999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

肺結(jié)核病人血清差異蛋白的分離及鑒定

2012-10-09 03:56:20李翠萍胡天橋農(nóng)炳金胡水秀鄭艷燕周昌明
中國實驗診斷學(xué) 2012年9期
關(guān)鍵詞:血清

李翠萍,胡天橋,農(nóng)炳金,臧 寧,周 怡,胡水秀,鄭艷燕,周昌明,何 敏

(1.廣西醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,廣西 南寧530021;2.廣西醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)實驗中心,廣西 南寧530021;3.廣西龍?zhí)夺t(yī)院,廣西 柳州545001;4.廣西疾病預(yù)防控制中心,廣西 南寧530021)

痰涂片是作為活動性結(jié)核病簡單又快速的檢測方法,僅適用于細菌量大于104的痰樣本[1],涂片陰性和潛伏感染的肺結(jié)核病人的檢測成為結(jié)核病預(yù)防、控制和治療的一大難題。因此,通過檢測除了痰液之外的其他臨床樣本比如血液、尿液等來尋找結(jié)核病快速和可靠的診斷方法成為了很多研究的熱點。本研究的前期工作中,利用SELDI技術(shù)篩選出6個肺結(jié)核病人血清差異表達蛋白構(gòu)建診斷模型,明顯提高結(jié)核病診斷的靈敏度與特異度(另文發(fā)表),這6個血清差異表達蛋白分子量分別為M4953.58、M4748.18、M4895.39、M4480.14、M6933.89、M8778.35,其中 M4480.14、M8778.35在肺結(jié)核病人血清中低表達。本研究的目的在于分離、鑒定診斷模型中目標蛋白。

1 材料和方法

1.1 血清標本來源 結(jié)核組:6例肺結(jié)核病人(男3,女3,平均年齡35歲),均為2008年9月在廣西南寧市第四人民醫(yī)院確診的住院病人,經(jīng)痰結(jié)核菌檢查陽性(包括涂片或培養(yǎng));胸部X線檢查有典型的活動性結(jié)核病變表現(xiàn);臨床診斷為結(jié)核病并且排除合并其他疾病的病例。正常對照組:6例正常人(男3,女3,平均年齡38歲),為同時期廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院體檢中心的健康體檢者,既往無與肺結(jié)核病類似的呼吸系統(tǒng)疾患,胸部CT檢查未見異常,無消化系統(tǒng)疾患,在全身體檢中未發(fā)現(xiàn)任何疾病。

1.2 實驗方法

1.2.1 樣品的收集 所有血樣均于清晨空腹采集,用無抗凝劑的5ml普通采血試管,冰上分裝血清并-80℃低溫保存。

1.2.2 Tricine-SDS-PAGE 電泳分離差異表達蛋白 分別等體積混合6例正常人血清和6例肺結(jié)核病人血清,將混好的樣品經(jīng)過兩倍的乙腈、離心和凍干處理后,取20μl加尿素的Tricine-SDS-PAGE檢測。切取差異條帶,膠內(nèi)酶解樣品。

1.2.3 LC-MS/MS鑒定差異表達蛋白 消化好的樣品用C18反相柱(美國Agilent公司)分離并進行串聯(lián) LCQ-DECA-XP(Thermo Finnigan公司)plus電噴霧離子阱質(zhì)譜鑒定。多肽離子檢測范圍為400-2000amu,隨后進行二級質(zhì)譜鑒定。二級質(zhì)譜數(shù)據(jù)用SEQUEST (Bioworks 3.0)軟件進行檢索。搜索使用的蛋白數(shù)據(jù)庫為ipi.HUMAN.v3.36蛋白庫。SEQUEST結(jié)果過濾參數(shù)為:當Charge+1,Xcorr≥1.9;當Charge+2,Xcorr≥2.2;當Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1。

2 結(jié)果

2.1 Tricine-SDS-PAGE電泳分離 對經(jīng)乙腈沉淀法處理后的肺結(jié)核病人和正常人血清樣本進行3次重復(fù)電泳圖,蛋白質(zhì)條帶的重復(fù)性較好。圖1顯示其中一張血清電泳圖譜,14.4KD以下小分子量蛋白條帶清昕可見,箭頭所指條帶在正常人血清的濃度明顯高于肺結(jié)核患者血清且分子量小于6.5kD,與前期診斷模型中潛在標志蛋白M4480.14分子量分布范圍和表達水平均一致。對這一條帶切膠酶解后質(zhì)譜鑒定。

圖1 Tricine-SDS-PAGE電泳分離圖

2.2 串聯(lián)LCQ-DECA plus電噴霧離子阱質(zhì)譜鑒定

按照方法1.2.4設(shè)置SEQUEST過濾參數(shù)共鑒定出12個蛋白,圖2顯示的是質(zhì)譜鑒定Basepeak圖及其中一個母離子的二級質(zhì)譜圖。在這12個蛋白中apolipoprotein C-I precursor可信度最高,覆蓋率達39.76%,且有5個不重復(fù)的肽段被鑒定(如表1所示)。

圖2 蛋白條帶的質(zhì)譜鑒定圖

2.3 目的蛋白的確定及其生物信息學(xué)分析 在NCBI蛋白數(shù)據(jù)庫里搜索人類apolipoprotein C-I precursor的氨基酸序列為82個氨基酸。本研究所鑒定到的5個不重復(fù)肽段,分布于第36-75位之間的40 個氨基 酸。查 詢 http://www.expasy.ch/tools/#proteome網(wǎng)站發(fā)現(xiàn)這40個氨基酸組成的多肽存在多個酶切位點,其中酶切片段efgntledkarelisrikqselsakmrewfsetfqkv理論分子量為4433.02Da,與本研究SELDI篩選出6個肺結(jié)核病人血清差異表達蛋白構(gòu)建診斷模型中潛在標志蛋白4480.14Da分子量非常接近,因而判斷SELDI檢測到4480.14Da潛在標志蛋白可能為apo C-I的酶解片段。

表1 Apo C-I肽段匹配情況

3 討論

質(zhì)譜技術(shù)鑒定蛋白的發(fā)展激起人們發(fā)現(xiàn)和鑒定結(jié)核病新的標志物的興趣。蛋白鑒定的重要意義性在于每一個蛋白都具有可以改變的細胞功能,與結(jié)核有密切聯(lián)系的蛋白,在疾病狀態(tài)時發(fā)生改變并可能釋放進入血液中,鑒定血清中的這些蛋白有助于闡明結(jié)核病發(fā)病機理,使尋找結(jié)核病標志物成為可能。

利用蛋白質(zhì)組技術(shù)研究血清標志物受到血清中高豐度蛋白蛋白的影響,正常人血清中的20余種高豐度蛋白占血清總蛋白的99%以上,其余的上千種可能與疾病診斷密切相關(guān)的小分子蛋白含量甚微[2-4],同時,血清中蛋白質(zhì)濃度的動態(tài)范圍變化很大,至少達到109數(shù)量級,因而很難在最大辨別幅度僅為104聚丙烯酰胺凝膠上得以顯示,眾多高中豐度蛋白的存在必然嚴重干擾小分子蛋白質(zhì)的分離[5]。因此高豐度蛋白的去除和低豐度蛋白的富集己成為血清樣品處理中的首要步驟,通過這個步驟可明顯提高低豐度蛋白質(zhì)的上樣量、色譜分離的峰容量和質(zhì)譜檢測的動態(tài)范圍等[6-9]。有研究表明與其他有機溶劑相比,乙腈沉淀法是一種去除高豐度蛋白重復(fù)性和效果最好的方法,在血清中加入兩倍的乙腈,能夠有效的破壞小分子蛋白與白蛋白的結(jié)合,降低生物標志物丟失的可能[10]。CHERTOV[10]等亦用高效液相串聯(lián)電噴霧質(zhì)譜的方法發(fā)現(xiàn)血清用乙腈沉淀后能發(fā)現(xiàn)更多小分子量蛋白和肽峰,得出此方法能使結(jié)合在白蛋白等載體蛋白的小分子蛋白和肽分開的結(jié)論。同樣地,Richard[11]也指出乙腈沉淀法能夠簡便、快速地、重復(fù)性好地去除血清中高豐度蛋白,已經(jīng)成為一種普遍應(yīng)用的質(zhì)譜鑒定的前期處理方法。本研究通過乙腈沉淀法處理血清樣品,電泳結(jié)果清晰地呈現(xiàn)了10KD以下小分子蛋白條帶。

在結(jié)核病血清標志物的鑒定方面已有一些報道,比如,Agranoff等[12]鑒定出2個最有鑒別力的標志物,一個是血清淀粉A,另一個是轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白。吳雪瓊等[13]采用SELDI技術(shù)篩選肺結(jié)核差異蛋白并采用 C18-HPLC 分離和 MALDI-TOF-MS跟蹤方法,成功地對質(zhì)荷比峰為5643m/z的蛋白進行了分離、純化,并應(yīng)用LC-MS/MS鑒定為粘蛋白。本研究經(jīng)過3次的SDS-PAGE分離肺結(jié)核患者和健康人血清蛋白質(zhì),均發(fā)現(xiàn)一條分子量小于6.5KD的差異蛋白質(zhì)條帶,LC-MS/MS鑒定為apo C-I蛋白的酶解片段。Apo C-I是載脂蛋白A家族中組分之一,在血清中含量較低,關(guān)于其在體內(nèi)確切的生物學(xué)功能尚不清楚。近年來,有人曾報道apo C-I是結(jié)腸直腸癌、前列腺癌和肝纖維化的潛在血清標志物[14-16],但其與肺結(jié)核的關(guān)系尚未得知。近期不少研究者研究結(jié)果證實肺結(jié)核病的發(fā)生、發(fā)展與載脂蛋白有著相 當 密 切 的 關(guān) 系[11,17,18],說 明 載 脂 蛋 白 類代謝途徑與結(jié)核病的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。大多數(shù)的肺結(jié)核病人都會出現(xiàn)消瘦,乏力等癥狀,這些癥狀或許跟脂類代謝失調(diào)有關(guān),Perez[19]等已證實肺結(jié)核病人血清的總膽固醇水平低于正常人。Deniz[20]等發(fā)現(xiàn)肺結(jié)核病人組的血清膽固醇、甘油三脂、高密度脂蛋白復(fù)合物,低密度脂蛋白復(fù)合物的濃度顯著低于正常人,其中上述指標涂陽病人又低于非涂陽的,開放性肺結(jié)核又低于涂陽的。同時有研究表明[18]apo C-I結(jié)構(gòu)、水平與功能的異常與人的脂類代謝失調(diào)的疾病有關(guān),在高甘油三酯血癥中起著重要的作用,因此apo C-I很可能與肺結(jié)核的發(fā)生發(fā)展有關(guān),可能是結(jié)核病血清潛在標志物之一。

[1]Liu Q,Chen X,Hu C,et al.Serum protein profiling of smear-positive and smear-negative pulmonary tuberculosis using SELDITOF mass spectrometry[J].Lung,2010,188(1):15.

[2]Anderson NL,Anderson NG.The human plasma proteome:history,character,and diagnostic prospects[J].Mol Cell Proteomics,2002,1(11):845.

[3]Chertov O,Simpson JT,Biragyn A,et al.Enrichment of low-molecular-weight proteins from biofluids for biomarker discovery[J].Expert Rev Proteomics,2005,2(1):139.

[4]Tirumalai,RS,Chan KC,Prieto DA,et al.Characterization of the low molecular weight human serum proteome[J].Mol Cell Proteomics,2003,2(10):1096.

[5]Diamandis EP.Mass Spectrometry as a diagnostic and a cancer biomarker discovery tool-Opportunities and potential limitations[J].Mol Cell Proteomics,2004,3(4):367.

[6]Bjorhall K,Miliotis T,Davidsson P.Comparison of different depletion strategies for improved resolution in proteomic analysis of human serum samples[J].Proteomics,2005,5(1):307.

[7]Dekker LJ,Bosman J,Burgers PC,et al.Depletion of high-abundance proteins from serum by immunoaffinity chromatography:A MALDI-FT-MS study[J].J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci,2007,847(1):65.

[8]Linke T,Doraiswamy S,Harrison EH.Rat plasma proteomics:Effects of abundant protein depletion on proteomic analysis[J].J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci,2007,849(1-2):273.

[9]Pernemalm M,Orre LM,Lengqvist J,et al.Evaluation of three principally different intact protein prefractionation methods for plasma biomarker discovery[J].J Proteome Res,2008,7(7):2712.

[10]Choi BK,Hercules DM,Gusev AI,et al.Effect of liquid chromatography separation of complex matrices on liquid chromatography-tandem mass spectrometry signal suppression[J].J Chromatogr A,2001,907(1-2):337.

[11]Perez-Guzman C,Vargas MH,Quinonez F,et al.A Cholesterol-Rich Diet Accelerates Bacteriologic Sterilization in Pulmonary Tuberculosis[J].Chest,2005,127(2):643.

[12]Agranoff D,F(xiàn)ernandez-Reyes D,Papadopoulos MC,et al.Identification of diagnostic markers for tuberculosis by proteomic fingerprinting of serum[J].Lancet,2006,368(9540):1012.

[13]吳雪瓊,張俊仙,梁 艷,等.應(yīng)用蛋白質(zhì)譜建立活動性肺結(jié)核病的血清診斷模型[J].中華微生物和免疫學(xué)雜志,2008,28(11):1040.

[14]Engwegen JY,Helgason HH,Cats A,et al.Identification of serum proteins discriminating colorectal cancer patients and healthy controls using surface-enhanced laser desorption ionisation-time of flight mass spectrometry[J].World J Gastroenterol,2006,12(10):1536.

[15]Gobel T,Vorderwulbecke S,Hauck K,et al.New multi protein patterns differentiate liver fibrosis stages and hepatocellular Carcinoma in chronic hepatitis C serum samples[J].World J Gastroenterol,2006,12(47):7604.

[16]Yamamoto-Ishikawa K,Suzuki H,Nezu M,et al.The isolation and identification of apolipoproteinC-I in hormone-refractory prostate cancer using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight masss pectrometry[J].Asian J Androl,2009,11(3):299.

[17]Martens GW,Arikan MC,Lee J,et al.Hypercholesterolemia impairs immunity to tuberculosis[J].Infect Immun,2008,76(8):3464.

[18]Lahiry P,Cao H,Ban MR,et al.APOC1T45Spolymorphism is associated with reduced obesity indices and lower plasma concentrations of leptin and apolipoprotein C-I in aboriginal Canadians[J].J Lipid Res,2009,51(4):843.

[19]Perez Guzman C,Vargas HM,Cruz A,et al.La hipocoles terolem in:un hallazgo trecuente que se asocial a la tuberculos is[J].Rev Insy Nal Ent Resd Mex,2002,15(1):7.

[20]Deniz O,Gumus S,Yaman H,et al.Serum total cholesterol,HDL-C and LDL-C concentrations significantly correlate with the radiological extent of disease and the degree of smear positivity in patients with pulmonary tuberculosis[J].Clin Biochem,2007,40(3-4):162.

猜你喜歡
血清
血清免疫球蛋白測定的臨床意義
中老年保健(2021年3期)2021-08-22 06:50:04
Meigs綜合征伴血清CA-125水平升高1例
慢性腎臟病患者血清HIF-1α的表達及臨床意義
慢性鼻-鼻竇炎患者血清IgE、IL-5及HMGB1的表達及其臨床意義
血清H-FABP、PAF及IMA在冠心病患者中的表達及其臨床意義
血清IL-6、APC、CRP在膿毒癥患者中的表達及臨床意義
血清HBV前基因組RNA的研究進展
血清馴化在豬藍耳病防控中的應(yīng)用
LC-MS/MS法同時測定養(yǎng)血清腦顆粒中14種成分
中成藥(2017年8期)2017-11-22 03:18:47
血清胱抑素C與小動脈閉塞型卒中的關(guān)系
主站蜘蛛池模板: 日韩在线第三页| 她的性爱视频| 91破解版在线亚洲| 国产精品久线在线观看| 国产白浆视频| 国产波多野结衣中文在线播放| 91福利国产成人精品导航| 久久国产精品麻豆系列| 人妻丰满熟妇av五码区| 色一情一乱一伦一区二区三区小说| 一区二区影院| 色窝窝免费一区二区三区| 91黄视频在线观看| 国产精品一区二区国产主播| 国产手机在线ΑⅤ片无码观看| 国产在线观看人成激情视频| 视频国产精品丝袜第一页| 曰AV在线无码| 国产97视频在线观看| 久久久亚洲国产美女国产盗摄| av尤物免费在线观看| 青草视频免费在线观看| 国产原创自拍不卡第一页| 色哟哟国产精品| 国产一级无码不卡视频| 又粗又大又爽又紧免费视频| 国产成人亚洲精品色欲AV| 国产国模一区二区三区四区| 91免费在线看| 精品一区二区三区四区五区| 91年精品国产福利线观看久久| 极品性荡少妇一区二区色欲| 国产亚洲欧美日韩在线观看一区二区| 亚洲国产黄色| 精品五夜婷香蕉国产线看观看| 久久黄色影院| 国产av一码二码三码无码| 成年人福利视频| 国产欧美日韩综合在线第一| 国内精自视频品线一二区| 又污又黄又无遮挡网站| 国产精品99r8在线观看| 久久久精品国产SM调教网站| 另类综合视频| 中文字幕中文字字幕码一二区| 国产精品亚洲αv天堂无码| 91色爱欧美精品www| 欧美一区中文字幕| 亚洲成A人V欧美综合天堂| 国产亚洲精品无码专| 国产成人91精品免费网址在线| 九色在线视频导航91| 久久成人免费| 国产成人精品高清不卡在线| 国产91丝袜在线播放动漫 | 国产网站一区二区三区| 五月婷婷欧美| 成人精品午夜福利在线播放| 91尤物国产尤物福利在线| 无码中文字幕乱码免费2| 四虎国产精品永久一区| 最新国产成人剧情在线播放| 国产av无码日韩av无码网站| 日本91在线| 97视频免费在线观看| 天天色综合4| 萌白酱国产一区二区| 欧美精品啪啪一区二区三区| 欧美一区二区人人喊爽| 精品无码日韩国产不卡av| 久热这里只有精品6| 日韩av无码DVD| 青青草原国产精品啪啪视频| 色噜噜在线观看| 啦啦啦网站在线观看a毛片| 国产在线精品美女观看| 91精品国产91久久久久久三级| 国产欧美日韩在线在线不卡视频| 色爽网免费视频| 乱码国产乱码精品精在线播放| 多人乱p欧美在线观看| 国产精品女熟高潮视频|