Pseudomonas syringae褐藻膠裂解酶基因的克隆及信息學分析

吳麗云，劉　韓，倪　輝,2,3,4 ,肖安風,2,3,4，蔡慧農,2,3,4，朱艷冰,2,3,4

(1.集美大學食品與生物工程學院，福建 廈門 361021； 2.福建省食品微生物與酶工程重點實驗室，

福建 廈門 361021；3.廈門市食品與生物工程技術研究中心，福建 廈門 361021；

4.廈門市南方海洋研究中心經濟海藻資源化利用與深加工重點實驗室，福建 廈門 361021)

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Pseudomonassyringae褐藻膠裂解酶基因的克隆及信息學分析

吳麗云1，劉韓1，倪輝1,2,3,4,肖安風1,2,3,4，蔡慧農1,2,3,4，朱艷冰1,2,3,4

(1.集美大學食品與生物工程學院，福建 廈門 361021； 2.福建省食品微生物與酶工程重點實驗室，

福建 廈門 361021；3.廈門市食品與生物工程技術研究中心，福建 廈門 361021；

4.廈門市南方海洋研究中心經濟海藻資源化利用與深加工重點實驗室，福建 廈門 361021)

[摘要]以Pseudomonas syringae的基因組為模板，使用褐藻膠裂解酶引物進行PCR擴增，將目的基因克隆至pMD18-T載體后進行測序.結果顯示，克隆基因的大小為1137 bp，預測編碼含有378個氨基酸殘基的蛋白質.對該蛋白質進一步進行生物信息學分析，結果表明，該蛋白質序列與其他菌株來源的褐藻膠裂解酶具有高的相似性，預測本研究克隆的基因編碼褐藻膠裂解酶.該褐藻膠裂解酶的理論分子質量為42.5 ku，理論等電點為8.15.采用同源建模法建立P.syringae褐藻膠裂解酶的三維結構，富含螺旋結構.

[關鍵詞]假單胞菌;褐藻膠裂解酶;克隆;生物信息學

0引言

褐藻膠為主要來源于褐藻類植物細胞壁的結構多糖，它是一種陰離子酸性直鏈多糖，由β-D-甘露糖醛酸(M)和α-L-古羅糖醛酸(G)通過共價鍵隨機結合形成的線性無支鏈的高分……