ClC-0氯離子通道蛋白質空間結構的同源建模

于 濤，朱紫洪，郝棟梁，彭 黎，張 攀，徐 號，郭 旭

（江漢大學 物理與信息工程學院，湖北 武漢 430056）

ClC-0氯離子通道蛋白質空間結構的同源建模

于 濤，朱紫洪，郝棟梁，彭 黎，張 攀，徐 號，郭 旭

（江漢大學 物理與信息工程學院，湖北 武漢 430056）

ClC型氯離子通道蛋白質在調節生命體的新陳代謝過程中起著重要作用。在原有蛋白質ClC-ec1晶體結構的基礎上，依據同源建模的原理，借助SWISS-MODEL網絡服務器構建了一類重要氯離子通道蛋白質ClC-0的空間結構，同時對所得結構的合理性進行了分析。通過衡量結構的Z-score值、分析結構的空間坐標波動性以及利用視圖軟件VMD將建模的ClC-0結構和模板結構進行比較，發現通過同源建模所得到蛋白質ClC-0的空間結構符合后續研究的要求，這在很大程度上方便了該類蛋白質的后續計算模擬研究。

同源建模；氯離子通道蛋白質；SWISS-MODEL

0 引言

離子通道是鑲嵌在生物體細胞膜上一類重要的蛋白質微小孔道，它在生命體系的新陳代謝過程中扮演著極其重要的角色。氯離子通道（chloride ion channel，CIC）是其中極為重要的一類陰離子通道，它擔負著包括鹽類離子的跨膜輸運、調節細胞pH值、控制細胞體積、調節電脈沖以及可激肌肉細胞的電壓穩定性等重要的生理和細胞功能［1］。研究者們通過生化、物理數學以及計算機模擬計算等技術方法對ClC類氯離子通道進行了廣泛的研究，這些研究包括結構分析、功能表達、變異導致相關疾病等。研究氯離子通道的結構與功能關系已成為保護人類健康，揭示致病機制和開發新藥的前沿熱點課題。……