一種新的DNA序列進(jìn)化距離的修正方法

邢林林　郭茂祖　王娟

摘要： 進(jìn)化樹是推演生命歷史的一個(gè)重要工具。在構(gòu)建進(jìn)化樹的所有算法中，基于進(jìn)化距離的算法是其中研究的重點(diǎn)。但是，這一方法較為嚴(yán)重地依賴著距離矩陣的質(zhì)量。人們開發(fā)了多種基于生物事實(shí)的進(jìn)化模型來改進(jìn)距離矩陣的構(gòu)建過程，很大程度上提高了進(jìn)化距離的準(zhǔn)確性。同時(shí)，也提出了許多方法來檢測距離矩陣的質(zhì)量。文中提出了基于模型的距離以及p距離，采用一種組合的新距離的方式來構(gòu)建距離矩陣。同時(shí)采用直接檢測距離矩陣的統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)分方法以及構(gòu)建進(jìn)化樹，對比實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明文中的方法實(shí)用且有效。

關(guān)鍵詞：

中圖分類號：TP391文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號：2095-2163（2012）04-0035-06