航天員系統的主要任務是選拔、訓練航天員,并在訓練和載人飛行任務實施過程中,對航天員實施醫學監督和醫學保障。在北京建設了航天員科研訓練中心,研制了航天服、船載醫監醫保設備、個人救生等船載設備。該系統由中國航天員科研訓練中心承擔。
發射場系統的主要任務是負責火箭、飛船、有效載荷和航天員系統裝船設備在發射場的測試和發射,并提供相應的保障條件。載人航天發射場建于中國酒泉衛星發射中心,于1998年正式投入使用,采用具有國際先進水平的“垂直總裝、垂直測試、垂直運輸”及遠距離測試發射控制的先進模式,可以兼顧未來大型航天器發射的需要。該系統由酒泉衛星發射中心承擔。
測控通信系統的主要任務是完成飛行試驗的地面測量和控制任務。在原有衛星測控通信網的基礎上,研制了符合國際標準體制、可進行國際聯網的 S波段統一測控通信系統,形成了新的陸海基載人航天測控通信網,主要包括北京、東風、西安三個指揮控制中心,渭南、青島等固定測控站和活動測控站以及“遠望”號測量船。該系統由總裝備部測通所等單位承擔,其中測控通信設備由工業和信息化部為主研制。
著陸場系統的主要任務是負責對飛船再入的捕獲、跟蹤和測量,搜索回收返回艙,并對航天員返回后進行醫監醫保、醫療救護的重要任務。著陸場主要包括內蒙古中部的主著陸場和酒泉衛星發射中心內的副著陸場以及若干陸、海應急救生區。該系統擁有先進的無線電測量系統,能夠在飛船進入大氣層后對它的軌道實施跟蹤、測量。該系統由總裝備部測通所等單位承擔。