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Cox比例風險Frailty模型簡介與軟件實現*

2014-03-10 09:57:00玉梅楊李杰陳佰鋒姚應水
中國衛生統計 2014年3期
關鍵詞:效應模型研究

朱 玉梅 楊李 杰陳佰鋒姚應水△

Cox比例風險Frailty模型簡介與軟件實現*

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目的介紹Cox比例風險Frailty模型的原理及其在SAS 9.3軟件中的實現過程。方法利用具體數據的分析過程介紹Cox比例風險Frailty模型在SAS 9.3軟件中的實現,并比較Cox比例風險模型與Cox比例風險Frailty模型的分析效果。結果Frailty項對數變換后的方差估計值為0.831,與0比較差異有統計學意義,有必要在Cox比例風險模型中加入Frailty項。結論Cox比例風險Frailty模型能夠揭示資料的異質性,準確地分析因素對結局變量的影響,獲得更為客觀的分析結論。

Frailty模型 Cox比例風險模型 Cox比例風險Frailty模型

以時間到事件(Time-To-Event)為結局變量的生存分析方法眾多,其中經典的分析方法是Cox比例風險模型。它的理論假設之一是研究對象間相互獨立,即研究對象間具有同質性,這暗示每個研究對象有相同的基線風險。在實際研究中,這種假設不易達到,由于未知因素或設計等原因,導致研究對象個體間或組別間存在異質性,研究對象表現出組內相關的特性,經典的生存分析不再適合分析這類型的數據。這時,需要對經典的生存分析的方法進行改進,引入Frailty項(異質性變量),發展為Frailty模型(異質性模型)。本文介紹加入Frailty項的Cox比例風險模型——Cox比例風險Frailty模型和軟件實現。

基本原理

以多中心臨床隨機化對照試驗為例,介紹Cox比例風險Frailty模型。中心i(i=1,2,…,k),每個中心的研究對象j(j=1,2,…,ni)。在介紹Cox比例風險Frailty模型之前,先回顧下Cox比例風險模型。

1.Cox比例風險模型

Cox提出比例風險模型[1]如下:

其中h0(t|X)稱為基線風險函數,h(t|X)表示在協變量為X條件下的風險函數,exp(β)為風險比(hazard ratio,HR)。Cox比例風險模型最突出的優點在于,對參數β的估計并不依賴于基線風險函數的取值。但是,它要求研究對象相互獨立,即研究對象具有同質性。

2.Cox比例風險Frailty模型

當分析多中心臨床隨機化對照試驗的數據時,每個中心的基線風險可能不一致,需要對Cox比例風險模型進行如下改進,發展為Cox比例風險Frailty模型[2-7],如下:

其中γi為中心i(i=1,2,…,k)的隨機效應,其它同Cox比例風險模型。常對γi做如下假設:

上式改寫為下式:

其中μi被稱為Frailty項(異質性變量),μi是相互獨立同分布的,其期望是1,方差為未知參數θ2,通常還假設其與X相互獨立,當μi=1時Cox比例風險Frailty模型蛻變為Cox比例風險模型。此外,Elbers和Ridder[8]證明了在Frailty項的期望為1的條件下,模型是可估的。

當μi>1時說明中心i內的研究對象傾向于加速失效(事件發生);當μi<1時說明中心i內的研究對象傾向于減速失效(事件發生);當μi=1時說明中心i內的研究對象的失效風險(事件發生)是正常風險。

為了估計未知參數,需要對Frailty項的分布做出假設。原則上期望為1和具有有限方差的任一正連續分布都可以作為Frailty項的分布。在應用中常采用的分布有伽馬分布、逆高斯分布和對數正態分布等。方差θ2的估計方法有限制性最大似然估計(residual maximum likelihood,REML)和最大似然估計(maximum likelihood,ML)。

實例分析與軟件實現

下面結合SASPROC PHREG過程和SAS help中提供的數據介紹Cox比例風險Frailty模型的應用和軟件實現[7]。

1.數據簡介

該數據來源于一項關于糖尿病患者眼睛失明的研究,共包含197例糖尿病患者,他們的眼睛有很高的失明風險,每個研究對象的兩只眼睛中隨機選擇一只眼睛接受激光光凝治療,研究的目的主要是探索激光光凝治療有沒有延緩眼睛失明的進程。因為青少年和成年糖尿病有不同的發展過程,所以同時檢查發病年齡和眼睛失明時間有無關聯。每個患者是一個“群(clusters)”,類似于上文提到的“中心”,因為左右眼睛沒有生物學差異,我們假設它們有相同的基線風險。變量(id)表示患者編號,變量(time)是患者眼睛失明時間,變量(status)表示眼睛失明狀況(是二分類變量,“0”代表沒有失明,“1”代表失明),變量(age)表示患者的發病年齡(是二分類變量,“0”代表發病年齡≤20,“1”代表發病年齡>20),變量(treatment)表示眼睛接受治療的方法(是二分類變量,“0”代表其他治療,“1”代表激光光凝治療)。用數據步建立數據集blind,見表1。

表1 建立數據集和數據分析的程序

2.語句介紹

在SAS 9.3版本的PROC PHREG過程中加入了分析Frailty模型的語句——Random語句。Random語句規定Frailty項服從對數正態分布,即γi~N(0,σ2),其中σ為未知參數,需要估計。Random語句的結構和功能如下:

Vaiable是用來指定“群”,它必須是分類變量,即是class語句中的變量。options有如下:

Abspconv=r,是規定Frailty項對數變換后方差估計時迭代的收斂準則,如果迭代收斂。

Alpha=value,是規定隨機效應的(1-α)可信區間,默認值是0.05。

Method=reml|ml,是規定方差參數估計的方法,默認方法是rem l。

Noclprint,控制在輸出時不打印隨機效應的分類信息表。

Pconv=r,是規定Frailty項對數變換后方差估計時迭代的收斂準則,如果迭代收斂。

Solution,規定顯示正態分布的隨機效應估計值,同時也顯示對數正態分布的估計值,即Frailty的估計值。

Initialvariance|initial=value,規定Frailty項對數變換后方差估計的初始值,默認為1。

3.分析與結果

首先不考慮Frailty項,建立含有變量treatment、age的主效應和交互效應的Cox比例風險模型,然后模型再加入Frailty項,分析程序見表1。為了方便對比,把主要結果列于表2、3。

表2 Cox比例風險模型與Frailty模型的參數估計

表3 兩個模型的激光光凝治療相對于其他治療的條件風險比估計

從表2可見,Frailty項對數變換后的方差估計值為0.831,與0的差異有統計學意義,提示分析時需要考慮個體間的異質性,有必要在Cox比例風險模型中加入Frailty項。兩個模型的參數估計值相近,Cox比例風險模型比Cox比例風險Frailty模型要保守,在檢驗水準為0.05的情況下,都提示治療方法與發病年齡間存在交互作用。表3給出了不同發病年齡下激光光凝治療相對于其他治療的風險比,從中可看出激光光凝治療方法可延緩眼睛失明進程,并且成年組延緩眼睛失明進程的效果要好于青少年組。

討 論

本質上,Frailty模型是在經典的生存分析的基礎上加入了一個隨機效應,以控制研究對象個體間或組別間存在的異質性。雖然產生異質性的變量也可以通過設置啞變量或用固定效應分析,但固定效應分析方法不是最優的分析方法。按照異質性產生的單位不同,把Frailty模型分為個體Frailty模型、共享Frailty模型兩種。個體Frailty模型假設研究對象個體之間具有異質性,基線風險隨著個體而改變;共享Frailty模型假設組別間具有異質性,基線風險隨著組別而改變,同一組別內的個體享有相同的基線風險。研究對象個體間或組別間存在的異質性是不能忽略,有文章也指出[9-10]:如果有異質性存在,而沒有考慮,會導致效應低估,這點在本文中也有體現——Cox比例風險模型比Cox比例風險Frailty模型要保守,但是兩者的意義是不同的,考慮異質性時效應是條件的效應,不考慮異質性時,效應是邊際效應,在預測時需要注意這點。

與在Cox比例風險模型中引入Frailty項類似,也可以在其它生存分析方法——Weibull回歸模型、加速失效模型中引入Frailty項,擴展生存分析的分析方法。

關于“Frailty模型”的翻譯,有學者譯為“脆弱模型”,但筆者認為有不妥之處。雖然“Frailty”有“脆弱、虛弱等”之意,但是“脆弱模型”所表達出來的意思不能反映“Frailty模型”的本質。結合“Frailty模型”的產生原因與形成思想,筆者反復斟酌,認為譯為“異質性模型”更合適。在沒有規范的譯名情況下,使用“Frailty模型”是最恰當的。

1.Cox DR.Regression models and life tables.JR Stat Soc Series B Stat Methodol,1972,34(2):187-220.

2.M cGilchrist CA,Aisbett CW.Regression with frailty in survival analysis.Biometrics,1991,47:461-466.

3.Therneau TM,Grambsch PM.Modelling survival data:extending the cox model.Springer:New York,2000.

4.Ha ID,Lee Y,MacKenzie G.Model selection for multi-component frailty models.Stat Med.2007,26(26):4790-807.

5.Andersen PK,Klein JP,Knudsen KM,et al.Estimation of variance in Cox′s regressionmodel with shared gamma frailties.Biometrics,1997,53(4):1475-84.

6.Elbers C,Ridder G.True and spurious duration dependence:the identifiability of the proportional hazard model.Review of Econom ic Studies,1982,49(3):403-40.

7.SAS Institute Inc.SAS/STAT?9.3 User′s Guide.Cary,NC:SAS Institute Inc,2011.

8.Elbers C,Ridder G.True and spurious duration dependence:the identifiability of the proportional hazard model.Review of Economic Studies,1982,49(3):403-9.

9.Gail MH,W ieand S,Piantadosi S.Biased estimates of treatment effect in random ized experimentsw ith nonlinear regressions and om itted covariates.Biometrika,1984,71(3):431-44.

10.Yashin AI,Iachine IA,Begun AZ,etal.Hidden frailty:myths and reality.Research report,2001,34,48 pages.

(責任編輯:郭海強)

安徽省自然科學基金(090413126)

1.皖南醫學院預防醫學系(241002)

2.南通出入境檢驗檢疫局

△通信作者:姚應水,E-mail:yingshuiyao@163.com

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