(diǎn)Hardy-Weinberg平衡的擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)結(jié)果Tab.1 Results ofχ2 test of Hardy-Weinberg equilibrium of two SNPs sites

3 討 論

人體ACE基因位于染色體17q23,ACE對于心血管系統(tǒng)具有重要作用,主要使血管緊張素Ⅰ(AngiotensinⅠ,AngⅠ)轉(zhuǎn)化為血管緊張素Ⅱ(AngiotensinⅡ,AngⅡ),滅活緩激肽和調(diào)節(jié)血管張力。AngⅡ有縮血管的作用,且能誘導(dǎo)血管平滑肌細(xì)胞增生和肥厚,加強(qiáng)血小板衍生生長因子的表達(dá)及抑制纖溶活性,使低密度脂蛋白 (LDL)在血管壁內(nèi)滯留、氧化并被巨噬細(xì)胞吞噬,促進(jìn)血栓形成;而緩激肽能刺激內(nèi)皮細(xì)胞釋放舒張因子,抑制平滑肌細(xì)胞的增殖[10]。當(dāng)ACE基因上某個堿基發(fā)生改變,可引起血管緊張素表達(dá)量或活性的改變,與冠心病和心肌梗死的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。Sesal等[11]和 Dzielinska等[12]研 究 發(fā) 現(xiàn):ACE 基因是歐洲人群中CHD的易感基因。YyLmaz等[13]對ACE基因I/D多態(tài)性與兒童CHD發(fā)病相關(guān)性進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn):病例組人群D等位基因頻數(shù)高于對照組。姜昕等[14]對中國居民ACE基因I/D多態(tài)性與CHD易感性關(guān)系進(jìn)行了薈萃分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):病例組人群DD基因型和D等位基因頻數(shù)分布均高于對照組,DD基因型個體CHD發(fā)病風(fēng)險高于ID型和II型,表明D等位基因與CHD發(fā)病風(fēng)險密切相關(guān)。

表2 病例組和對照組人群rs4267385位點(diǎn)基因型和等位基因頻數(shù)分布Tab.2 Distribution of genotypic and allelic frequencies at rs4267385site in case and control groups [n (η/%)]

表3 病例組和對照組人群rs4316位點(diǎn)基因型和等位基因頻數(shù)分布Tab.3 Distribution of genotypic frequencies and allelic frequencies at rs4316site in case and control groups[n(η/%)]

CHD是一種受多個遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的復(fù)雜疾病。Sun等[15]研究發(fā)現(xiàn):ACE基因rs4332位點(diǎn)多態(tài)性與老年人冠心病發(fā)病有關(guān)。Ellis等[16]對ACE基因多態(tài)性與CHD易感性的研究發(fā)現(xiàn):ACE基因rs4267385多態(tài)性與CHD發(fā)病有關(guān)。本研究采用病例-對照研究探討ACE基因上2個SNPs與中國北方漢族人群CHD易感性的關(guān)系,結(jié)果顯示:病例組和對照組人群rs4267385位點(diǎn)基因型和等位基因頻數(shù)分布比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義,OR (CC/CT)=0.660、OR (TT/CT)=1.402、OR (C/T)=0.640,表明rs4267385位點(diǎn)多態(tài)性與中國北方漢族人群CHD易感性有關(guān)聯(lián),TT基因型個體CHD發(fā)病風(fēng)險高于CC基因型和CT基因型個體,與Ellis等[16]研究結(jié)果一致。rs4267385位點(diǎn)多態(tài)性改變可能會導(dǎo)致ACE表達(dá)的差異,影響AngⅠ轉(zhuǎn)化為AngⅡ的過程,從而導(dǎo)致心血管疾病易感性的差異。本研究發(fā)現(xiàn):rs4316位點(diǎn)多態(tài)性與中國北方漢族人群CHD易感性無關(guān)聯(lián),可能是由于rs4316位點(diǎn)多態(tài)性與CHD易感性無關(guān)或本研究樣本量較少,檢驗(yàn)效能低的原故。在今后的研究中需進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量,同時檢測與CHD發(fā)生可能相關(guān)的其他基因,進(jìn)行基因與基因、基因與環(huán)境之間交互作用的分析。

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