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電子鼻在芒果采后病原菌種類判別中的應(yīng)用研究

2014-04-29 03:35:52李敏胡美姣張正科梁秋南楊冬平陳亮鄭淑英高兆銀
熱帶作物學(xué)報(bào) 2014年12期

李敏 胡美姣 張正科 梁秋南 楊冬平 陳亮 鄭淑英 高兆銀

摘 要 利用電子鼻對(duì)膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.)4種芒果采后病害病原菌發(fā)酵液的揮發(fā)性氣味進(jìn)行檢測(cè),以評(píng)估電子鼻用于芒果不同真菌病原菌種類判別的可行性。結(jié)果表明,對(duì)氣味響應(yīng)值進(jìn)行的主成分分析(PCA)、線性判別分析(LDA)及聚類分析均能夠正確區(qū)分不同病原菌種類。多因素方差分析(MANOVA)結(jié)果顯示,不同病原菌之間的差異顯著(p<0.05)。結(jié)果為芒果采后病原菌種類判別提供新的方法,為其他病原菌的種類判別提供參考。

關(guān)鍵詞 芒果;電子鼻;病原菌;主成分分析;線性判別分析;聚類分析;多因素方差分析

中圖分類號(hào) S667.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

通常病原真菌的種類鑒定以觀察其形態(tài)學(xué)特征為主,另外可通過病菌rDNA-ITS序列對(duì)比分析做進(jìn)一步驗(yàn)證。然而利用形態(tài)學(xué)進(jìn)行種類判斷時(shí),常出現(xiàn)因培養(yǎng)條件不適合或培養(yǎng)時(shí)間短,造成病菌產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)和孢子缺失現(xiàn)象,給鑒定工作帶來一定的困難和限制。利用對(duì)比rDNA-ITS序列等分子生物學(xué)手段進(jìn)行輔助驗(yàn)證也需要一定周期。然而有研究發(fā)現(xiàn),真菌可以釋放出多種揮發(fā)性有機(jī)化合物(VOC)[1-2],GC-MS分析表明其包含如單萜,倍半萜,醇類、醛、芳香族化合物,碳?xì)浠衔铮ィ秽秃蚧衔锏萚3-5]。而電子鼻可以分析、識(shí)別和檢測(cè)復(fù)雜嗅味及大多數(shù)揮發(fā)性成份。其通常由若干氣敏傳感器組成傳感器陣列進(jìn)行氣體揮發(fā)性物質(zhì)的復(fù)合檢測(cè)和識(shí)別,陣列中每一個(gè)傳感器對(duì)某些特定種類的氣體成分敏感,使得整個(gè)電子鼻能夠?qū)怏w中不同的成分進(jìn)行識(shí)別并給出總體評(píng)價(jià)。目前已廣泛用于農(nóng)畜產(chǎn)品的品質(zhì)檢測(cè)和分級(jí)。在水果成熟度監(jiān)控、貨架期判斷、水果種類鑒定等方面均有一定的應(yīng)用價(jià)值[6-8]。有研究結(jié)果表明,電子鼻技術(shù)能夠?qū)λ{(lán)莓[9]和草莓[10]是否早期感染病害做出較準(zhǔn)確的判斷。膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.)[11]是芒果采后病害主要病原菌,本研究擬以芒果采后病害主要病原菌為研究對(duì)象,應(yīng)用電子鼻測(cè)定這4種病原菌發(fā)酵液的氣味響應(yīng)值,通過主成分分析、線性判別式分析等方法探討基于電子鼻區(qū)分不同芒果采后病原菌的可行性,為芒果采后病原菌種類判斷提供有效的輔助手段。

1 材料與方法

1.1 病原菌

芒果采后常見4種病原真菌:膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.,CG)(3株菌株,編號(hào)分別為CG1、CG2、CG3)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.,BT)(3株菌株,編號(hào)BT1、BT2、BT3)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.,DD)(3株菌株,編號(hào)DD1、DD2、DD3)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.,PM)(3株菌株,編號(hào)PM1、PM2、PM3),均由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境與植物保護(hù)研究所采后病害及貯運(yùn)保鮮實(shí)驗(yàn)室分離、鑒定、保存。

1.2 傳感器響應(yīng)值測(cè)定

將12株菌株分別置于PDA培養(yǎng)基28 ℃培養(yǎng) 5 d后,取6塊病菌菌餅(Φ=5 mm)接種到含100 mL PDB培養(yǎng)基的三角瓶中,置于28 ℃,150 r/min振蕩培養(yǎng)3 d。再應(yīng)用德國AIRSENSE公司PEN3便攜式電子鼻獲取菌株發(fā)酵液氣味的響應(yīng)值。電子鼻傳感器陣列包含10個(gè)傳感器(見表1)。測(cè)定時(shí),傳感器涂層吸附樣品中的揮發(fā)性物質(zhì)產(chǎn)生電導(dǎo)率變化,記錄傳感器吸附樣品揮發(fā)物后的電導(dǎo)率G與傳感器吸附經(jīng)活性碳過濾的空氣后的電導(dǎo)率G0的比值G/G0(即相對(duì)電導(dǎo)率),響應(yīng)氣體濃度越大,G/G0的值越偏離1,如果濃度低于檢測(cè)限或者沒有感應(yīng)氣體,則該比值接近甚至等于1。

1.3 傳感器響應(yīng)值數(shù)據(jù)處理

采用電子鼻自帶的 Winmuster 軟件進(jìn)行主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)、線性判別分析(Linear Discriminant Analysis,LDA)、載荷分析(loading Analysis)。利用軟件SPSS進(jìn)行多因素方差分析、聚類分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 主成分分析(PCA)

利用48、49、50 s時(shí)的響應(yīng)值進(jìn)行主成分分析(PCA),結(jié)果表明,第一主成分(PC1)區(qū)分貢獻(xiàn)率為98.98%,區(qū)分貢獻(xiàn)率大于90%,表明第一主成分已經(jīng)基本代表了樣品的主要信息特征(圖1)。第二主成分(PC2)區(qū)分貢獻(xiàn)率僅為0.63%,但在區(qū)分不同病菌種類中起重要作用。通過PCA分析發(fā)現(xiàn),相同的病原菌分別聚在相近的位置,從而可以將4種病原菌較好的區(qū)分開來。其中B. theobromae和其它3種病菌的距離最遠(yuǎn),且3株B. theobromae的距離也相對(duì)較大。C. gloeosporioides、D. dominicana和P.mangiferae在第一主成分上差異較小,三者之間的區(qū)別主要體現(xiàn)在第二主成分上。

2.2 線性判別(LDA)分析

利用傳感器第48、49、50 s時(shí)的響應(yīng)值進(jìn)行線性判別式(LDA)分析,結(jié)果表明, 第一判別式(LD1)的貢獻(xiàn)率為98.95%,大于90%,已經(jīng)基本代表了樣品的主要信息特征(圖2)。第二判別式(LD2)的貢獻(xiàn)率僅為0.83%,但在區(qū)分不同病菌種類中起關(guān)鍵作用。利用線性判別式分析,可以將BT、CG、DD、PM這4種不同的病原菌很好的區(qū)分開,相同的病原菌分別落在相近的位置(圖1,2),B. theobromae和其它3種病菌的區(qū)別較大,而C. gloeosporioides、D. dominicana和P.mangiferae的區(qū)別主要體現(xiàn)于第二判別式。

2.3 載荷(loading)分析

通過載荷分析,可以得出電子鼻的10個(gè)傳感器分別對(duì)樣品的PCA主成分分析的貢獻(xiàn)率。其中S7號(hào)傳感器對(duì)第一主成分區(qū)分和第二主成分區(qū)分貢獻(xiàn)率最大。S2、S6、S8、S9號(hào)傳感器對(duì)第一主成分貢獻(xiàn)率較大;S2、S7、S8號(hào)3個(gè)傳感器對(duì)應(yīng)的點(diǎn)在第一象限中距離很近,說明這3個(gè)傳感器的響應(yīng)值并不是菌株揮發(fā)性氣體的特征信號(hào),S1、S3、S4、S5、S10這5個(gè)傳感器對(duì)第一主成分區(qū)分和第二主成分區(qū)分貢獻(xiàn)率均很小(圖3)。

2.4 響應(yīng)值方差分析

利用病原菌對(duì)電子鼻傳感器第50 s的響應(yīng)值進(jìn)行多因素方差分析,結(jié)果如表2所示。其中 Wilks'Lambda表示組內(nèi)變異與總變異的比值,在0~1之間; Wilks' Lambda值越接近1,表示各個(gè)組間的差異越小;Wilks'Lambda越接近0,表示組間差異越大。由表2可知,4種病原菌間響應(yīng)值的Wilks'Lambda均接近0,說明不同病菌間有明顯差異,差異水平顯著(p<0.05)。

2.5 不同病原菌響應(yīng)值的聚類分析

利用12株病原真菌對(duì)電子鼻傳感器第50s的特征響應(yīng)值,按照系統(tǒng)聚類的歐氏距離ward法進(jìn)行系統(tǒng)聚類,結(jié)果表明(圖4),同種的3株病原真菌分別聚成一類。不同病原菌之間關(guān)系有差別。其中C. gloeosporioides和D. dominicana的距離最近,其次是P. mangiferae;B. theobromae與其它3種病原菌的距離較遠(yuǎn)。

3 討論與結(jié)論

真菌可以釋放出多種揮發(fā)性物質(zhì)[1-2],但揮發(fā)物的氣味特征和種類之間是否有相關(guān)性、是否能根據(jù)氣味特征進(jìn)行種類的識(shí)別等尚未見報(bào)道。本文利用電子鼻對(duì)不同芒果4種病原真菌發(fā)酵液進(jìn)行氣味的測(cè)定,并對(duì)10組傳感器的響應(yīng)值進(jìn)行了PCA分析、LDA分析、方差分析和聚類分析,每種分析結(jié)果均可把同種病原菌的3株菌株劃為一組,從而較好區(qū)別不同的病原菌,初步證明同種病菌的發(fā)酵液具有相似的揮發(fā)性氣味,且有區(qū)別于其他病菌。聚類分析的結(jié)果表明,C. gloeosporioides和D. dominicana的距離最近,說明其發(fā)酵液氣味較相近,B. theobromae與其它病原菌的氣味差異較大。筆者利用Genebank上rDNA-ITS序列構(gòu)建4種病原菌系統(tǒng)進(jìn)化樹的聚類結(jié)果表明,C. gloeosporioides和P.mangiferae關(guān)系較近,而B. theobromae和D. dominicana的關(guān)系較近。該結(jié)果與電子鼻傳感器響應(yīng)值的聚類結(jié)果有很大差異。說明供試病菌的氣味差異與其親緣關(guān)系的親疏沒有相關(guān)性。

朱娜等[10]利用電子鼻特征傳感器響應(yīng)值,構(gòu)建了草莓感染3種霉菌類型的判別模型,判別準(zhǔn)確率達(dá) 95%以上。本研究中由于沒有足夠的實(shí)驗(yàn)樣本量,無法運(yùn)用Fisher 線性判別分析等方法構(gòu)建判別模型,在后期研究中,增加每種病菌的實(shí)驗(yàn)樣本量,建立準(zhǔn)確的病菌類型判別數(shù)學(xué)模型,從而實(shí)現(xiàn)利用電子鼻進(jìn)行4種芒果采后病害種類的準(zhǔn)確區(qū)分和判別。為芒果采后病原菌種類的判斷提供有效的輔助手段。

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