宋廣超,張 偉,許瑞霞,趙偉利,劉守仁,*,甘尚權(quán)
(1.石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,新疆 石河子 832003;2.新疆農(nóng)墾科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,新疆 石河子 832000)
?
綿羊骨骼肌特異表達(dá)miR-133前體在不同綿羊群體中的多態(tài)檢測(cè)
宋廣超1,2,張 偉1,2,許瑞霞1,2,趙偉利1,2,劉守仁1,2,*,甘尚權(quán)2,*
(1.石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,新疆 石河子 832003;2.新疆農(nóng)墾科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,新疆 石河子 832000)
試驗(yàn)旨在研究骨骼肌中特異表達(dá)miR-133前體在不同綿羊群體中的多態(tài),分析其與綿羊骨骼肌發(fā)育表型的相關(guān)性。采用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)miR-133前體序列在特克賽爾羊、中國(guó)美利奴細(xì)毛羊、阿勒泰羊和湖羊四種不同產(chǎn)肉性能的綿羊群體進(jìn)行了多態(tài)性檢測(cè),并分析多態(tài)性位點(diǎn)對(duì)miR-133前體序列二級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性及加工、成熟的影響。結(jié)果表明,miR-133前體序列下游194 bp(g.54047535)處檢測(cè)到A>G突變,并且該SNP與綿羊的產(chǎn)肉性能存在明顯的相關(guān)性,在特克賽爾羊中GG是優(yōu)勢(shì)基因型, G等位基因頻率高達(dá)0.86,是中國(guó)美利奴細(xì)毛羊群體該位點(diǎn)頻率的4倍。二級(jí)結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,該SNP位點(diǎn)致使miR-133前體的二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯改變,自由能值降低3.2 kJ/mol。以上結(jié)果提示,綿羊miR-133前體序列的SNP(g.54047535)位點(diǎn)可能對(duì)miR-133前體的加工成熟具有重要影響,并最終影響綿羊的產(chǎn)肉性能。
pri-miRNA;pre-miRNA;miR-133;多態(tài)性;骨骼肌;綿羊
miRNA(microRNA)是一類長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸的非編碼RNA,通過調(diào)控其靶基因的表達(dá)水平而發(fā)揮重要的生物學(xué)作用[1]。miRNA的轉(zhuǎn)錄、加工、成熟需要諸多蛋白質(zhì)的參與,在細(xì)胞核中,miRNA先由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄(有少部分是由RNA聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄)產(chǎn)生一個(gè)……