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DNA轉(zhuǎn)錄不需要“單獨(dú)的”解旋酶

2013-01-01 00:00:00張志亮
中學(xué)生物學(xué) 2013年2期

摘要:通過(guò)對(duì)教材及文獻(xiàn)資料的分析論證了DNA轉(zhuǎn)錄不需要“單獨(dú)的”解旋酶,以求解決目前困擾教師和學(xué)生們的這一爭(zhēng)議問(wèn)題。

關(guān)鍵詞:DNA轉(zhuǎn)錄 RNA聚合酶 解旋酶

中圖分類(lèi)號(hào):Q-49 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:E

DNA轉(zhuǎn)錄需要還是不需要“單獨(dú)的”解旋酶,這是目前教師們和學(xué)生及資料中都很有爭(zhēng)議的一個(gè)問(wèn)題。結(jié)合筆者的理解及文獻(xiàn)資料分析認(rèn)為轉(zhuǎn)錄不需要“單獨(dú)的”解旋酶。

1、教材中沒(méi)提到,因此不能說(shuō)DNA轉(zhuǎn)錄需要“單獨(dú)的”解旋酶

人教版高中生物必修2《遺傳與進(jìn)化》教材中第54頁(yè)講DNA復(fù)制時(shí)在解旋酶的作用下,把兩條螺旋的雙鏈解開(kāi),而在講DNA轉(zhuǎn)錄時(shí)課本中第63頁(yè)只提到RNA聚合酶。有些教師類(lèi)比DNA復(fù)制認(rèn)為DNA轉(zhuǎn)錄也要解旋酶的作用是不對(duì)的。

2、教師用書(shū)及安徽卷考試說(shuō)明中指出是RNA聚合酶將DNA雙螺旋兩條鏈之間的氫鍵斷開(kāi)

必修2《教師用書(shū)))P99:基因的轉(zhuǎn)錄是由RNA聚合酶催化進(jìn)行的?;虻纳嫌尉哂薪Y(jié)合RNA聚合酶的區(qū)域,叫做啟動(dòng)子。啟動(dòng)子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特異性結(jié)合的位點(diǎn),決定了基因轉(zhuǎn)錄的起始位點(diǎn)。RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合后,在特定區(qū)域?qū)NA雙螺旋兩條鏈之間的氫鍵斷開(kāi),使DNA解旋,形成單鏈區(qū),以非編碼鏈為模板合成RNA互補(bǔ)鏈的過(guò)程就開(kāi)始了。從此處可以看出是RNA聚合酶將DNA雙螺旋兩條鏈之間的氫鍵斷開(kāi),所以不需要“單獨(dú)的”解旋酶。另2012年普通高等學(xué)校招生全國(guó)統(tǒng)一考試安徽卷考試說(shuō)明中提到:DNA復(fù)制時(shí),雙鏈打開(kāi)形成單鏈,需要解旋酶的幫助;RNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,聚合酶中也有亞基擔(dān)負(fù)解鏈功能。從此處可以看出是RNA聚合酶中也有亞基擔(dān)負(fù)解鏈功能,所以也是不需要“單獨(dú)的”解旋酶。

3、資料文獻(xiàn)中提及DNA轉(zhuǎn)錄不需要“單獨(dú)的”解旋酶

3.1 DNA復(fù)制時(shí),需要單獨(dú)的解旋酶

DNA雙螺旋的解旋需要DNA解旋(鏈)酶(DNAhelicase,DNA Unwinding enzyme),DNA解鏈酶能通過(guò)水解ATP獲得能量來(lái)解開(kāi)雙鏈DNA。大部分DNA解鏈酶(包括大腸桿菌解鏈酶Ⅱ、Ⅲ、T4噬菌體dda、T4基因41和人解鏈酶等)可沿滯后模板的5’→3’方向并隨著復(fù)制叉的前進(jìn)而移動(dòng),只有另一種解鏈酶(Rep蛋白)是沿前導(dǎo)鏈模板的3’→5’方向移動(dòng)。因此推測(cè)Rep蛋白和特定DNA解鏈酶分別在DNA的兩條母鏈上協(xié)同作用以解開(kāi)雙鏈DNA。在DNA不連續(xù)復(fù)制過(guò)程中,DNA解鏈酶結(jié)合于復(fù)制叉前面,催化DNA雙鏈結(jié)構(gòu)解鏈,并具有ATP的酶活性酶,兩種活性相互偶聯(lián),通過(guò)水解ATP提供解鏈的能量。不同來(lái)源的DNA解旋酶的共同特性是通過(guò)水解ATP提供解鏈的能量,而復(fù)制叉結(jié)構(gòu)的存在與否對(duì)活性的影響因酶而異。DNA復(fù)制時(shí),雙鏈打開(kāi)形成單鏈,需要單獨(dú)的解旋酶的幫助;RNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,不需要單獨(dú)的解旋酶的幫助。

3.2 RNA聚合酶有解鏈功能

3.2.1 原核生物RNA聚合酶有直接解鏈功能

大多數(shù)原核生物RNA聚合酶的組成是相同的,大腸桿菌RNA聚合酶由2個(gè)α亞基、1個(gè)β亞基、1個(gè)β’亞基和1個(gè)ω亞基組成,稱為核心酶。加上1個(gè)σ亞基后則成為聚合酶全酶,相對(duì)分子質(zhì)量為4,65×105(表1)。研究發(fā)現(xiàn),由β和β’亞基組成聚合酶的催化中心,它們?cè)谛蛄猩虾驼婧松颮NA聚合酶的兩個(gè)大亞基有同源性。β亞基能與模板DNA、新生RNA鏈及核苷酸底物相結(jié)合。

σ因子可以極大地提高RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)子區(qū)DNA序列的親和力,加入盯因子以后,RNA聚合酶全酶識(shí)別啟動(dòng)子序列的特異性總共提高了107倍。資料顯示原核生物RNA聚合酶有直接解鏈功能。

3.2.2 真核生物RNA聚合酶有解鏈功能

真核生物的RNA聚合酶分三類(lèi):RNA聚合酶I存在于核仁中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物rRNA;RNA聚合酶Ⅱ存在于核質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA;RNA聚合酶Ⅲ存在于核質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物tRNA。真核生物RNA聚合酶一般有8~14個(gè)亞基所組成,相對(duì)分子質(zhì)量超過(guò)5×105。轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程包括:模板識(shí)別/啟動(dòng)子的選擇、轉(zhuǎn)錄起始、通過(guò)啟動(dòng)子及轉(zhuǎn)錄的延伸和終止。模板識(shí)別階段主要指RNA聚合酶與啟動(dòng)子DNA雙鏈相互作用并與之相結(jié)合的過(guò)程。轉(zhuǎn)錄起始前,啟動(dòng)子附近的DNA雙鏈分開(kāi)形成轉(zhuǎn)錄泡以促使底物核糖核苷酸與模板DNA的堿基配對(duì)。真核生物RNA聚合酶Ⅱ所形成的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物除了RNA聚合酶之外,真核生物轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程中至少還需要7種輔助因子參與,如TBP、TFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIF和TFIIH。酶與啟動(dòng)子區(qū)的結(jié)合,在RNA聚合酶與啟動(dòng)子相互作用的過(guò)程中,聚合酶首先與啟動(dòng)子區(qū)閉合雙鏈DNA相結(jié)合,形成二元閉合復(fù)合物,然后經(jīng)過(guò)解鏈得到二元開(kāi)鏈復(fù)合物。從中可以看出轉(zhuǎn)錄實(shí)際上是RNA聚合酶、轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子和啟動(dòng)子區(qū)各種調(diào)控元件相互作用的結(jié)果,不需要“單獨(dú)的”解旋酶。

3.3 從酶的化學(xué)組成來(lái)看RNA聚合酶具有解鏈功能

從化學(xué)組成來(lái)看酶可分為單純蛋白酶和綴合蛋白酶兩類(lèi)。單純蛋白酶僅有蛋白質(zhì)構(gòu)成,其酶活性由蛋白質(zhì)決定。例:脲酶,淀粉酶,溶菌酶。綴合蛋白酶類(lèi),除了蛋白質(zhì)外,還要結(jié)合一些對(duì)熱穩(wěn)定的非蛋白質(zhì)小分子物質(zhì)或金屬離子,前者稱為脫輔酶,后者稱為輔因子,兩者形成的復(fù)合物稱為全酶,即全酶=脫輔酶+輔因子,兩者各自單獨(dú)存在均無(wú)催化作用。從以上可以看出原核生物的RNA聚合酶就可以完成轉(zhuǎn)錄;在真核細(xì)胞中,RNA聚合酶通常不能單獨(dú)發(fā)揮轉(zhuǎn)錄作用,而需要與其他轉(zhuǎn)錄因子共同協(xié)作,具有輔助功能的輔助因子與RNA聚合酶構(gòu)成全酶,不需要“單獨(dú)的”解旋酶。這些輔助功能的輔助因子不能算“單獨(dú)的”解旋酶。

綜上所述可以看到原核生物RNA聚合酶有直接解鏈功能;在真核生物中,RNA聚合酶與輔助因子構(gòu)成全酶才有解鏈功能,但都不需要“單獨(dú)的”解旋酶。

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