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一株降解咪草煙陰溝腸桿菌的分離與鑒定

2014-03-06 00:53:54牛彥波吳皓瓊曹亞彬
黑龍江科學 2014年10期
關鍵詞:生長

牛彥波,吳皓瓊,殷 博,曹亞彬,安 琦

(1.黑龍江省科學院高技術研究院,哈爾濱150020;2.黑龍江省科學院微生物研究所,哈爾濱150010)

化學除草是現代農業不可分割的一部分,咪草煙(又名咪唑乙煙酸)為大豆田常用的長效廣譜化學除草劑,由于其除草效果好、殺草譜廣、用藥量少、使用方便、用藥成本低,被廣泛應用。雖然因其對后茬作物有較強的藥害,被限制使用,但仍不能禁止。前茬大豆田施用咪唑乙煙酸的地塊,后茬一年內不得改種玉米、小麥、大麥、煙草;一年半內不得改種棉花、向日葵,兩年內不得改種水稻、高梁和谷子;三年內不得改種油菜、馬鈴薯、瓜類和蔬菜;四年內不得改種甜菜、亞麻[1]。研究發現:在不同的土壤中咪草煙的半衰期不同,在偏堿性的土壤中咪草煙的降解速率較快,在酸性、有機質豐富的土壤中咪草煙的降解速率緩慢,其在土壤中的降解主要依賴微生物作用[2,3]。因此篩選獲得高降解活性的咪草煙降解菌尤為重要,本研究從被咪草煙污染的大豆田土壤分離篩選咪草煙降解菌,獲得一株編號為T04細菌,咪草煙的最高降解率達到99.2%,經生化鑒定與分子鑒定,該菌株為陰溝腸桿菌復合菌(Enterobacter cloacaecomplex)。在目前的文獻中還未發現該屬菌株對咪草煙的降解特性,故本研究的發現豐富了咪草煙降解菌范疇。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 土壤

采自黑龍江省訥河市被咪草煙污染的大豆田土壤。

1.1.2 藥品

10%咪草煙水溶劑為市售,咪草煙原藥為98.5%的純度,其他化學藥品均為分析純。

1.1.3 培養基配方

無機鹽培養基:K2HPO40.1 g、CaCO30.04 g、MgSO4·7H2O 0.2 g、NaCl 0.1 g、FeSO4·7H2O 0.001 g、(NH4)2SO40.1g、H2O 1000 mL,pH 7.0 ~7.2。

LB 培養基:牛肉膏 3.0 g 、蛋白胨 10.0 g、NaCl 5.0 g、H2O 1000 mL,pH 7.0 ~7.2。

若制成固體培養基需在上述培養基中加入18.0 g瓊脂粉。滅菌溫度為121℃,20 min。咪草煙的添加量依實驗的具體要求。

1.2 方法

1.2.1 菌株篩選

初篩:將土樣經過風干、粉碎、過篩處理后,稱取5.0 g土樣加入到以咪草煙為唯一碳源和能源的100 mL無機鹽培養基中,該無機鹽培養基中加入10%的咪草煙水劑3 mL,培養溫度30℃,轉數160 r/min經過5~7 d的液體搖床培養。

復篩:將10 mL初篩培養物在復篩培養基中經過連續2次的連續復篩培養,每次均增加無機鹽培養基中咪草煙的含量,咪草煙的添加量依次為5 mL、10 mL。

菌株分離純化:用1 mL無菌吸管吸取1 mL最后一次復篩的培養物,加入到9 mL無菌水中進行10倍稀釋,用1 mL無菌吸管吸取0.1 mL各梯度稀釋液,加入每百毫升含10%咪草煙0.5 mL的固體無機鹽培養平板中,用玻璃刮扒涂勻,在30℃的恒溫培養箱中培養,1~3 d后觀察。挑取生長快的菌落進行劃線分離培養,直至獲得單菌落為止。

菌株功能驗證:將分離得到的單菌落分別再轉入每百毫升含10%咪草煙0.5 mL的無機鹽培養基中和LB培養基中培養,觀察菌株在培養液中的生長情況,并測定發酵液的菌密度OD600值,將生長迅速、菌密度高的培養物再進行劃線分離反復純化與培養,獲得穩定的目標菌株。

1.2.2 T04 菌株的鑒定

菌株生化鑒定采用梅里埃VITEK 2 Compact全自動細菌鑒定及藥敏分析系統,利用 GN板測試。菌株16SrDNA序列測定委托寶生物工程(大連)有限公司進行,結果在NCBI進行比對。結合菌體形態特征、革蘭氏染色等,參照《伯杰細菌鑒定手冊》第8版,及《常見細菌系統鑒定手冊》最終確定種屬關系。

1.2.3 T04 菌株降解能力

菌株在不同培養基上的降解能力比對:用無菌接種環挑取1環T04的斜面純培養物,分別接入每百毫升含純度為98.5%咪草煙0.3 g的無機鹽培養液中和每百毫升含純度為98.5%咪草煙0.5 g的LB培養基中,在30℃、150 r/min振蕩培養2~3 d后,采用液相色譜測定發酵液中的咪草煙殘留量[4],以不加菌的各培養液為CK對照,計算咪草煙的降解率。

菌株在不同咪草煙濃度中的降解:用無菌接種環挑取1環T04的斜面純培養物,分別接入每百毫升含10%咪草煙0.1 mL、0.2 mL、0.4 mL、0.6 mL 的 LB 培養液中,每個3次重復,在30℃、150 r/min振蕩培養2~3 d后,采用液相色譜測定發酵液中的咪草煙殘留量。

2 結果與分析

2.1 菌株篩選

經過高濃度液體富集培養方法,從平板中初步分離得到6株細菌,經過驗證試驗(菌株篩選驗證結果見表1),其中編號T02、T04、T06的3株菌在以咪草煙為唯一碳源和能源的無機鹽培養基中,經振蕩培養4~5 d均可良好生長,說明此3株菌都能夠單一利用咪草煙,進行菌體的繁殖,而其他3株菌在咪草煙的利用方面,表現力弱。在添加了咪草煙的LB培養基中6株菌均能良好生長,但T02、T04、T06的菌密度仍高于其余3株菌,其中T04在2種培養基中的菌密度都最高,說明菌株T04對咪草煙的利用更好,并且菌株的繁殖力更強。故而對T04菌株做進一步的測試工作。

表1 菌株在含咪草煙的不同培養基中的生長情況Tab.1 The growth of strains in different media containing imazethapyr

2.2 T04 菌株鑒定

T04菌株在無機鹽培養基上生長緩慢,而在營養豐富的LB培養基上生長迅速,菌落微黃,扁平,表面濕潤,邊緣整齊,在20×100倍光學顯微鏡下觀察,菌體為短桿狀、無芽孢、G-,無莢膜。生理生化試驗顯示明膠液化緩慢,賴氨酸不脫羧,有精氨酸雙水解酶,甘油或肌醇發酵不產氣,可利用丙二酸鹽作為碳源。結合菌株16SrDNA測序結果,在NCBI上進行比對,繪制T04菌株的系統進化樹,確定T04菌株為陰溝腸桿菌復合菌(Enterobacter cloacae complex)。具體生化反應結果見表2。菌株16SrRNA序列見圖2,菌體照片見圖1。

表2 T04菌株在GN生化板上的反應結果Tab.2 The biochemical reaction results of T04 strain in GN

圖2 T04菌株在NCBI上的系統進化樹Fig.2 The blast tree of T04 based on NCBI

2.3 菌株降解能力

通過表3和表4表明,在無機鹽培養基中T04菌株對咪草煙的降解率比對照(不接菌的培養基)在相同的時間里高51.8%,而在LB培養基中高94.1%,菌株T04在含量超過0.2 mL10%咪草煙LB培養基中的降解率較高,最高達到99.2%,在含0.1 mL10%咪草煙的培養基中的菌株對咪草煙的降解率只有24.5%,這可能是因為發酵液中的咪草煙含量低,不足以對菌株的代謝途徑加以調節,且培養基中的營養物質足以維持菌株繁殖所致,而在添加量超過0.2時菌株的代謝受到咪草煙的調控,可能是咪草煙的添加使菌株的代謝方式有所改變,菌株的活性得到提高,說明適量的咪草煙添加對菌株的生長有利;同時發現菌株的菌密度高,菌株的降解率也高,說明菌株的降解活性高低與菌株的生長密不可分,呈正相關性;并且LB發酵液中豐富的營養不僅對菌株的生長有利,同時也提高了菌株的降解活性。

表3 T04在不同培養基上降解咪草煙效率Tab.3 The imazethapyr degradation efficiency of T04 strain in the different media

表4 在咪草煙不同濃度水平下的降解效率Tab.4 Degradation of imazethapyr at different concentration levels

3 結論

通過咪草煙高濃度、梯度富集培養的方法從咪草煙污染土壤中分離得到6株可利用咪草煙繁殖的細菌,其中3株菌的咪草煙降解能力較穩定,由于T04繁殖力最強,故而對其進行了鑒定,綜合分析后確定菌株T04為陰溝腸桿菌復合菌(Enterobacter cloacae complex)。采用液相色譜對咪草煙殘留量進行分析后發現,在不同的養分環境中,菌株對咪草煙的降解能力差別較明顯,菌株雖可營自養生長,但更適宜異養生活,咪草煙適宜的添加量對菌株的活力有影響,至于影響的深度需要做進一步的研究。這樣的發現也使得菌株的田間應用有了理論的基礎,因為咪草煙在有機質豐富的土壤中難以降解[3],而該菌株的異樣生活方式,使得菌株具有了未來應用的空間。

[1] 常秋紅,黃巧云.大豆田除草劑使用品種及化除技術[J].上海農業科技,2013,(06):139—141.

[2] 黃安太,車軍.咪草煙在不同土壤和水體中的殘留動態研究[J].安徽農業科學,2007,35(33):10769—10770.

[3] 李宏園,陶波.除草劑咪唑乙煙酸在土壤中的歸趨[C]∥長春:雜草科學與環境及糧食安全.2004:416—420.

[4] 周艷明,張寒松.反相高效液相色譜法檢測大豆中咪草煙[J].食品科學,2010,31(08):237—240.

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