于寒松,張繼星,李彥舫,馬蘭青*,胡耀輝,*
(1.吉林農業大學食品科學與工程學院,吉林 長春 130118;2.內蒙古民族大學生命科學學院,內蒙古 通遼 028043;3.吉林大學植物科學學院,吉林 長春 130062;4.農業部都市農業(北方)重點開放實驗室,北京農學院,北京 102206)
高山紅景天中糖基轉移酶家族cDNA全長基因的克隆
于寒松1,張繼星2,李彥舫3,馬蘭青4,*,胡耀輝1,*
(1.吉林農業大學食品科學與工程學院,吉林 長春 130118;2.內蒙古民族大學生命科學學院,內蒙古 通遼 028043;3.吉林大學植物科學學院,吉林 長春 130062;4.農業部都市農業(北方)重點開放實驗室,北京農學院,北京 102206)
為了獲得高山紅景天中紅景天苷生物合成關鍵酶——UDP-糖基轉移酶家族基因的全長cDNA序列,采用在線簡并引物設計軟件結合3′-RACE技術獲得兩個糖基轉移酶基因的3′端部分序列,進一步采用不同的5′-RACE試劑盒擴增兩個基因的5′端序列,結果顯示利用Takara公司的試劑盒擴增可以得到cDNA全長序列(GenBank登錄號為EF508689和EU567325),而采用Invitrogen公司的試劑盒得到的序列不包括全部開放讀碼框。實驗證明,利用Takara公司的SMARTerTMRACE cDNA Amplification Kit克隆獲得基因全長序列的比率更高。
糖基轉移酶;基因克隆;cDNA末端快速克隆法(RACE);高山紅景天
Abstract:In order to obtain the critical enzyme for the synthesis ofRhodiola sachalinensisglycoside, two putative UDP-glycosyltransferase (UGT) cDNAs (GenBank accession number, EF508689和EU567325) were isolated fromR. sachalinensi.The primers were designed for 3'-rapid amplification of cDNA ends (RACE) based on the consensus hybrid oligonucleotide primers (CODEHOP) strategy by the Block Maker program. A full-length cDNA sequence (Genbank accession numbers:EF508689 and EU567325) was obtained through the amplification using a SMARTerTMRACE cDNA Amplification Kit (TaKaRa,Dalian, China), whereas the sequence obtained using a 5'-RACE system (version 2.0, InvitrogenTMLife Technologies) contained no full-open reading frame.The cloning efficient of two 5'-RACE systems was investigated. Results exhibited that TaKaRa SMARTerTMRACE cDNA Amplification Kit was more efficient in complete cDNA sequence cloning, compared with the InvitrogenTM5'-RACE system.
Key words:glycosyltransferase;gene cloning;rapid amplification of cDNA ends (RACE);Rhodiola sachalinensis
植物次生代謝物質在植物生命活動過程中起著重要作用,如細胞解毒、信號轉導、防御機制等[1-3]。對人類而言,很多植物次生代謝物具有很多生理功能,也是保健品和醫藥品的重要來源[4]。現階段天然產物己越來越多地被應用于保健食品、天然香料、天然色素和藥物等產品的生產上[5-6]。但是,植物雖然能合成上萬種次生代謝產物,但是它們的含量都很低。……