徐鑫,王茜茜,王曉蕊,薛亞婷,烏日娜
(沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,遼寧沈陽(yáng),110866)
大醬是以大豆為主要原材料,利用米曲霉、酵母菌、乳酸菌等微生物,經(jīng)過(guò)幾個(gè)月的自然發(fā)酵,最終形成的半流動(dòng)狀態(tài)的發(fā)酵性食品[1]。大醬又稱(chēng)黃豆醬、大豆醬、黃醬,我國(guó)北方地區(qū)稱(chēng)大醬。其色澤為紅褐色或棕褐色,鮮艷,有光澤;有明顯的醬香和醋香,咸淡適口,呈黏稠適度的半流動(dòng)狀態(tài)。豆醬不僅可以作為調(diào)味品,而且富含豐富的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。由于經(jīng)過(guò)發(fā)酵,所以極易被人體吸收。事實(shí)上,它不單是一種調(diào)味品,而且是一種副食品,在人們的日常飲食中占有重要地位,尤其在東北地區(qū),是一種深受廣大人民歡迎的傳統(tǒng)型發(fā)酵食品。大豆醬的風(fēng)味非常獨(dú)特,其風(fēng)味的形成主要是由發(fā)酵過(guò)程中微生物的生物化學(xué)反應(yīng)引起的,與風(fēng)味形成有關(guān)的微生物群落主要是酵母菌和乳酸菌。
乳酸菌(lactic acid bacteria)是一類(lèi)革蘭氏陽(yáng)性,過(guò)氧化氫酶反應(yīng)陰性的桿菌或球菌,它不形成芽孢、不運(yùn)動(dòng),能發(fā)酵碳水化合物產(chǎn)生50%以上乳酸的一類(lèi)細(xì)菌的總稱(chēng)[2]。基于形態(tài)學(xué)、不同生長(zhǎng)溫度、葡萄糖發(fā)酵方式、產(chǎn)生乳酸的構(gòu)型、酸或堿的耐受性以及高鹽濃度下的生長(zhǎng)能力對(duì)乳酸菌菌屬進(jìn)行分類(lèi)。目前,乳酸菌在分類(lèi)學(xué)上大致可以分為23個(gè)屬,包括乳桿菌屬(Lactobacillus)、乳球菌屬(Lactococcus)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、腸球菌屬(Enterococcus)、肉食桿菌屬(Carnobacterium)、鏈球菌屬(Streptococcus)、明串珠菌屬(Leuconostoc)、氣球菌屬(Aerococcus),片球菌屬(Pediococcus)、漫游球菌屬(Vagococcus)、奇異菌屬(Atopobium)、李斯特氏菌屬(Listeria)、真絲菌屬(Eubacterium)、芽孢桿菌屬(Bacillus)中的少數(shù)種、芽孢乳桿菌屬(Sporolactobacillus)、丹毒絲菌屬(Erysipelothrix)、四聯(lián)球菌屬(Tetragenococcus)、環(huán)絲菌屬(Brochothix)、魏斯氏菌屬(Weissella)、糖球菌屬(Saccharococcus)、孿生菌屬(Gemella)、酒球菌屬(Oenococcus)、營(yíng)養(yǎng)缺陷菌屬(Abiotrophia)[3]。
乳酸菌不僅有利于食品發(fā)酵,改善風(fēng)味,提高營(yíng)養(yǎng)價(jià)值等功能,而且其作為存在人體內(nèi)的益生菌,還能對(duì)人體的生理功能起到有益的調(diào)節(jié)作用[4]。近年來(lái)對(duì)乳酸菌的研究表明,乳酸菌有很多特殊的保健功能,如改善腸道功能、產(chǎn)細(xì)菌素、抗腫瘤、增強(qiáng)免疫力、抗氧化能力、降低膽固醇、產(chǎn)生相關(guān)酶類(lèi)等有益功能。
乳酸菌發(fā)酵食品是一種國(guó)內(nèi)外消費(fèi)者喜愛(ài)的營(yíng)養(yǎng)保健食品。發(fā)酵大醬用的生產(chǎn)菌株是乳酸菌,大醬中含有較高濃度的鹽,在生產(chǎn)過(guò)程中乳酸菌的生長(zhǎng)會(huì)受到鹽濃度的影響而受到抑制。篩選出專(zhuān)用于發(fā)酵大醬的乳酸菌種對(duì)于在發(fā)酵大醬生產(chǎn)中縮短生產(chǎn)周期、提高食品安全性和穩(wěn)定產(chǎn)品質(zhì)量起著關(guān)鍵性的作用。
本實(shí)驗(yàn)旨在從農(nóng)家大醬中篩選出耐鹽性較好的乳酸菌菌株,并采用16S rDNA的方法對(duì)該菌株進(jìn)行鑒定,意在實(shí)現(xiàn)農(nóng)家大醬的安全化、工業(yè)化生產(chǎn),并為構(gòu)建東北地區(qū)乳酸菌菌種資源庫(kù)做出貢獻(xiàn)。
1.1.1 樣品
農(nóng)家大醬:采自遼寧沈陽(yáng)、大連、撫順,本溪共15個(gè)樣品。
1.1.2 培養(yǎng)基與試劑配制
MRS培養(yǎng)基配方:葡萄糖20.0 g/L,MnSO4·4H2O 0.25 g/L,牛肉浸膏8 g/L,MgSO4·7H2O 0.58 g/L,蛋白胨8 g/L,吐溫·80 1 g/L,酵母粉4 g/L,檸檬酸鈉2 g/L,三水乙酸鈉5 g/L,K2HPO42 g/L,臨用前添加1%CaCO3,121℃高壓滅菌20 min。
10×TE緩沖液:1 mol/L Tris-HCl Buffer(PH:7.4、7.6、8.0)100 mL,0.5 mol/L 的 EDTA 20 mL(pH:8.0),定容 1L,121℃、20 min 滅菌備用。
1 mol/L Tris-HCL(pH 8.0):稱(chēng)取121.1g Tris溶于800 mL無(wú)菌水中,加濃HCl調(diào)pH到8.0,定容至1L,高壓滅菌。
0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)186.1g EDTA-Na·2H2O溶于800 mL無(wú)菌水中,需用磁力攪拌器劇烈攪動(dòng),用NaOH調(diào)pH值到8.0(約20g),定容至1L,高壓滅菌。
10%SDS:稱(chēng)取SDS 10g于100~200 mL燒杯中,加80 mL雙蒸水中60℃加熱溶解,用 HCl調(diào) pH至7.2,定容至100 mL,室溫保存。滅菌10 mol/L CTAB(十六烷基三甲基溴化銨):10g CTAB溶于80 mL無(wú)菌水中,定容至100 mL,高壓滅菌。
0.7 mol/L NaCl:4.095 g NaCl溶于80 mL無(wú)菌水中,定容100 mL,高壓滅菌。
酚、氯仿、異戊醇:Tris-飽和酚從4℃冰箱中取出,上層為保護(hù)液,取下層黃色酚相使用。按比例與氯仿、異戊醇混合,放入4℃冰箱存放。
1.1.3 儀器與設(shè)備
LDZX-50KBS型立式壓力蒸汽滅菌鍋,上海申安醫(yī)療器械廠(chǎng);UV-4802紫外可見(jiàn)分光光度計(jì),尤尼柯(上海)儀器有限公司;生物潔凈工作臺(tái),蘇州市華宇凈化設(shè)備有限公司;Centrifuge 5418R小型臺(tái)式冷凍離心機(jī),(德國(guó))Eppendorf;DNP-9080型生化培養(yǎng)箱、恒溫水浴鍋,上海精宏試驗(yàn)儀器有限公司;VS-1型渦旋儀,上海瀘西分析儀器廠(chǎng)有限公司;尼康生物顯微鏡,南京江南光電(集團(tuán))股份有限公司;ND-100型微量紫外分光光度計(jì),上海美析儀器有限公司;DW-86L486型超低溫保存箱,青島海爾特種電器有限公司;CDS8000型UPV凝膠成像分析系統(tǒng)、PTC-200型梯度基因擴(kuò)增儀、電泳儀,美國(guó)伯樂(lè)公司。
1.2.1 農(nóng)家大醬的采樣
將農(nóng)民家庭以傳統(tǒng)方法制作的大醬,在其發(fā)酵容器中充分?jǐn)嚢韬螅?0g左右大醬加入封口袋中封存,將收集的樣品放入提前準(zhǔn)備好的冰盒內(nèi)冷卻,間隔一段時(shí)間需要更換一次冰袋,使大醬保存在較低溫度狀態(tài)下帶回實(shí)驗(yàn)室,然后放入 -20℃冰箱凍存,盡快進(jìn)行乳酸菌的分離,防止菌體死亡。
1.2.2 乳酸菌的分離純化
稱(chēng)取1 g大醬樣品,加入含有10 mL生理鹽水的滅菌試管中,按照10倍梯度稀釋法稀釋大醬樣品至10-8g/mL。分別取 10-6g/mL、10-7g/mL、10-8g/mL 3個(gè)梯度樣品100 μL,采用涂布法將樣品接種于MRS瓊脂培養(yǎng)基上,將培養(yǎng)皿放入BBL厭氧培養(yǎng)罐中,在罐中加入保險(xiǎn)粉以除去氧氣。分別將培養(yǎng)罐置于20、30、37℃ 3個(gè)梯度的培養(yǎng)箱中厭氧培養(yǎng)48h。待菌落形成后,用接種環(huán)挑取疑似乳酸菌菌落形態(tài)的單個(gè)菌落,接種于 MRS液體培養(yǎng)基中,置于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h。對(duì)菌體采用平板劃線(xiàn)法進(jìn)行純化,仔細(xì)觀察菌落形態(tài)以及革蘭氏染色后的細(xì)胞形態(tài)特征,在顯微鏡油鏡下挑選視野清晰且形態(tài)典型的菌體,進(jìn)行拍照記錄,并同時(shí)進(jìn)行過(guò)氧化氫酶試驗(yàn)。凡是革蘭氏染色呈陽(yáng)性、過(guò)氧化氫酶試驗(yàn)為陰性的菌株,均暫定為乳酸菌,并進(jìn)一步培養(yǎng)穿刺保存。
1.2.3 耐鹽性乳酸菌篩選
將初步鑒定得到的疑似乳酸菌保存菌株用接種針挑去部分菌體,接種于5 mL已滅菌的MRS培養(yǎng)基中,于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,作為活化1代菌。用移液槍吸取200 μL一代菌接種于5 mL已滅菌的MRS培養(yǎng)基中,于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,作為活化2代菌。以此方法將菌株活化至3代,第3代培養(yǎng)12 h,此時(shí)菌株的活性最好。吸取混勻后的3代菌液100 μL分別加入 5 mL NaCl濃度分別為 4%、6%、8%、10%、14%、16%、20%的 MRS液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24h。培養(yǎng)液用渦旋儀混勻后,以空白MRS液體培養(yǎng)基調(diào)零,在波長(zhǎng)600 nm處,測(cè)OD值。
1.2.4 乳酸菌的生理生化鑒定
取革蘭氏陽(yáng)性和過(guò)氧化氫酶陰性菌落按照東秀珠、蔡妙英[5]的常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)方法,對(duì)菌株進(jìn)行生理生化試驗(yàn)。
1.2.5 分離株的保存
采用真空冷凍干燥法[6]對(duì)菌體進(jìn)行凍干保存。
1.2.6 供試菌液的制備
將采用真空冷凍干燥法凍干保存的菌種,接種于MRS液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24 h,活化3代。經(jīng)革蘭氏染色鏡檢確定為純菌后,取第3代MRS液體培養(yǎng)物,12 000 r/min離心10 min,棄掉上清液,在沉淀中加入5 mL滅菌生理鹽水,12 000 r/min、10 min(4℃)離心洗滌菌體,重復(fù)離心洗滌菌體2次。最后加入5 mL滅菌生理鹽水,用渦旋儀振蕩混勻,即為供試菌液。
1.2.7 總DNA的提取
采用優(yōu)化后的CTAB法[7]提取DNA。
1.2.8 乳酸菌基因組DNA純度檢測(cè)
分別取1 μL上述制備的乳酸菌基因組DNA原液,用ND-1000型微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)乳酸菌基因組DNA的濃度以及在吸光度為260、280時(shí)的OD值。
1.3.1 擴(kuò)增引物
16S rDNA擴(kuò)增引物采用通用引物[8-9],正向引物為27f(對(duì)應(yīng)于Escherichia coli 8-27位堿基):5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3';反向引物為 1495r(對(duì)應(yīng)于 Escherichia coli 1495-1515位堿基):5'-GGCTGCTGGCACGTAGTTAG-3',由上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司合成。PCR擴(kuò)增片段約為1 500 bp。
1.3.2 擴(kuò)增體系以及循環(huán)參數(shù)
將上述制備的基因組 DNA作為PCR擴(kuò)增的模板,采用20μL反應(yīng)體系(表1)進(jìn)行 PCR擴(kuò)增。
PCR反應(yīng)條件為:95℃ 預(yù)變性5 min;95℃ 變性30 s,55℃ 退火 30 s,72℃ 延伸 1 min 30 s,循環(huán) 24次;72℃ 末端延伸10 min;10℃ 保溫。
1.3.3 PCR產(chǎn)物檢測(cè)
預(yù)先制備1.0%的瓊脂糖凝膠(含溴化乙錠),擴(kuò)增反應(yīng)完畢后,取5 μL的 PCR產(chǎn)物與 1μL Loading buffer混合,將樣品加樣于瓊脂糖凝膠點(diǎn)樣孔中進(jìn)行電泳,電壓5 V/cm,電泳液為1×TAE。大約20 min后,電泳結(jié)束,紫外燈下觀察。如果 PCR成功,則可見(jiàn)到約為1 500 bp的條帶。
1.3.4 16S rDNA序列測(cè)定及分析
將擴(kuò)增成功的PCR產(chǎn)物用保溫盒(內(nèi)含冰袋)寄到上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司測(cè)序,測(cè)得菌株16S rDNA基因序列后,將基因序列在NCBI上使用BLAST進(jìn)行同源性比對(duì),同時(shí)從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得公認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)序列數(shù)據(jù),并用MAGE軟件包以Neighbor Join法制作系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[10]。

表1 PCR擴(kuò)增體系Table 1 PCR amplification system
2.1.1 農(nóng)家大醬篩選后的菌落形態(tài)觀察結(jié)果
從15個(gè)樣品中分離獲得典型的菌株62株,從沈陽(yáng)大醬樣品中篩選出14株菌株,按照大醬采集地編號(hào)為SY1~SY14;從大連大醬樣品中篩選出16株菌株,按照大醬采集地編號(hào)為DL1~DL16;從撫順大醬樣品中篩選出15株菌株,按照大醬采集地編號(hào)為FS1~FS15;從本溪大醬樣品中篩選出17株菌株,按照大醬采集地編號(hào)為BX1~BX14。菌株在MRS固體培養(yǎng)基上,為白色或乳白色,圓形菌落,表面光滑有光澤,中間凸起,邊緣整齊,如圖1所示。

圖1 5株乳酸菌菌落形態(tài)學(xué)特征Fig.1 Colony morphological characteristics of 5 LAB strains
2.1.2 農(nóng)家大醬中乳酸菌初步鑒定結(jié)果
對(duì)從農(nóng)家大醬中分離得到的62株疑似乳酸菌菌株進(jìn)行純化,對(duì)純化后菌株進(jìn)行革蘭氏染色。顯微鏡油鏡下觀察顯示,在這些菌株中有革蘭氏陽(yáng)性菌36株,包括球狀菌株16株,桿狀菌株20株。結(jié)果如圖2所示。

圖2 5株乳酸菌株的革蘭氏染色菌體形態(tài)Fig.2 Morphology after gram stain of 5 LAB strains
對(duì)36株革蘭氏陽(yáng)性菌進(jìn)行過(guò)氧化氫酶試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)10株疑似乳酸菌呈陽(yáng)性反應(yīng),另外有26株為陰性反應(yīng)。通過(guò)革蘭氏染色和過(guò)氧化氫酶試驗(yàn)從62株疑似乳酸菌株中獲得革蘭氏陽(yáng)性、過(guò)氧化氫酶陰性的菌株26株,結(jié)果見(jiàn)表2。

表2 從農(nóng)家大醬中分離得到的菌株初步鑒定結(jié)果Table 2 Preliminary identification result of the isolated strains from soybean paste
2.1.3 耐鹽性乳酸菌的篩選
在大醬發(fā)酵過(guò)程中,NaCl含量在8%左右。高濃度的NaCl能夠抑制某些致病和腐敗微生物的生長(zhǎng)繁殖,但也會(huì)對(duì)乳酸菌的代謝活動(dòng)產(chǎn)生影響[11]。乳酸菌的生長(zhǎng)受到抑制,對(duì)最終大醬質(zhì)量有很大影響,所以耐鹽的乳酸菌對(duì)大醬品質(zhì)的好壞起著決定性作用[12]。文中對(duì)篩選出的26株疑似乳酸菌在不同 鹽濃度的MRS液體培養(yǎng)基中生長(zhǎng)狀況進(jìn)行研究分析,同時(shí)以吸光值變化作為菌株的生長(zhǎng)指標(biāo),研究其對(duì)不同 NaCl濃度的耐受能力,結(jié)果見(jiàn)表3。

表3 26株乳酸菌株在不同NaCl濃度下生長(zhǎng)情況Table 3 Growth situation of 26 LAB strains under different concentration of NaCl
由表3中數(shù)據(jù)可以看出,隨著培養(yǎng)基中 NaCl濃度不斷升高,26株乳酸菌的OD600值在逐漸變小。在NaCl濃度為4% 的MRS培養(yǎng)基中,26株乳酸菌基本不受影響,生長(zhǎng)狀況良好,OD600值在 0.921~2.176之間;NaCl濃度為6%的MRS培養(yǎng)基中,部分菌株生長(zhǎng)狀況受到影響,OD600值在0.312~1.584之間;當(dāng)NaCl濃度上升到8%時(shí),大部分乳酸菌的生長(zhǎng)受到了抑制,其中菌株 SY1-1、SY3-5、SY4-2、DL3-1、DL3-6、DL4-5、FS1-11、FS2-3、FS5-5 的 OD600值相對(duì)較高,表明這7株菌有一定的耐受能力;當(dāng) NaCl濃度為10%時(shí),只有菌株 SY4-2、DL3-1、DL4-5、FS1-11、FS5-5的 OD600值在0.195以上,依然可以生長(zhǎng);當(dāng) NaCl濃度增加到12%時(shí)26株乳酸菌OD600值降低較為明顯,菌株 SY4-2、DL3-1、DL4-5、FS1-11、FS5-5 的 OD600值在0.100左右;當(dāng) NaCl濃度上升到14% ~20%時(shí),26株乳酸菌生長(zhǎng) OD600值一直維持在0.030~0.060之間,考慮到接種的影響,我們可以初步斷定26株菌幾乎不生長(zhǎng)。因此,篩選得到5株具有較高耐鹽能力的乳酸菌,即菌株 SY4-2、DL3-1、DL4-5、FS1-11、FS5-5,這5株菌的耐鹽濃度可以達(dá)到12%左右。
2.1.4 生理生化試驗(yàn)結(jié)果
對(duì)篩選出的5株疑似乳酸菌菌株進(jìn)行生理生化試驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)表4。

表4 5株乳酸菌的生理生化特征Table 4 Physiological and biochemical characteristics of 5 LAB strains

注:“+”為陽(yáng)性反應(yīng);“-”為陰性反應(yīng);“(+)”為弱陽(yáng)性反應(yīng);“(-)”為弱陰性反應(yīng)。
綜上所述,根據(jù)菌株的形態(tài)學(xué)特征并參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》第八版[13],對(duì)5株乳酸菌的生理生化實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明,菌株 DL3-1、DL4-5、FS5-5均屬于乳桿菌屬(Lactobacillus sp.),菌株SY4-2、FS1-12屬于腸球菌屬(Enterococcus sp.)。
2.2.1 乳酸菌基因組DNA提取結(jié)果
實(shí)驗(yàn)中采用優(yōu)化后的CTAB法提取供試菌株基因組DNA,分別用ND-1000型微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA純度及含量。基因組DNA檢測(cè)結(jié)果如表5所示。

表5 基因組DNA檢測(cè)結(jié)果Table 5 Genome DNA test results
從表5得知,CTAB法提取的基因組DNA濃度最低的是 FS5-5,為 241.5 ng/μL,最高為 SY4-2,為423.5 ng/μL。OD260/OD280值均在1.70附近。說(shuō)明基因組DNA受到微量蛋白質(zhì)或酚類(lèi)物質(zhì)的影像,但是能滿(mǎn)足后續(xù)16S rDNA擴(kuò)增和測(cè)序的需要。
2.2.2 16S rDNA區(qū)域PCR擴(kuò)增檢測(cè)結(jié)果
用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.0%的瓊脂糖凝膠,對(duì)5株供試菌株的基因組DNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物做瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),通過(guò)凝膠成像分析系統(tǒng)得到5株菌株的16S rDNA PCR擴(kuò)增的瓊脂糖凝膠電泳圖,如圖3所示。
從圖3看出,在約1 500 bp處出現(xiàn)熒光條帶,2號(hào)菌的條帶稍暗,但并不影響結(jié)果。說(shuō)明PCR擴(kuò)增成功,能滿(mǎn)足后續(xù)16S rDNA測(cè)序的需要。

圖3 16S rDNA PCR擴(kuò)增后的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.3 Agarose gel electrophoresis map of 16S rDNA amplification products
2.2.3 測(cè)序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
將PCR擴(kuò)增成功的DNA樣品送至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。測(cè)得16S rDNA基因序列分析顯示,菌株SY4-2的16S rDNA基因序列長(zhǎng)度有1 379bp核苷酸;菌株DL3-1的16S rDNA基因序列長(zhǎng)度有1 417bp核苷酸;菌株DL4-5的16S rDNA基因序列長(zhǎng)度有1 419bp核苷酸;菌株FS1-11的16S rDNA基因序列長(zhǎng)度有1 413bp核苷酸;菌株FS5-5的16S rDNA基因序列長(zhǎng)度有1 432bp核苷酸。將測(cè)序獲得的基因序列與NCBI中相關(guān)乳酸菌菌株的16S rDNA基因序列進(jìn)行同源性分析,并用MEGA軟件以Neighbor Join法繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[14]。結(jié)果如圖4所示。
如圖4所示,從總體上可將這10株乳桿菌分為兩大群,即 FS5-5、Lactobacillus plantarum YML007、Lactobacillus plantarum IMAU32388、DL4-5、DL3-1 和Lactobacillus plantarum P10為第一群,其余乳桿菌菌株組成第二群。第一群中,菌株FS5-5、DL4-5、DL3-1與 Lactobacillus plantarum YML007、Lactobacillus plantarum IMAU32388處于同一分支,同源性較高。在第二群中,菌株FS1-11與所在分支的Enterococcus faecium S4-4系統(tǒng)位置最近,同源性可以達(dá)到99%,還有Enterococcus faecium和SY4-2與其在同一分支。綜上所述,我們可以鑒定菌株DL3-1、DL4-5、FS5-5為植物乳桿菌,SY4-2、FS1-12為屎腸球菌。
本研究采用傳統(tǒng)微生物的分離培養(yǎng)方法對(duì)農(nóng)家大醬中的乳酸菌進(jìn)行了分離。利用NaCl作為外界脅迫條件,對(duì)篩選出的乳酸菌進(jìn)行耐鹽性實(shí)驗(yàn),挑選出5株耐鹽性較好的菌株。對(duì)這5株菌提取DNA,并通過(guò)PCR技術(shù)將其擴(kuò)增,采用16S rDNA技術(shù)對(duì)這5株菌進(jìn)行鑒定。

圖4 菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.4 Phylogenetic tree of strain
(1)從15個(gè)樣品中分離獲得典型的菌株62株,菌株在MRS固體培養(yǎng)基上,為白色或乳白色,圓形菌落,表面光滑有光澤,中間凸起,邊緣整齊。通過(guò)革蘭氏染色與過(guò)氧化氫酶試驗(yàn),從62株疑似乳酸菌的菌株中篩選出革蘭氏陽(yáng)性、過(guò)氧化氫酶陰性的乳酸菌菌株26株。
(2)利用NaCl作為外界脅迫條件,當(dāng) NaCl濃度增加到 12%時(shí),菌株 SY4-2、DL3-1、DL4-5、FS1-11、FS5-5的 OD600值在0.100左右。與其他菌株相比,這5株菌具有較好的耐鹽特性。耐鹽濃度可以達(dá)到12%左右。對(duì)耐鹽性較好的5株菌株進(jìn)行生理生化實(shí)驗(yàn),根據(jù)菌株的形態(tài)學(xué)特征并參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》第八版[13],對(duì)5株乳酸菌的生理生化實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明,菌株 DL3-1、DL4-5、FS5-5均屬于乳桿菌屬(Lactobacillus sp.),菌株 SY4-2、FS1-12屬于腸球菌屬(Enterococcus sp.)。
(3)對(duì)這5株菌提取DNA并經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增,最后采用16S rDNA的方法進(jìn)行鑒定。結(jié)果顯示5株菌中,DL3-1、DL4-5、FS5-5 為植物乳桿菌,SY4-2、FS1-11為屎腸球菌。
大醬作為東北地區(qū)典型的發(fā)酵性食品而受到人們的歡迎。隨著科技的發(fā)展,工業(yè)化生產(chǎn)的市售大醬進(jìn)入人們的視野,但是,人們還是喜歡自家手工制作的農(nóng)家大醬,因?yàn)槠渲杏刑厥獾奈兜馈9I(yè)化生產(chǎn)的市售大醬由于需要滅菌而使大醬中的微生物含量較少,本實(shí)驗(yàn)采用農(nóng)家大醬作為原材料也是出于這方面原因。大醬中含NaCl濃度大約8%左右,乳酸菌長(zhǎng)時(shí)間生長(zhǎng)在鹽濃度下會(huì)發(fā)生應(yīng)激反應(yīng),從而使自己更有利的存活下去,這樣乳酸菌會(huì)對(duì)NaCl具有一定程度的耐受性,也更有利于篩選出耐鹽性較好的乳酸菌。在大醬的發(fā)酵過(guò)程中,耐鹽性較好的乳酸菌會(huì)更適應(yīng)大醬中的鹽環(huán)境,從而更好地生長(zhǎng),可以大大縮短大醬的生產(chǎn)周期,穩(wěn)定產(chǎn)品的質(zhì)量。
對(duì)于基因組的提取,目前采用較多的2種方法為試劑盒法與CTAB法。試劑盒法提取基因組DNA,DNA濃度和純度較高,提取效率高,可直接用于PCR擴(kuò)增、測(cè)序等,但造價(jià)相對(duì)昂貴些,適用于少量DNA樣品的提取。CTAB法提取基因組DNA,出于安全等多方面因素的考慮,可能在一定程度上影響提取DNA的純度以及穩(wěn)定性而使DNA中含有少量的蛋白質(zhì)、RNA等雜質(zhì),但是不會(huì)影響后續(xù)試驗(yàn)的進(jìn)行,而且此方法造價(jià)低,能滿(mǎn)足一般分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的需要。為了更好地獲得DNA,一方面考慮盡量去除雜質(zhì)、蛋白和脂類(lèi),CTAB在高離子強(qiáng)度的溶液中可以與蛋白質(zhì)、多糖等物質(zhì)結(jié)合,而不與DNA結(jié)合,這里還可以添加一些還原劑比如β-巰基乙醇來(lái)避免褐化物質(zhì)對(duì)DNA的影響;另一方面考慮加強(qiáng)DNA的沉淀效果,氯仿-異戊醇可以進(jìn)一步使蛋白質(zhì)變性分層并去除脂類(lèi),最后用低溫預(yù)冷的無(wú)水乙醇或者異戊醇來(lái)沉淀DNA。
本文從農(nóng)家大醬中獲得了耐鹽性較好的乳酸菌菌株,但應(yīng)用菌株對(duì)產(chǎn)品品質(zhì)的提升還需深入研究。下一步工作應(yīng)該圍繞著應(yīng)用耐鹽乳酸菌的發(fā)酵性能來(lái)改善農(nóng)家大醬產(chǎn)品品質(zhì)。同時(shí)耐鹽性乳酸菌之所以能夠耐鹽,它的耐鹽機(jī)理是什么也是要研究的重點(diǎn)。乳酸菌作為益生菌的最大群體,其分布較為廣泛,性能優(yōu)良的乳酸菌更是人們所需要的。它不僅可以提高食品的品質(zhì),而且可以促進(jìn)人體健康,為人類(lèi)做出貢獻(xiàn)。
[1] 趙建新.傳統(tǒng)豆醬發(fā)酵過(guò)程分析與控制發(fā)酵的研究[D].無(wú)錫:江南大學(xué),2011.
[2] Khalid K.Anoverview of lactic acid bacteria[J].International Journal of Biosciences,2011,1(3):1-13.
[3] Shrestha H,Nand K,Ratie.Microbiological profile of murcha starters and physicochemical characteristics of poko,a rice based traditional fermented food product of Nepal[J].Food Biotechnology,2002,16(1):1-15.
[4] 羅靚芷,武俊瑞,劉佳藝,等.臭鱖魚(yú)中優(yōu)良乳酸菌的分離篩選與鑒定[J].食品與發(fā)酵工業(yè),2013,39(10):132-136.
[5] 東秀珠,蔡妙英.常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)[M].北京:北京科學(xué)出版社,2001:269-292.
[6] 熊濤,徐立榮,范鐳,等.蔬菜發(fā)酵專(zhuān)用乳酸菌的選育[J].食品科學(xué),2008,29(6):264-267.
[7] 王筍,呂嘉櫪,辛博,等.西北地區(qū)泡菜中乳酸桿菌的生物學(xué)特性[J].中國(guó)調(diào)味品,2014,39(3):15-18.
[8] Cindy D C Gomez-Balderas,Nelly Cochet,Valérie Bert.16S rDNA analysis of bacterial communities associated with the hyper accumulator Arabidopsis halleri grown on a Zn and Cd polluted soil[J].European Journal of Soil Biology,2014,60:16-23.
[9] 夏雪娟,陳芝蘭,陳宗道.16S rDNA序列分析法快速鑒定西藏地區(qū)傳統(tǒng)乳制品中的乳酸菌[J].食品科學(xué),2013,34(14):245-249.
[10] 曲玲童.錦州腌漬小黃瓜中耐鹽性乳酸菌的分離鑒定與性能研究[D].錦州:渤海大學(xué),2012.
[11] TANG S K,LI W J,WANG D,et al.Studies of the biological characteristics of some halophilic and halotolerant actinomycetes isolated from saline and alkaline soils[J].Actinomycetol,2003,17:6-10.
[12] Amarela Terzic-Vidojevic,Sanja Mihajlovic,Gordana Uzelac,et al.Characterization of lactic acid bacteria isolated from artisana Travnik young cheeses,sweet creams and sweet kajmaks over four seasons[J].Food Microbiology,2014,39:27-38.
[13] R.E.布坎南,N.E.吉本斯.伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)[M].北京:科學(xué)出版社,1984:797-827.
[14] 張潔,徐桂花,尤麗琴.16S rDNA序列分析法鑒定乳酸菌[J].農(nóng)產(chǎn)品加工·創(chuàng)新版,2009,170(4):47-69.