余璐璐,陽敦潤(rùn),曹中權(quán),劉龍山,羅 璐,徐 飛*,
(武漢生物工程學(xué)院 a.應(yīng)用生物技術(shù)研究中心;b.生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,湖北 武漢 430415)
擬南芥CAS基因的生物信息學(xué)分析及超表達(dá)載體構(gòu)建
余璐璐a,陽敦潤(rùn)b,曹中權(quán)b,劉龍山b,羅 璐b,徐 飛*a,b
(武漢生物工程學(xué)院 a.應(yīng)用生物技術(shù)研究中心;b.生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,湖北 武漢 430415)
對(duì)擬南芥氰丙氨酸合酶(cyanoalanine synthase,CAS)基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,并構(gòu)建了CAS合酶基因的超表達(dá)載體,以期為其后續(xù)功能研究奠定基礎(chǔ)。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,編碼擬南芥CAS合酶的CYS-C1和CYS-D1基因均含有10個(gè)外顯子和9個(gè)內(nèi)含子,定位于3號(hào)染色體,而CYS-D2基因有9個(gè)外顯子和8個(gè)內(nèi)含子,定位于5號(hào)染色體;3個(gè)基因編碼的蛋白氨基酸序列相似度較高,CYS-C1蛋白偏堿性且主要在線粒體中起作用,而CYS-D1和CYS-D2蛋白偏酸性,主要在細(xì)胞質(zhì)中起作用。通過RT-PCR擴(kuò)增了擬南芥CYS-C1、CYS-D1和CYS-D2基因片段,并構(gòu)建了超表達(dá)載體pBI121-35S-CYS-C1、pBI121-35S-CYS-D1和pBI121-35S-CYS-D2,經(jīng)檢測(cè)重組質(zhì)粒已轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌GV3101中。
擬南芥;氰丙氨酸合酶(CAS);超表達(dá)載體;生物信息學(xué)
氰丙氨酸合酶(cyanoalanine synthase,CAS)是植物解氰作用的關(guān)鍵酶[1],其底物之一氰化氫(hydrogen cyanide,HCN)是植物體內(nèi)廣為存在的一種內(nèi)源性小分子類代謝產(chǎn)物。HCN可抑制線粒體呼吸鏈中的細(xì)胞色素c氧化酶的活性,因而HCN對(duì)于生物體來說有很強(qiáng)的毒性[2-5]。但值得關(guān)注的是,植物具有產(chǎn)HCN并耐HCN的特性。以往的研究者分析一方面是因?yàn)橹参矬w內(nèi)存在一條由交替氧化酶(alternative oxidase,AOX)介導(dǎo)的抗氰呼吸途徑(cyanide-resistance respiration pathway),可減輕HCN對(duì)呼吸鏈的抑制作用[3-4];另一方面,HCN會(huì)誘導(dǎo)CAS合酶的活性,從而可將HCN降低到安全濃度范圍內(nèi)[5-6]。……