中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所在高通量簡化測序技術(shù)研究領(lǐng)域獲得突破

“AFSM技術(shù)，是目前為止全世界唯一的可以在全基因組高通量檢測SNVs的同時檢測甲基化位點的方法，具有其它簡化測序無法比擬的優(yōu)勢。”AFSM技術(shù)發(fā)明人、熱帶生物技術(shù)研究所（簡稱生物所）青年科學(xué)家夏志強博士告訴記者。

近日，生物所在高通量簡化測序技術(shù)研究領(lǐng)域獲得突破，種質(zhì)與基因資源研究室夏志強博士發(fā)明了AFSM技術(shù)，能夠提供世界領(lǐng)先的簡化測序和甲基化解決方案，相關(guān)成果已發(fā)表于《Nature》旗下子刊Scientific Reports（Xia et al.， 2015; IF： 5.578），并申請了國家發(fā)明專利（專利號：201410154134.9）。AFSM技術(shù)通過對酶切獲得的AFSM-tag進行高通量測序，能夠降低基因組的復(fù)雜度，操作簡便，同時不受參考基因組的限制，可快速鑒定出高密度的SNVs與甲基化，用于遺傳連鎖圖譜的快速構(gòu)建、QTL定位、自然群體演化與結(jié)構(gòu)分析、全基因組關(guān)聯(lián)GWAS分析和快速進行群體表觀遺傳學(xué)甲基化研究。

相比世界范圍內(nèi)其它高通量簡化測序技術(shù)，它具備五大優(yōu)勢：一是適用對象廣泛，其研究對象有無參考基因組均能適用;二是精確度高，每個Tag 的平均覆蓋深度至少達到5倍，保證分子標(biāo)記的高準(zhǔn)確性;三是性價比高，它基于簡化后的基因組DNA測序，測序和甲基化檢測成本均較低，特別適合大樣本量研究;四是快速高效，只需3-4個月即可完成大樣本的群體研究;五是甲基化檢測優(yōu)勢，能夠在全基因組水平大規(guī)模高通量檢測甲基化。

（摘自中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院院網(wǎng)，2015-09-30）