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玉米抗病相關基因在玉米與玉米絲黑穗病菌、玉米黑粉病菌互作過程中的表達差異分析

2015-01-15 14:22:14鄒曉威王娜劉芬夏蕾王艷麗洪澤源
江蘇農業科學 2014年11期

鄒曉威+王娜+劉芬+夏蕾+王艷麗+洪澤源+徐沖力+鄭巖

摘要:提取玉米絲黑穗病與黑粉病發病葉片的RNA,反轉錄獲得cDNA后,通過玉米抗病相關基因(登錄號分別為:AI881638、AW424529、CF028241、CO526016、CK371597、BM379188、AI649523、CF349132、BM074921、BM349111)的序列設計引物,對玉米抗病相關基因進行RT-PCR擴增,分析目標基因的表達差異。結果顯示,抗病基因病程相關蛋白(BM379188)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酸(AW424529)、無毒性蛋白(AI881638)、富含亮氨酸重復區域蛋白激酶(CF028241)在2種病害發生過程中均呈現上調表達,其他選取基因在侵染玉米葉片中均未檢測到其表達,所選取的抗病相關基因在對照玉米葉片中均未檢測到其表達。

關鍵詞:玉米;玉米絲黑穗病菌;玉米黑粉病菌;抗病基因;互作機制;基因表達

中圖分類號:Q786;S435.131.4文獻標志碼:A文章編號:1002-1302(2014)11-0150-03

玉米絲黑穗病(Sphacelothecareiliana)和玉米黑粉病(Ustilagomaydis)是2種經常發生的玉米真菌性病害,傳統防治方法主要以種子包衣為主,但該方法會造成農民生產成本提高,并對環境產生不良影響,選育和推廣抗病品種是控制玉米絲黑穗病與玉米黑粉病發生的有效措施[1],因此有必要針對病原菌的侵染擴散機理對玉米抗病基因進行深入的研究。玉米絲黑穗病及玉米黑粉病的病原菌都屬于黑粉菌科,其親緣關系較近,在同一寄主上前者是系統性病害,后者是局部性病害。寄主植物在與病原菌互作的過程中,誘導表達的基因往往抑制或促進病原菌繁殖,這些基因的表達產物有直接攻擊病原菌的病程相關蛋白,如病程相關蛋白、幾丁質酶[2-4];有參與調控的轉錄因子,如WRKY蛋白[5-6];同時存在信號級聯放大的蛋白激酶,如絲氨酸-蘇氨酸蛋白激酶等[7-9]。本研究根據前人研究結果[10],選取部分玉米抗病相關基因,分析其在玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌侵染過程中的表達變化,為進一步明確寄主植物玉米與2種病原菌互作過程中的抑制或促進病菌繁殖的機制及抗病育種提供新思路。

1材料與方法

1.1試驗材料

本試驗所用的玉米絲黑穗病菌SR1、SR2菌株及玉米黑粉病菌SG200菌株均為玉米與真菌互作實驗室保存菌種。供試玉米品種為吉單209。

1.2試驗方法

1.2.1接種菌液的制備從凍存管內取SR1、SR2菌株菌液至3mL的酵母浸出粉胨葡萄糖培養基(yeastextractpeptonedextrosemedium,YPD),以及SG200菌株菌液至3mL的YEPS培養基內,28℃振蕩培養進行菌株活化,再分別從活化的菌液內取500μL菌液至100mLYPD、YEPS培養基內,28℃振蕩培養12~16h,至菌液的D600nm值達到2.0。菌液離心后收集菌體,加適量滅菌純水溶解,SR1、SR2菌液進行混合后與SG200菌株菌液置于常溫下,用于下一步的接種試驗。

1.2.2玉米植株的準備挑選玉米品種吉單209的飽滿種子,用5%次氯酸鈉溶液表面消毒3~5min后,用無菌水沖洗3次,28℃下放置在無菌水中侵泡5h;濾紙經過無菌純水浸泡后平鋪于無菌培養皿底部,將浸泡后的玉米種子轉移到培養皿中的濾紙上,然后將培養皿放入光照培養箱內,在28℃條件下進行暗培養直至種子出芽;將出芽的種子播種于15cm塑料花盆中,每盆5粒。播種后的花盆放入光照培養箱內,在28℃條件下進行培養。

1.2.3玉米植株的病菌侵染種子出土的2張葉片完全展開時,使用“1.2.1”節方法制備的玉米絲黑穗病菌菌液對玉米植株進行注射接種;待種子出土的3張葉完全展開,進行玉米黑粉病菌注射接種;預留未接種玉米植株作為對照。注射接種玉米絲黑穗病菌2~3d后,玉米葉片會出現明顯的褪綠病斑,取發病葉片于液氮中進行速凍后,置于-80℃冰箱中備用;注射接種玉米黑粉病菌3~5d后,玉米葉片出現明顯腫瘤,切取腫瘤組織于液氮中進行速凍后,置于-80℃冰箱中備用。同時割取對照植株葉片于液氮中進行速凍,置于-80℃冰箱內備用。

1.2.4玉米發病葉片RNA提取分別取保存于-80℃冰箱內的發病葉片提取葉片組織中的RNA,操作方法如下:(1)收集1g發病玉米葉片在液氮中冷凍(冷凍后可放入-80℃冰箱長期保存);(2)將葉片放入研缽中,加液氮后進行快速研磨2~3次,至葉片組織成粉末狀;(3)收集粉末,放入30mL離心管中,加10mLTrizol后渦旋混勻;(4)室溫下放置15min,再加入2mL氯仿,渦旋10s混勻;(5)室溫下放置3min后,于4℃、3500r/min離心15min;(6)收集上清液轉入到新離心管中,加入等體積的酚氯仿(苯酚和氯仿體積比為1∶1,pH值為8.0),渦旋10s混勻后,于4℃、3500r/min離心10min;(7)收集上清液轉入新離心管中,加入5mL的異丙醇,上下顛倒混勻,冰上靜置10min后,于4℃、9000r/min離心20min;(8)去除上清液后,加80μLRNAfreeH2O,放入-80℃冰箱保存待用。

1.2.5RNA反轉錄成cDNA首先用DNaseI、RNase-free酶消解RNA中的DNA,制備不含DNA的RNA。操作方法見使用說明書;然后選用全式金反轉錄試劑盒進行RNA反轉錄,形成cDNA;運用Nanodrop2000微量紫外分光光度計測定cDNA的濃度,將所有cDNA調至相同濃度。

1.2.6RT-PCR選取的抗病相關基因的登錄號分別為AI881638、AW424529、CF028241、CO526016、CK371597、BM379188、AI649523、CF349132、BM074921、BM349111、Actin(gi121211756)(表1),以基因登錄號代表相關基因。根據抗病相關基因片段設計上下游引物(表2)。

分別以玉米絲黑穗病發病植株葉片組織中的cDNA、玉米黑粉病發病植株葉片腫瘤中的cDNA、未發病對照植株葉片組織中的cDNA為模板,對目標基因進行RT-PCR擴增。采用梯度PCR設置不同的退火溫度,RT-PCR擴增條件為:95℃預變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環;72℃10min。內參對照為Actin基因。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測抗病基因的信號強度。

2結果與分析

2.1RNA檢測

樣品總RNA檢測結果表明,感染玉米絲黑穗病菌發病葉

片的RNA濃度為10525.3ng/μL,感染玉米黑粉病菌發病葉片的RNA濃度為9623.4ng/μL,純度均較高。利用電泳檢測RNA的完整性和質量,結果顯示沒有明顯的拖尾現象(圖1),說明提取的RNA質量較好,沒有發生降解,可以用于后續試驗。

2.2RT-PCR擴增檢測

RT-PCR擴增結果顯示,內參在對照植株葉片及發病植株葉片中均能正常表達,結果可信。所選取的抗病相關基因在對照植株葉片中均未見表達,玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中抗病相關基因AI881638、AW424529、CF028241、BM379188均呈上調表達。而選取的其他抗病相關基因CO526016、CK371597、AI649523、CF349132、BM074921、BM349111在感染玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中均未見表達(圖2)。

3結論與討論

寄主植物與病原菌互作過程往往誘導許多基因的表達,其中包括轉錄調控因子、蛋白激酶及病程相關蛋白等[11],這些基因的表達往往抑制或促進病原菌的繁殖。本研究結果顯示,玉米感病品種吉單209在受到玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌侵染后,病程相關蛋白BM379188(PR1)、AI881638(avirulence-responsiveprotein)均上調表達,其中病程相關蛋白是植物防衛反應中的重要因子,在植物中廣泛存在,PR1與無毒性病菌誘導蛋白在植物系統獲得抗性中起到重要的作用,它們是植物受病原侵染或其他因子脅迫產生的誘導性蛋白,在抑制病原菌的繁殖過程中發揮作用[12-14]。基因CF028241、AW424529均上調表達,蛋白激酶通過氧化磷酸開啟信號的級聯放大作用,因此蛋白激酶結構的蛋白在2種病菌互作的過程中起到重要的作用;而絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶結構在許多已經克隆的抗病蛋白中存在,可能在抑制2種病菌繁殖的過程中發揮作用[7-9]。本試驗中選取的幾丁質酶基因在接種與未接種玉米絲黑穗病病菌及黑粉病病菌的葉片中均未表達,說明該幾丁質酶并未參與抑制2種病菌在玉米體內的繁殖。研究中未檢測到WRKY蛋白的表達,說明WRKY蛋白并未參與促進2種病菌在玉米體內的繁殖。試驗結果顯示玉米與玉米絲黑穗菌及玉米黑粉菌的互作機制有相似之處,誘導表達的基因抑制或促進菌絲生長的機制相近。

參考文獻:

[1]邢躍先,吳鳳新,李姝睿,等.抗玉米絲黑穗病分子標記輔助育種研究[J].玉米科學,2012,20(6):9-13.

[2]AgrawalGK,JwaNS,RakwalR.Anovelrice(OryzasativaL.)acidicPR1genehighlyresponsivetocut,phytohormones,andproteinphosphataseinhibitors[J].BiochemicalandBiophysicalResearchCommunications,2000,274(1):157-165.

[3]許明輝,唐祚舜,譚亞玲,等.幾丁質酶-葡聚糖酶雙價基因導入滇型雜交稻恢復系提高稻瘟病抗性的研究[J].遺傳學報,2003,30(4):330-334.

[4]SharafAN,AbdelkaderHS,AbdEI-HadiAA,etal.Overexpressionofricechitinasegene:evaluationofchitinaseabilityasabio-antifungalagent[J].ArabJournalofBiotechnology,2009,12(1):85-98.

[5]WeiT,OuB,LiJB,etal.TranscriptionalprofilingofriceearlyresponsetoMagnaportheoryzaeidentifiedOsWRKYsasimportantregulatorsinriceblastresistance[J].PLoSOne,2013,8(3):e59720.

[6]ChujoT,MiyamotoK,OgawaS,etal.OverexpressionofphosphomimicmutatedOsWRKY53leadstoenhancedblastresistancerice[J].PLoSOne,2014,9(6):e98737.

[7]SongWY,WangGL,ChenLL,etal.Areceptorkinase-likeproteinencodedbythericediseaseresistancegene,Xa21[J].Science,1995,270(5243):1804-1806.

[8]FeuilletC,SchachermayrG,KellerB.Molecularcloningofanewreceptor-likekinasegeneencodedattheLr10diseaseresistancelocusofwheat[J].ThePlantJournal,1997,11(1):45-52.

[9]MartinGB,BrommonschenkelSH,ChunwongseJ,etal.Map-basedcloningofaproteinkinasegeneconferringdiseaseresistanceintomato[J].Science,1993,262(5138):1432-1436.

[10]袁廣勝.玉米抗穗粒腐病差異表達基因的分離及其功能分析[D].雅安:四川農業大學,2011:1-147.

[11]姜兆遠,任金平,劉曉梅,等.水稻與稻瘟病菌不同小種互作的基因差異表達譜分析[J].中國農業科學,2013,46(24):5123-5131.

[12]NazR,BanoA,WilsonNL,etal.Pathogenesis-relatedproteinexpressionintheapoplastofwheatleavesprotectedagainstleafrustfollowingapplicationofplantextracts[J].Phytopathology,2014,104(9):933-944.

[13]周益軍,李碩,程兆榜,等.中國水稻條紋葉枯病研究進展[J].江蘇農業學報,2012,28(5):1007-1015.

[14]HwangIS,ChoiDS,KimNH,etal.Pathogenesis-relatedprotein4binteractswithleucine-richrepeatprotein1tosuppressPR4b-triggeredcelldeathanddefenseresponseinpepper[J].ThePlantJournal,2014,77(4):521-533.

[15]GabrilsSH,VossenJH,EkengrenSK,etal.AnNB-LRRproteinrequiredforHRsignallingmediatedbybothextra-andintracellularresistanceproteins[J].ThePlantJournal,2007,50(1):14-28.

分別以玉米絲黑穗病發病植株葉片組織中的cDNA、玉米黑粉病發病植株葉片腫瘤中的cDNA、未發病對照植株葉片組織中的cDNA為模板,對目標基因進行RT-PCR擴增。采用梯度PCR設置不同的退火溫度,RT-PCR擴增條件為:95℃預變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環;72℃10min。內參對照為Actin基因。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測抗病基因的信號強度。

2結果與分析

2.1RNA檢測

樣品總RNA檢測結果表明,感染玉米絲黑穗病菌發病葉

片的RNA濃度為10525.3ng/μL,感染玉米黑粉病菌發病葉片的RNA濃度為9623.4ng/μL,純度均較高。利用電泳檢測RNA的完整性和質量,結果顯示沒有明顯的拖尾現象(圖1),說明提取的RNA質量較好,沒有發生降解,可以用于后續試驗。

2.2RT-PCR擴增檢測

RT-PCR擴增結果顯示,內參在對照植株葉片及發病植株葉片中均能正常表達,結果可信。所選取的抗病相關基因在對照植株葉片中均未見表達,玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中抗病相關基因AI881638、AW424529、CF028241、BM379188均呈上調表達。而選取的其他抗病相關基因CO526016、CK371597、AI649523、CF349132、BM074921、BM349111在感染玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中均未見表達(圖2)。

3結論與討論

寄主植物與病原菌互作過程往往誘導許多基因的表達,其中包括轉錄調控因子、蛋白激酶及病程相關蛋白等[11],這些基因的表達往往抑制或促進病原菌的繁殖。本研究結果顯示,玉米感病品種吉單209在受到玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌侵染后,病程相關蛋白BM379188(PR1)、AI881638(avirulence-responsiveprotein)均上調表達,其中病程相關蛋白是植物防衛反應中的重要因子,在植物中廣泛存在,PR1與無毒性病菌誘導蛋白在植物系統獲得抗性中起到重要的作用,它們是植物受病原侵染或其他因子脅迫產生的誘導性蛋白,在抑制病原菌的繁殖過程中發揮作用[12-14]。基因CF028241、AW424529均上調表達,蛋白激酶通過氧化磷酸開啟信號的級聯放大作用,因此蛋白激酶結構的蛋白在2種病菌互作的過程中起到重要的作用;而絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶結構在許多已經克隆的抗病蛋白中存在,可能在抑制2種病菌繁殖的過程中發揮作用[7-9]。本試驗中選取的幾丁質酶基因在接種與未接種玉米絲黑穗病病菌及黑粉病病菌的葉片中均未表達,說明該幾丁質酶并未參與抑制2種病菌在玉米體內的繁殖。研究中未檢測到WRKY蛋白的表達,說明WRKY蛋白并未參與促進2種病菌在玉米體內的繁殖。試驗結果顯示玉米與玉米絲黑穗菌及玉米黑粉菌的互作機制有相似之處,誘導表達的基因抑制或促進菌絲生長的機制相近。

參考文獻:

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[3]許明輝,唐祚舜,譚亞玲,等.幾丁質酶-葡聚糖酶雙價基因導入滇型雜交稻恢復系提高稻瘟病抗性的研究[J].遺傳學報,2003,30(4):330-334.

[4]SharafAN,AbdelkaderHS,AbdEI-HadiAA,etal.Overexpressionofricechitinasegene:evaluationofchitinaseabilityasabio-antifungalagent[J].ArabJournalofBiotechnology,2009,12(1):85-98.

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[6]ChujoT,MiyamotoK,OgawaS,etal.OverexpressionofphosphomimicmutatedOsWRKY53leadstoenhancedblastresistancerice[J].PLoSOne,2014,9(6):e98737.

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[9]MartinGB,BrommonschenkelSH,ChunwongseJ,etal.Map-basedcloningofaproteinkinasegeneconferringdiseaseresistanceintomato[J].Science,1993,262(5138):1432-1436.

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[12]NazR,BanoA,WilsonNL,etal.Pathogenesis-relatedproteinexpressionintheapoplastofwheatleavesprotectedagainstleafrustfollowingapplicationofplantextracts[J].Phytopathology,2014,104(9):933-944.

[13]周益軍,李碩,程兆榜,等.中國水稻條紋葉枯病研究進展[J].江蘇農業學報,2012,28(5):1007-1015.

[14]HwangIS,ChoiDS,KimNH,etal.Pathogenesis-relatedprotein4binteractswithleucine-richrepeatprotein1tosuppressPR4b-triggeredcelldeathanddefenseresponseinpepper[J].ThePlantJournal,2014,77(4):521-533.

[15]GabrilsSH,VossenJH,EkengrenSK,etal.AnNB-LRRproteinrequiredforHRsignallingmediatedbybothextra-andintracellularresistanceproteins[J].ThePlantJournal,2007,50(1):14-28.

分別以玉米絲黑穗病發病植株葉片組織中的cDNA、玉米黑粉病發病植株葉片腫瘤中的cDNA、未發病對照植株葉片組織中的cDNA為模板,對目標基因進行RT-PCR擴增。采用梯度PCR設置不同的退火溫度,RT-PCR擴增條件為:95℃預變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環;72℃10min。內參對照為Actin基因。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測抗病基因的信號強度。

2結果與分析

2.1RNA檢測

樣品總RNA檢測結果表明,感染玉米絲黑穗病菌發病葉

片的RNA濃度為10525.3ng/μL,感染玉米黑粉病菌發病葉片的RNA濃度為9623.4ng/μL,純度均較高。利用電泳檢測RNA的完整性和質量,結果顯示沒有明顯的拖尾現象(圖1),說明提取的RNA質量較好,沒有發生降解,可以用于后續試驗。

2.2RT-PCR擴增檢測

RT-PCR擴增結果顯示,內參在對照植株葉片及發病植株葉片中均能正常表達,結果可信。所選取的抗病相關基因在對照植株葉片中均未見表達,玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中抗病相關基因AI881638、AW424529、CF028241、BM379188均呈上調表達。而選取的其他抗病相關基因CO526016、CK371597、AI649523、CF349132、BM074921、BM349111在感染玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌發病葉片中均未見表達(圖2)。

3結論與討論

寄主植物與病原菌互作過程往往誘導許多基因的表達,其中包括轉錄調控因子、蛋白激酶及病程相關蛋白等[11],這些基因的表達往往抑制或促進病原菌的繁殖。本研究結果顯示,玉米感病品種吉單209在受到玉米絲黑穗病菌及玉米黑粉病菌侵染后,病程相關蛋白BM379188(PR1)、AI881638(avirulence-responsiveprotein)均上調表達,其中病程相關蛋白是植物防衛反應中的重要因子,在植物中廣泛存在,PR1與無毒性病菌誘導蛋白在植物系統獲得抗性中起到重要的作用,它們是植物受病原侵染或其他因子脅迫產生的誘導性蛋白,在抑制病原菌的繁殖過程中發揮作用[12-14]。基因CF028241、AW424529均上調表達,蛋白激酶通過氧化磷酸開啟信號的級聯放大作用,因此蛋白激酶結構的蛋白在2種病菌互作的過程中起到重要的作用;而絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶結構在許多已經克隆的抗病蛋白中存在,可能在抑制2種病菌繁殖的過程中發揮作用[7-9]。本試驗中選取的幾丁質酶基因在接種與未接種玉米絲黑穗病病菌及黑粉病病菌的葉片中均未表達,說明該幾丁質酶并未參與抑制2種病菌在玉米體內的繁殖。研究中未檢測到WRKY蛋白的表達,說明WRKY蛋白并未參與促進2種病菌在玉米體內的繁殖。試驗結果顯示玉米與玉米絲黑穗菌及玉米黑粉菌的互作機制有相似之處,誘導表達的基因抑制或促進菌絲生長的機制相近。

參考文獻:

[1]邢躍先,吳鳳新,李姝睿,等.抗玉米絲黑穗病分子標記輔助育種研究[J].玉米科學,2012,20(6):9-13.

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[4]SharafAN,AbdelkaderHS,AbdEI-HadiAA,etal.Overexpressionofricechitinasegene:evaluationofchitinaseabilityasabio-antifungalagent[J].ArabJournalofBiotechnology,2009,12(1):85-98.

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[6]ChujoT,MiyamotoK,OgawaS,etal.OverexpressionofphosphomimicmutatedOsWRKY53leadstoenhancedblastresistancerice[J].PLoSOne,2014,9(6):e98737.

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[8]FeuilletC,SchachermayrG,KellerB.Molecularcloningofanewreceptor-likekinasegeneencodedattheLr10diseaseresistancelocusofwheat[J].ThePlantJournal,1997,11(1):45-52.

[9]MartinGB,BrommonschenkelSH,ChunwongseJ,etal.Map-basedcloningofaproteinkinasegeneconferringdiseaseresistanceintomato[J].Science,1993,262(5138):1432-1436.

[10]袁廣勝.玉米抗穗粒腐病差異表達基因的分離及其功能分析[D].雅安:四川農業大學,2011:1-147.

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[12]NazR,BanoA,WilsonNL,etal.Pathogenesis-relatedproteinexpressionintheapoplastofwheatleavesprotectedagainstleafrustfollowingapplicationofplantextracts[J].Phytopathology,2014,104(9):933-944.

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