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大腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中基因mRNA表達(dá)及其臨床意義

2012-11-05 09:23:30趙金偉王鐘林
關(guān)鍵詞:檢測

趙金偉,李 韜,馬 震,董 強(qiáng),王鐘林*

(1.吉林省人民醫(yī)院 急 診外科;2.吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)院09級,吉林 長 春130021)

幾項(xiàng)有關(guān)糞便基因mRNA檢測技術(shù)在結(jié)直腸癌診斷中的研究報告表明,采用RT-PCR技術(shù)檢測結(jié)直腸癌病人糞便基因的異常表達(dá)對結(jié)直腸癌診斷率較高,但關(guān)于CD44、COX-2、CK-20m RNA在病灶及糞便中表達(dá)是否具有同源性,能否作為CRC的診斷標(biāo)記物有待于研究。

本實(shí)驗(yàn)的目的是通過對COX-2,CK-20,CD44v6m RNA在結(jié)直腸原發(fā)灶及病人糞便中的表達(dá),證實(shí)糞便中COX-2,CK-20,CD44v6mRNA表達(dá)來源于原發(fā)灶腫瘤細(xì)胞的脫落所致,為臨床結(jié)直腸癌篩查選擇合適的多基因標(biāo)記物聯(lián)合檢測指標(biāo)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 臨床資料 收集吉林省人民醫(yī)院及吉林省腫瘤醫(yī)院2008年1月-2010年2月行結(jié)直腸癌根治術(shù)的結(jié)直腸癌原發(fā)灶38例,所有患者術(shù)前均未行抗腫瘤治療,其中,男性20例,女性18例,年齡42-81歲,平均年齡62歲,Duke's A、B期13例,Duke's C、D期25例。分化程度:高中分化15例,未、低分化23例。患者術(shù)前2-3天在醫(yī)生指導(dǎo)下用帶蓋糞便標(biāo)本盒收集糞便標(biāo)本,在2小時內(nèi)送于實(shí)驗(yàn)室,分裝后-80℃保存,對術(shù)中切除的病變標(biāo)本切取一部分置于標(biāo)本盒內(nèi),置于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩<S便標(biāo)本均為服藥前或灌腸前留取標(biāo)本。

1.1.2 糞便標(biāo)本的預(yù)處理 糞便標(biāo)本解凍后,取成形糞便標(biāo)本3-5克或水樣便100毫升加入100毫升液基細(xì)胞保存液100毫升攪拌均勻后,依次經(jīng)過100目篩網(wǎng),200目篩網(wǎng),1200轉(zhuǎn)/分(rpm)離心10min后棄去上清液,加提取液重懸沉淀至50毫升,過300目篩網(wǎng),1200轉(zhuǎn)/分(rpm)離心10min后棄去上清液,取沉淀加入液基細(xì)胞保存液1.5毫升置于1.5ml Eppendorf管中,上述標(biāo)本處理1小時完成,并置于-80℃冰箱中保存。

1.2 PT-PCR法檢測結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中基因mRNA表達(dá)

1.2.1 總RNA的提取 用DEPC嚴(yán)格處理實(shí)驗(yàn)器材以防止RNA酶污染。解凍組織標(biāo)本或糞便預(yù)處理后的標(biāo)本,研磨后加入PBS洗滌,1000 rpm,5分鐘,棄上清 →加1ml Trizol,室溫放置5分鐘,轉(zhuǎn)到EP管加0.2 ml氯仿重懸沉淀,劇烈振搖,室溫靜置5 min→4℃12000 rpm,離心15 min→上層水相移至另一EP管(寧少勿多)→加入0.5 ml冰異丙醇→充分混勻,室溫放置10 min→4℃12 000 rpm,離心15 min,去上清→加入75%冰乙醇-DEPC1 ml,振搖洗滌沉淀→4℃12000 rpm,離心10 min,棄上清→去乙醇,空氣中干燥RNA→加DEPC水(10-50μl),溶解RNA→所得的總RNA置于-80℃冰箱保存。

1.2.2 RNA純度及完整性檢測 取RNA樣品用紫外-可見光分光光度計于260 nm、280 nm處測定A值,計算RNA濃度和RNA定量。取RNA樣品進(jìn)行甲醛變性,1%瓊脂糖凝膠電泳,拍照,用光密度掃描儀掃描28s和18s條帶,計算密度比值。

1.2.3 引物設(shè)計[1-3]實(shí)驗(yàn)所需引物及內(nèi)參照βactin引物均系上海生工生物工程公司合成,經(jīng)Genebank檢索為特異性引物。DNA Marker采用寶生物工程有限公司DL2000 Marker。

1.2.4 RT-PCR技術(shù)檢測COX-2,CK-20,CD44v6 m RNA表達(dá)

①逆轉(zhuǎn)錄

RNA 4μl+Oligod T 2μl+DEPC 10μl—72℃,5分鐘,變性模板RNA—迅速放置冰上,復(fù)性模板RNA—5×buffer 5μl+10 m Md NTP 2μl+25u/μl Rnasin 1μl+200 u/μl mmlv 1μl—42℃,1 h—94℃,5 min—冰上,5 min,置-80℃儲存。

②聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

反應(yīng)體系:滅菌去離子水32μl;10×PCR buffer 5μl;10 mmol/Ld NTP 1μl;10pmol上游引物1 μl;10pmol下游引物1μl;cDNA(0.1 ug/μl)1μl。

③Taq DNA 聚合酶(2u/μl)0.2μl增條件

β-actin:取cDNA 2μl,加入10×Bufer 2μl,25 mmol/L氯化鎂溶液 1.2μl,Taq 酶 1 U,22.5 mmol/L d NTPs 0.16μl,β-actin引物0.1μg,加去離子水至20μl進(jìn)行PCP擴(kuò)增。每次設(shè)一管不加樣品cDNA為陰性對照。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30s,56℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30循環(huán),72℃延長7 min。基因擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠(含0.1%溴化乙啶)電泳,拍照。

目的基因:逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2μl,加入10×PCR Bufer 3μl,目的基因引物20 pmol,β-actin引物4 pmol,Taq DNA酶1 U,DEPC處理過的水至30μl。反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性2 min,95℃變性1 min,60℃退火1 min,72℃延伸1 min,共45循環(huán)。基因擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠(含0.1%溴化乙啶)電泳,拍照。

1.2.5 結(jié)果判定 圖片中出現(xiàn)305 bp、370 bp、125 bp的條帶分別為COX-2、CK-20及 CD44v6 mRNA表達(dá)陽性。

1.3 統(tǒng)計學(xué)處理

采用χ2檢驗(yàn),應(yīng)用統(tǒng)計軟件SPSS10.0處理,P<0.05為具有顯著性差異。

2 結(jié)果

2.1 COX-2mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的表達(dá)

COX-2mRNA在癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中均可表達(dá),在癌原發(fā)灶組織中COX-2m RNA表達(dá)的陽性率為57.9%(22/38);COX-2mRNA 在癌患者糞便中表達(dá)的陽性率為47.4%(18/38);COX-2mRNA在癌原發(fā)灶及糞便中同時陽性表達(dá)率為44.7%(17/38),同時陰性表達(dá)率為39.5%(15/38),同源性為84.2%(32/38);同源性與異源性相比,差異具有顯著性,p=1.5×10-5。如表1所示。

表1 COX-2mRNA在結(jié)腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的表達(dá)

2.2 CK-20mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的表達(dá) CK-20mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中均可陽性表達(dá),在結(jié)直腸癌原發(fā)灶組織中CK-20mRNA表達(dá)的陽性率為52.6%(20/38);CK-20m RNA在糞便標(biāo)本中的陽性表達(dá)率為55.3%(21/38);CK-20mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便中同時陽性表達(dá)率為44.7(17/38);36.8%(14/38)同時無表達(dá),同源性為81.5%(31/38),同源性與異源性相比,差異具有顯著性,P=0.0001。如表2所示。

表2 CK-20mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的同源性表達(dá)

2.3 CD44v6mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的表達(dá) CD44v6m RNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中均有較高的陽性表達(dá),在結(jié)直腸癌原發(fā)灶組織中CD44v6m RNA表達(dá)的陽性率為55.3%(21/38);CD44v6mRNA在糞便標(biāo)本中的表達(dá)陽性率為50.0%(19/38);CD44v6mRNA 在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中同時陽性表達(dá)率為50(19/38);44.7%(17/38)同時無表達(dá),同源性為94.7%(36/38),同源性與異源性相比,差異具有顯著性,P=1.8×10-8。如表3。

表3 CD44v6mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的同源性表達(dá)

3 討論

結(jié)直腸癌(CRC)是消化道常見的惡性腫瘤,對CRC的研究表明,CRC的癌變機(jī)制和篩選方法是目前消化道腫瘤中最為明確和完善的,在易感人群中進(jìn)行篩查是CRC的主要防治策略之一,業(yè)已證實(shí),CRC篩查可以明顯減少CRC的發(fā)生,并且,早期診斷及治療可明顯提高患者的生存率。對于結(jié)直腸癌病人的篩查,未來的熱點(diǎn)是在非腸道準(zhǔn)備下易被患者接受的檢查[4]。糞便基因檢測法是檢測患者糞便基因的改變,無侵襲性、無需特殊準(zhǔn)備、且可檢查整個大腸病變,是目前無創(chuàng)性篩查大腸腫瘤病變的研究熱點(diǎn)。

目前,糞便基因mRNA標(biāo)記物的研究剛剛起步,日本學(xué)者對糞便COX-2mRNA檢測分析發(fā)現(xiàn),COX-2m RNA表達(dá)對結(jié)腸癌診斷的敏感性和特異性分別為90%,100%。但 Wai K等[1]研究顯示,COX-2m RNA表達(dá)在結(jié)直腸癌中的陽性率僅為50%,腺瘤僅為4%,因此,糞便基因mRNA表達(dá)大腸癌診斷有待于進(jìn)一步研究,聯(lián)合檢測糞便多個基因m RNA表達(dá)是否能夠用于大腸癌的篩查也有待于進(jìn)一步研究。目前尚未見有關(guān)文獻(xiàn)報道結(jié)直腸癌患者糞便相關(guān)基因m RNA表達(dá)與結(jié)直腸癌原發(fā)灶腫瘤的相關(guān)性,二部位基因mRNA表達(dá)是否具有同源性等有待于進(jìn)一步證實(shí),本實(shí)驗(yàn)采RT-PCR技術(shù)對38例結(jié)直腸癌患者的原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中的COX-2,CK-20及 CD44v6mRNA 表達(dá)進(jìn)行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn),COX-2,CK-20及 CD44V6m RNA 均可表達(dá)于腫瘤原發(fā)灶及患者糞便標(biāo)本中,COX-2mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中同時陽性表達(dá)率為44.7%(17/38),同時陰性表達(dá)率為 39.5%(15/38),同源性表達(dá)率為84.2%(32/38),與異源性表達(dá)相比,差異具有顯著性,P=1.5×10-5,結(jié)果提示,結(jié)直腸癌糞便患者標(biāo)本COX-2m RNA表達(dá)與結(jié)直腸癌原發(fā)灶COX-2mRNA表達(dá)密切相關(guān),糞便標(biāo)本COX-2m RNA表達(dá)主要來源于結(jié)直腸癌原發(fā)灶脫落細(xì)胞的COX-2mRNA,因此,檢測糞便標(biāo)本COX-2m RNA表達(dá)可以替代原發(fā)灶COX-2mRNA表達(dá),作為結(jié)直腸癌的一種無創(chuàng)性的糞便基因標(biāo)記物。Yamauchi等[5]的研究發(fā)現(xiàn),COX-2在正常大腸上皮細(xì)胞中幾乎完全不表達(dá),在腺瘤中表達(dá)有所增加,而在大腸癌組織中高表達(dá),提示COX-2的高表達(dá)可能參與了大腸癌的發(fā)生。因糞便標(biāo)本COX-2m RNA在結(jié)直腸癌中的陽性率僅為47.4%(18/38),為提高糞便標(biāo)本基因m RNA表達(dá)檢測診斷結(jié)直腸癌的檢出率,本實(shí)驗(yàn)對糞便標(biāo)本 CK-20,CD44v6m RNA表達(dá)進(jìn)行了同樣的研究,CK-20m RNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中均可陽性表達(dá),在原發(fā)灶中的陽性率為52.6%(20/38),在糞便 標(biāo) 本 中 的 表 達(dá) 率 為 55.3% (21/38),CK-20m RNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中同時陽性表達(dá)率為44.7%(17/38),36.8%(14/38)同時無表達(dá),同源性為81.5%(31/38),同源表達(dá)率與異源性相比,差異具有顯著性,P=0.0001。結(jié)果提示,結(jié)直腸癌患者糞便標(biāo)本CK-20m RNA表達(dá)與結(jié)直腸癌原發(fā)灶CK-20mRNA表達(dá)密切相關(guān),糞便標(biāo)本CK-20m RNA表達(dá)來源于結(jié)直腸癌脫落細(xì)胞的CK-20m RNA表達(dá),因此,檢測糞便標(biāo)本CK-20mRNA表達(dá)可以替代原發(fā)灶CK-20mRNA表達(dá),作為結(jié)直腸癌的無創(chuàng)性基因標(biāo)記物。既往研究表明,CK-20不同于其它的角蛋白,非常局限于胃腸上皮細(xì)胞,幾乎所有的結(jié)直腸癌均明顯表達(dá),且在侵襲,轉(zhuǎn)移,擴(kuò)散到其它組織時始終保持穩(wěn)定。但Stefan Wildi等[6]的研究認(rèn)為,對41例結(jié)直腸癌采用Northern雜交技術(shù),免疫組化及原位雜交技術(shù)檢測CK-20表達(dá),發(fā)現(xiàn)病灶CK-20表達(dá)不及正常對照組強(qiáng),為此,本實(shí)驗(yàn)采用RT-PCR技術(shù)檢測結(jié)直腸癌原發(fā)灶及癌旁正常粘膜組織的CK-20mRNA表達(dá),發(fā)現(xiàn)癌灶CK-20mRNA表達(dá)呈強(qiáng)陽性,而正常粘膜組織呈弱陽性或陰性,與Stefan Wildi的實(shí)驗(yàn)結(jié)果不符,有待于進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究。采用 RT-PCR技術(shù)對CD44v6m RNA表達(dá)進(jìn)行檢測分析,發(fā)現(xiàn)CD44v6mRNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中均有較高的陽性表達(dá),CD44v6 m RNA在結(jié)直腸癌原發(fā)灶中的陽性表達(dá)率為55.3%(21/38),在糞便標(biāo)本中的陽性表達(dá)率為50%(19/38),在原發(fā)灶及糞便標(biāo)本中同時陽性表達(dá)率為50%(19/38),44.7%(17/38)同時無表達(dá),同源性為94.7%(36/38),同源性與異源性相比,差異具有顯著性,P=1.8×10-8,結(jié)果提示,結(jié)直腸癌患者糞便標(biāo)本CD44v6mRNA表達(dá)與結(jié)直腸癌原發(fā)灶CD44v6m RNA表達(dá)密切相關(guān),糞便標(biāo)本CD44v6mRNA表達(dá)來源于原發(fā)灶脫落細(xì)胞的CD44v6m RNA。Wong等[7]報道,結(jié)直腸癌組織及轉(zhuǎn)移組織內(nèi)都有CD44變異的過度表達(dá),而在正常的結(jié)直腸細(xì)胞內(nèi)未見CD44v6表達(dá)[8]。Yamao等[9]采用RT-PCR和Southern blot技術(shù)檢測糞便脫落細(xì)胞,在所有正常及結(jié)直腸癌病例中均檢測到CD44s,而CD44v6和CD44v10在結(jié)腸癌術(shù)前陽性率分別為68%和60%,術(shù)后陽性率明顯下降,分別為12%和28%,CD44v6分子的表達(dá)在術(shù)后轉(zhuǎn)陰率為88.2%,CD44v10的轉(zhuǎn)陰率為 80%,并且CD44v6和CD44v10均可在Dukes A期患者術(shù)前糞便中檢出。Tatin[10]采用同樣的手段檢測體液,瘺液,糞便及尿液中CD44基因時,發(fā)現(xiàn)它們具有同樣的敏感性。

本研究表明,CD44、COX-2、CK-20m RNA 在結(jié)直腸癌病人原發(fā)灶及糞便中表達(dá)具有較高的同源性,通 過 檢 測 糞 便 標(biāo) 本 中 CD44、COX-2、CK-20m RNA表達(dá)替代檢測原發(fā)灶中CD44、COX-2、CK-20m RNA表達(dá)用于腫瘤的診斷、預(yù)后等,但能否作為CRC的診斷標(biāo)記物有待于研究。

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