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陰溝腸桿菌AcrAB-TolC外排系統基因研究

2014-06-13 07:09:30溫見翔
中國實驗診斷學 2014年7期
關鍵詞:耐藥

溫見翔,陳 娟,楊 虹

(北京大學深圳醫院 檢驗科,廣東 深圳518036)

陰溝腸桿菌是臨床常見的條件致病菌之一,亦是醫院獲得性感染的重要病原菌[1]。近年來,隨著廣譜抗菌藥物的廣泛使用,陰溝腸桿菌在抗生素的選擇性壓力下出現高耐藥性和多重耐藥。陰溝腸桿菌感染已成為醫院感染的重要致病菌之一。我院陰溝腸桿菌感染分布與耐藥狀況亦不容樂觀[2],本研究通過檢測我院臨床分離的141株陰溝腸桿菌AcrAB-TolC外排系統acrA,acrB,tolC和acrR 4種基因,分析4種基因的攜帶分布,研究AcrAB-TolC外排系統基因與陰溝腸桿菌耐藥性之間的關系。

1 材料與方法

1.1菌株鑒定與藥敏試驗2010年5月至2013年6月從北京大學深圳醫院門急診及住院部患者痰液、尿液、血液、膿液、膽汁等標本分離到的陰溝腸桿菌共計141株。所有菌株經 MicroScanWalkaway40細菌分析儀進行鑒定和藥敏試驗,測其對各種抗生素的最小抑菌濃度(MIC)。同一患者同一部位分離出的陰溝腸桿菌,如藥敏結果相同,僅采用首次分離菌株。以大腸桿菌ATCC 25922、銅綠假單胞菌ATCC27853為質控菌株,藥敏結果依據CLSI2013年執行標準判定。

1.2儀器與試劑美國德靈公司生產的 MicroScanWalkaway40型全自動細菌分析系統及該公司提供的陰性菌復合板;PCR擴增儀為美國Biosytems公司產品;凝膠成像系統為美國BIO-RAD公司產品質;標準分子量DNA、Taq DNA聚合酶、pMD18-T載體、DNA膠回收試劑盒為TAKARA公司產品。

1.3AcrAB-TolC外排系統基因的擴增根據AcrAB-TolC外排系統acrA,acrB,acrR和tolC 4種基因序列,設計PCR引物,并由TAKARA公司合成引物,引物序列及產物長度見表1。采用煮沸法提取各株陰溝腸桿菌基因組的DNA,進行PCR擴增。四種基因的PCR反應總體積均為50μl(DNA聚合酶系統Premix Taq9.5μl,上游引物及下游引物各1μl,DNA模板2μl,去離子水36.5μl)。基因擴增反應條件分別為:acrA基因94℃預變性4min,95℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5min;acrB基因94℃預變性4min,95℃變性30s,48℃退火30s,72℃延伸3min,共40個循環,72℃終末延伸5min;acrR基因94℃預變性4min,95℃變性30s,48℃退火30 s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5 min;tolC基因94℃預變性4min,95℃變性30s,43℃退火30s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5min。PCR產物在含0.5mg/L溴化乙啶的1%瓊脂糖凝膠中電泳30min,使用BIO-RAD凝膠成像系統觀察結果,分析PCR產物。

1.4擴增產物的純化、克隆與測序PCR擴增產物經凝膠回收試劑盒回收并純化,將其與pMD-18T載體連接,連接產物轉化入感受態大腸桿菌E coli JM109中,用含氨芐西林的LB平板篩選含陽性質粒的菌落,陽性菌經擴增培養后送TAKARA公司進行測序。

1.5統計學分析采用SPSS 17.0統計軟件對結果進行卡方檢驗。

表1 靶基因引物識別序列及目的產物長度

2 結果

2.1藥敏試驗結果141株陰溝腸桿菌對常見抗菌藥物的藥敏試驗結果見表2。根據耐藥表型不同,將141株陰溝腸桿菌分為4組見表3。

表2 141株陰溝腸桿菌對常見抗菌藥物的藥敏試驗結果

表3 141株陰溝腸桿菌耐藥表型分組

2.2AcrAB-TolC外排系統基因擴增及測序結果acrA,acrB,acrR和tolC 4種基因在141株陰溝腸桿菌中均擴增出陽性株,其PCR擴增電泳結果見圖1、圖2、圖3和圖4。4種基因PCR產物經克隆后測序,測序 結 果 與 (CNBI)Genbank 數 據 庫 (http://www.cnbi.nim.nih.gov BLAST 程序)進行對比,同源性比對后證實,4種基因與陰溝腸桿菌同源性均為96%。

圖1 acrA基因PCR擴增電泳圖

圖2 acrB基因PCR擴增電泳圖

圖3 acrR基因PCR擴增電泳圖

圖4 tolC基因PCR擴增電泳圖

2.3統計學分析結果141株陰溝腸桿菌分別擴增出139株acrA基因陽性株,陽性率為98.58%;72株acrB基因陽性株,陽性率為51.06%;111株acrR基因陽性株,陽性率為78.72%;116株tolC基因陽性株,陽性率為82.27%,4種基因的陽性率差異有統計學意義(P<0.01),見表4。分別比較多重耐藥組、雙重耐藥組、單重耐藥組和敏感組不同基因的陽性率,acrA基因和acrB基因在4組菌株的陽性率差異均具有統計學意義(P<0.01),而AcrR基因和tolC基因的陽性率組間無統計學差異,見表5。

表4 4種基因陽性率的比較

表5 四種基因在不同組中陽性率的比較

3 討論

主動外排系統是引起細菌多重耐藥的機制之一,作為一種非特異性耐藥機制,可引起細菌固有的耐藥性[3,4],而耐藥結節細胞分化家族 AcrAB-TolC外排系統是導致革蘭陰性菌多重耐藥性的重要因素[5-7]。陰溝腸桿菌染色體上存在acrA,acrB,acrR和tolC基因,可以編碼AcrAB-TolC外排泵,多重耐藥的陰溝腸桿菌存在活躍的AcrAB-To1C外排泵[8],陰溝腸桿菌多重耐藥與主動外排系統有關。

本研究結果顯示,141株陰溝腸桿菌高水平攜帶AcrAB-TolC系統的acrA,acrB,acrR和tolC四種基因,其中acrA基因的陽性檢出率最高,acrB基因的陽性檢出率最低,四種基因的陽性檢出率有顯著的差異(P<0.01)。根據耐藥表型的不同,將141株陰溝腸桿菌分為多重耐藥組、雙重耐藥組、單重耐藥組和敏感組,比較各組陰溝腸桿菌不同基因的陽性檢出率,acrA基因和acrB基因在不同組的陽性率有顯著性差異(P<0.01),各耐藥組高于敏感組,且多重耐藥組陽性率最高;acrR基因和tolC基因在不同組的陽性率無顯著性差異。

[1]Yu WL,Cheng HS,Lin HC,et al.Outbreak investigation of nosocomial enterobacter cloacae bacteraemia in a neonatal intensive care unit[J].Scand J Infect Dis,2000,32(3):293.

[2]溫見翔,王 德,王 麗.臨床陰溝腸桿菌感染分布及耐藥性分析[J].熱帶醫學雜志,2010,10(6):704.

[3]Schumacher A,Trittler R,Bohnert JA,et al.Intracellular accumulation of linezolid in Escherichia coli,Citrobacter freundii and Enterobacter aerogenes:role of enhanced efflux pump activity and inactivation[J].J Antimicrob Chemother,2007,59(6):1261.

[4]Poole K.Efflux-mediated resistance to fluoroquinolones in gramnegative bacteria[J].Antimicrob Agents Chemother,2000,44(9):2233.

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[6]Keeney D,Ruzin A,Bradford PA.RamA,a transcriptional regulator,and AcrAB,an RND-type efflux pump,are associated with decreased susceptibility to tigecycline in Enterobacter cloacae[J].Microb Drug Resist,2007,13(1):1.

[7]Bratu S,Landman D,George A,et al.Correlation of the expression of acrB and the regulatory genes marA,soxS and ramA with antimicrobial resistance in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae endemic to New York City[J].J Antimicrob Chemother,2009,64(2):278.

[8]劉 軍.陰溝腸桿菌耐藥機制的研究進展[J].國外醫藥抗生素分冊,2009,30(2):49.

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