栽培種花生EST-SSR引物的開發及應用
2010-12-31 00:00:00肖洋廖伯壽晏立英黃家權任小平雷永姜慧芳
湖北農業科學 2010年11期
摘要:從高油抗青枯病花生新品系“06-4104”構建的5個cDNA文庫獲得了63207條EsT，經序列拼接，獲得14547條Uni-EST。經MISA檢索，在這些uni-EST中共檢測出2643個SSR位點，分布于2250條EST中，發生頻率為15.5%，平均每3.1kbEST序列含有一個SSR位點。其中，三核苷酸重復類型出現頻率最高，占SSR總數的49.1%，其次是二核苷酸重復類型，占SSR總數的45舟%。在發現的46糞重復基序中，AC/TC重復基序的頻率最高，AAG/TTC次之。利用Priner3從含有SSR的2250條EST中共設計引物100對，利用這些引物檢測花生栽培品種的多態性，結果表明，在所設計的lOO對引物中有91對在供試的6個花生栽培品種中得到有效擴增，其中13對得到了多態性的擴增產物，每對引物檢測出的等位基因數2～3個，平均2.2個。 關鍵詞:花生;EST-SSR;標記開發
