笠貝幼蟲變態(tài)相關(guān)基因篩選及分子網(wǎng)絡構(gòu)建

尹 誠，張麗莉，王國棟，王藝磊

（1.集美大學水產(chǎn)學院，福建廈門 361021；2.農(nóng)業(yè)部東海海水健康重點實驗室，福建廈門 361021）

笠貝幼蟲變態(tài)相關(guān)基因篩選及分子網(wǎng)絡構(gòu)建

尹 誠1，2，張麗莉1，2，王國棟1，2，王藝磊1，2

（1.集美大學水產(chǎn)學院，福建廈門 361021；2.農(nóng)業(yè)部東海海水健康重點實驗室，福建廈門 361021）

利用NCBI在線數(shù)字化差異顯示工具（Digital Differential Display）對笠貝（Lottiagigantea）EST數(shù)據(jù)庫進行篩選，獲得笠貝幼蟲時期顯著差異表達基因203個，其中124個基因有Blast2Go注釋結(jié)果，這124個基因可以歸類成細胞組分、分子功能和生物學過程三大類；參與MAPK、Ras、PI3K-Akt、Rap1、cAMP等信號通路；涉及能量代謝、免疫應激、細胞分化、神經(jīng)發(fā)育、細胞骨架、信號傳遞等生物學過程.將獲得的轉(zhuǎn)錄子運用Cytoscape軟件構(gòu)建分子相互作用網(wǎng)絡，最終獲得7個核心轉(zhuǎn)錄子.涉及到神經(jīng)發(fā)育、次生殼形成等相關(guān)基因調(diào)控關(guān)系.

笠貝；數(shù)字化差異顯示；變態(tài)相關(guān)基因；生物分子網(wǎng)絡

0 引言

貝類的生活史中有浮游幼蟲階段，其幼蟲和成體在形態(tài)結(jié)構(gòu)和生活習性上差別巨大.幼蟲通過變態(tài)過程轉(zhuǎn)變?yōu)榕c成體形態(tài)結(jié)構(gòu)和生活習性相同的稚貝.變態(tài)是貝類發(fā)育過程的關(guān)鍵環(huán)節(jié)，直接影響其種群分布、數(shù)量變動和物種進化［1］.笠貝（Lottiagigantea）隸屬軟體動物門（Mollusca）、腹足綱（Gastropoda）、前鰓亞綱（Prosobranchia）、笠形腹足目（Patellogastropoda）、蓮花青螺科（Lottiidae）（國內(nèi)分類為笠貝科（Acmaeidae）），又名加利福尼亞大戚（California Limpet，Ow l Limpet），主要分布在美國加州北部到加利福尼亞半島南部的太平洋沿岸.其殼長可達9 cm，壽命最長達20年，肉質(zhì)鮮美，營養(yǎng)豐富，是一種重要的海洋經(jīng)濟軟體動物.同其他貝類相比，其基因組比較小，成為研究進化和發(fā)育的重要模式物種［2］.