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川木通與其混偽品和近緣種的ITS2條形碼分子鑒定

2011-06-14 01:17:10劉美子李美妮姚輝劉萍
環(huán)球中醫(yī)藥 2011年6期

劉美子 李美妮 姚輝 劉萍

川木通為較常用中藥,主產(chǎn)于四川等地,具有清熱利尿,通經(jīng)下乳等功效。2010版《中國藥典》收載的川木通為毛茛科植物小木通(ClematisarmandiiFranch.)或繡球藤(ClematismontanaBuch.-Ham.)的干燥藤莖[1]。由于本草中記載的異物同名,同物異名和地方用習(xí)用品等原因,商品川木通的品種混亂情況較為嚴(yán)重[2],包括毛茛科鐵線蓮屬、木通科木通屬(如木通)、馬兜鈴科馬兜鈴屬(如關(guān)木通)等多種植物的藤莖,其中木通與川木通在有效成分、藥理作用和主治功能上雖有相似之處[3],但功效各有側(cè)重,應(yīng)區(qū)別使用。關(guān)木通由于腎毒性而被禁用后,川木通的需求量日益增大 ,而藥典收載的繡球藤生長海拔較高,市場上流通的川木通實(shí)際上?;煊心就ɑ蜩F線蓮屬的多種植物的藤莖[4]。川木通與木通為不同科屬的植物,依靠外觀形態(tài)或顯微鑒定可明顯區(qū)分,但與同屬混偽品和近緣種則需要尋找一種快速、準(zhǔn)確的分子鑒定方法,以確保臨床的安全用藥,近年發(fā)展起來的DNA條形碼技術(shù)在近緣種鑒定方面顯示出了明顯的優(yōu)勢。

DNA條形碼技術(shù)是隨著分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的發(fā)展而出現(xiàn)的物種鑒定新技術(shù)。它是利用一段短的標(biāo)準(zhǔn)的DNA序列作為標(biāo)記而建立的物種鑒定方法,目前已被廣泛應(yīng)用于藥用植物鑒定[5-8]。nrITS序列常用于不同分類階元的系統(tǒng)進(jìn)化研究,尤其是屬水平或?qū)傧滤降难芯縖9],nrITS由ITS1、5.8S、ITS2三部分構(gòu)成,Chase等[10]研究表明,ITS2序列與ITS序列的物種鑒定效率相當(dāng),但其序列長度只有ITS的1/3,因此具有較高的擴(kuò)增效率,ITS2已成為熱點(diǎn)的條形碼候選序列[11-13]。本文應(yīng)用ITS2序列對川木通及其混偽品和近緣種進(jìn)行分析,為近緣物種的分子鑒定提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

川木通基原植物繡球藤及其混偽品木通、三葉木通、棉團(tuán)鐵線蓮的的新鮮葉片分別采自四川汶川、成都、南充,廣西南寧和北京,由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所林余霖副研究員進(jìn)行鑒定,硅膠干燥保存,材料信息詳見表1。此外,從GenBank下載了川木通與其混偽品和近緣種的ITS2序列,詳見表2。

表1 材料采樣信息

1.2 方法

采用植物DNA提取試劑盒(Tiangen Biotech Co.,China)提取DNA。ITS2序列的PCR擴(kuò)增及測定方法均參考Chen等研究[14],將實(shí)驗樣本的雙向測序峰圖用CodonCode Aligner V3.7.1校對拼接,并剪切引物區(qū)。對拼接后得到的序列和GenBank下載的ITS2序列用HMMer注釋法切除5.8S和26S端,保留ITS2的全長。用MEGA5軟件對川木通種內(nèi)、種間序列進(jìn)行分析,采用Koetschan等[15]建立的ITS2數(shù)據(jù)庫預(yù)測ITS2二級結(jié)構(gòu),應(yīng)用BLAST方法對川木通及其同屬混偽品和近緣種進(jìn)行鑒定分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 川木通基原植物的ITS2序列長度,GC含量及種內(nèi)變異

小木通ITS2序列長度為218~220 bp,平均GC含量為68.9%,含5~6個POLY結(jié)構(gòu)(≥5個單堿基重復(fù)),為4~5個PolyC和1個PolyG結(jié)構(gòu)。小木通2條序列比對后長度為220 bp,主要變異位點(diǎn)有四處,為74、133位點(diǎn)處的T-C單堿基轉(zhuǎn)換,127位點(diǎn)處的TT-CC雙堿基轉(zhuǎn)換和122位點(diǎn)處的C-T單堿基轉(zhuǎn)換,種內(nèi)K2P距離為0.0285。

繡球藤ITS2序列長度為218 bp,平均GC含量為66.5%,含5個POLY結(jié)構(gòu),為4個PolyC和1個PolyG。繡球藤3條序列比對后長度為218 bp,主要變異有四處,為23位點(diǎn)處的A-T變異,122位點(diǎn)處的T-C變異,179位點(diǎn)處的ATC-TAA三位點(diǎn)變異,193位點(diǎn)處的A-G變異,種內(nèi)平均K2P距離為0.0187,種內(nèi)最大K2P距離為0.0280。

2.2 川木通及其主要混偽品的鑒定

2.2.1 種間變異

川木通與主要同屬混偽品女萎(Clematisapiifolia)、短尾鐵線蓮(Clematisbrevicaudata)的種間平均距離為0.0339,種間最小距離為0.0046, 種間變異較小。 川木通與木通科木通的三個基原木通[Akebiaquinata(Thunb.) Decne.]、三葉木通[Akebiatrifoliata(Thunb.) Koidz.]或白木通[Akebiatrifoliata(Thunb.) Koidz. var. Australis (Diels) Rehd.]的種間平均K2P距離為0.5398,種間最小K2P距離為0.5257,變異位點(diǎn)有94處,種間變異較大;川木通與馬兜鈴科關(guān)木通(AristolochiamanshuriensisKomarov)的種間平均K2P距離為0.6155,種間最小K2P距離為0.5801,變異位點(diǎn)有109處,種間變異較大。川木通與其主要混偽品ITS2序列的種間比對見圖1。

2.2.2 ITS2序列二級結(jié)構(gòu)分析

如圖2所示,川木通基原植物小木通與繡球藤在螺旋(Helix)IV區(qū)有差異,川木通與其同屬主要混偽品女萎和短尾鐵線蓮的差異也在螺旋IV區(qū),而與混偽品木通、三葉木通、白木通在螺旋I、II、III和IV區(qū)均存在明顯差異。

2.3 川木通與其同屬近緣種的鑒定

運(yùn)用BLAST方法(Chen et al,2010)計算鐵線蓮屬的鑒定效率,結(jié)果表明川木通的基原植物小木通和繡球藤均能與同屬的31種易混偽品被正確鑒定,而易混品種之間除芹葉鐵線蓮(C.aethusifolia)與須蕊鐵線蓮(C.pogonandra),銹毛鐵線蓮(C.leschenaultiana)與錫金鐵線蓮(C.siamensis),甘青鐵線蓮(C.tangutica)與中印鐵線蓮(C.tibetana)互相不能鑒定外,其他同屬近緣物種均能區(qū)分開,ITS2條形碼對鐵線蓮屬的鑒定成功率達(dá)到87%。

3 討論

川木通的商品藥材來源于野生資源,由于生態(tài)環(huán)境惡化,造成川木通資源短缺[16],于是多種鐵線蓮屬植物的藤莖摻入川木通藥材中[4]。大部分文獻(xiàn)報道的均是川木通與性狀差別較大的木通的鑒定[2,17],而對于親緣關(guān)系較近的同屬混偽品,用傳統(tǒng)分類方法很難區(qū)分,針對此問題,基于ITS2條形碼的分子鑒定方法顯示出其優(yōu)勢。ITS2作為條形碼不僅具備ITS序列變異率高、進(jìn)化快的特點(diǎn),還具有保守的5.8S和26S便于設(shè)計通用引物,約200~300 bp的長度便于擴(kuò)增和測序,可以用于部分降解的中藥材的鑒定[18]。通過對川木通及其混偽品和近緣物種的分析,川木通基原植物繡球藤和小木通與其混偽品木通和關(guān)木通ITS2序列具有顯著的種間變異,與同屬混偽品女萎和短尾鐵線蓮的種間變異小。川木通基原植物繡球藤和小木通與同屬混偽品女萎和短尾鐵線蓮的ITS2二級機(jī)構(gòu)在螺旋IV區(qū)有差異,用BLAST方法能夠?qū)⒋就ㄅc其同屬易混品和近緣物種區(qū)分開,對鐵線蓮屬的鑒定成功率達(dá)到87%,可見ITS2條形碼能夠用于親緣關(guān)系較近的正品與混偽品的鑒定。

ITS2序列作為DNA條形碼用于中藥鑒定具有準(zhǔn)確、快捷的優(yōu)勢,此外其二級結(jié)構(gòu)能夠為發(fā)現(xiàn)新物種和分類學(xué)研究提供更多的信息[19],賦予ITS2更為強(qiáng)大的功能,為中藥混偽品和近緣物種分子鑒定開拓了新思路。

圖1 川木通與其主要混偽品木通、女萎、短尾鐵線蓮的種間變異

圖2 川木通、木通及其主要易混偽品的二級結(jié)構(gòu)比較

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