基于權值圖的基因芯片數據差異雙聚類挖掘算法

0 引言

近年來，基因芯片技術的廣泛使用產生了大量的基因表達數據，這些基因表達數據通常被表示為一個由基因和如實驗環境、實驗個體等實驗條件共同構成的矩陣。基因表達數據分析中一個主要的任務就是將基因按期表達水平分類，或將實驗條件分類以得到對生物表達水平有意義的基因或實驗條件。聚類分析被廣泛用于實現以上目標。近年來，雙聚類成為基因表達數據分析領域中一個新的研究熱點。雙聚類與傳統聚類方法的不同之處在于，雙聚類不是在全局實驗條件下生成聚類，而是僅找出對特定的實驗條件敏感的共表達基因。作為一個新的研究方向，雙聚類能有效地找到那些僅對某些實驗條件敏感的基因，或是影響基因表達水平的關鍵實驗條件，這一特性具有重大的生物學意義。