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胚胎水平斷面數(shù)字化圖像數(shù)據(jù)集攝取的關鍵技術研究

2010-10-17 11:04:18余中華楊懿農(nóng)向長和謝正蘭陳峽饒利兵
科技傳播 2010年9期
關鍵詞:計算機

余中華,楊懿農(nóng),向長和,謝正蘭,陳峽,饒利兵,2

1.懷化醫(yī)學高等??茖W校醫(yī)學形態(tài)中心,湖南懷化 418000

2.中南大學湘雅醫(yī)學院人體解剖學與神經(jīng)生物學系,湖南長沙 410000

胚胎水平斷面數(shù)字化圖像數(shù)據(jù)集攝取的關鍵技術研究

余中華1,楊懿農(nóng)1,向長和1,謝正蘭1,陳峽1,饒利兵1,2

1.懷化醫(yī)學高等專科學校醫(yī)學形態(tài)中心,湖南懷化 418000

2.中南大學湘雅醫(yī)學院人體解剖學與神經(jīng)生物學系,湖南長沙 410000

本文為探討如何取得更好的數(shù)字化虛擬人數(shù)據(jù),以滿足虛擬人數(shù)字數(shù)據(jù)庫建立的需要。選擇合適的相機,經(jīng)過參數(shù)設置、相機固定、連接計算機、調(diào)試、后期圖片處理等步驟獲得1 800萬像素、分辨率為5184×3456的胎兒頭部斷面照片230張。從而證明,高效數(shù)碼相機的選擇和應用對胚胎數(shù)字化虛擬人數(shù)據(jù)的采集有重要意義。

高效;采集;虛擬人

數(shù)字化虛擬人是將人體形態(tài)學、物理學和生物學等信息,通過大型計算機處理而實現(xiàn)的數(shù)字化虛擬人體[1-2],是可代替真實人體進行實驗研究的技術平臺。數(shù)字人是形態(tài)學水平的虛擬人體,具有與真實人體相近的形態(tài)結構和數(shù)據(jù)。目前,我國已經(jīng)成功完成了首例男、 女可視化數(shù)字人的制作[3]。完整、準確的獲取胚胎橫斷面數(shù)據(jù)集是實現(xiàn)可視化人體胚胎的基礎與關鍵。本文所討論的攝影方法是將懷化高等??茖W?,F(xiàn)階段進行可視化人胚胎建模中所獲得的經(jīng)驗進行討論。

1 相機的選擇

數(shù)字化采集對照片的質量要求非常高,必須選擇高像素、高分辨率的相機。目前,相機品牌眾多,各種功能強大的相機比比皆是。為了選擇出符合要求的相機,在其功能參數(shù)上需要仔細對比。

首先相機像素必須達到1 000萬以上且分辨率在1280×1024以上才能初步滿足后期數(shù)字重建的要求。而在進行冰凍胚胎切片時需要快速對焦拍照,手動照相顯然無法達到要求,則需用通過計算機控制拍照。而能通過計算機控制拍照的相機相對比較少。經(jīng)過比較,我們選擇了佳能EOS 7D高效數(shù)碼相機。該相機最高像素1 800萬、最高分辨率5184×3456、高ISO感光度,經(jīng)改造后支持計算機控制拍照。(如圖1)在選擇佳能EF 24mm f/1.4L鏡頭(如圖1),可以使相片找出來效果更佳好(如圖2)。

2 相機的固定

在冰凍胚胎層次切片過程中,鉆銑機床的震動、工作平臺的移動、都會對相機拍照造成影響。為了保證所采集照片的質量,必須對相機進行固定。

我們采用不銹鋼三角架固定。將三角架擺放在鉆銑床工作臺的出口處,調(diào)整位置后在機床工作平臺上方固定相機,要求其能水平垂直拍照。這樣才能保證采集的圖像數(shù)據(jù)準確性(如圖3)。

圖1

圖2

3 相機的設置

圖3 A鉆銑臺 B相機和鉆銑臺 C相機與電腦連接

在進行拍照前,需對相機參數(shù)重新設置,采用最符合工作間要求的設置來進行拍照。設置中要考慮到工作間燈光強度、色溫、白平衡、曝光時間等問題。而我們針對工作間環(huán)境對相機初步設置為:焦距55mm , f/13 ,1/80s,ISO100,相片大小為最大,輸出格式為JPG。必要時可根據(jù)光線不同來進行調(diào)整。

4 與計算機的連接

在相機數(shù)據(jù)采集中最重要的一項就是通過計算機控制相機拍照。

首先通過相機自帶數(shù)據(jù)線(USB接口)連接在計算機上,然后安裝其拍照圖象編輯軟件(EOS Utility),即可通過計算機進行拍照。通過軟件觀察標本位置,進行修正,自動對焦然后進行拍照。取得圖片后直接儲存在計算機中。

5 圖像去噪、配準、保存

取得胚胎斷層圖像數(shù)據(jù)后,將對圖片進行去噪修整,參考包埋時預留的定位桿按其算法[4]進行配準然后編號保存。

經(jīng)過以上步驟后獲得的照片像素約1 790萬、分辨率為5184×3456,每張占用儲存空間為11M。照片連續(xù)性好,位置穩(wěn)定,可以很好的用來三維數(shù)字重建。此攝影方法步驟可以很好的推廣應用到數(shù)字化虛擬人數(shù)據(jù)采集中去。

[1] 呂廣明,吳輝群,湯樂民,等.冷凍連續(xù)切片重建數(shù)字人腰髓[J].解剖學,2008,31(2):232-234.

[2] 鐘世鎮(zhèn),原林,唐雷,等.數(shù)字化虛擬中國人女性一號(VCH-F1)實驗數(shù)據(jù)集研究報告[J].第一軍醫(yī)大學學報,2003,23(3):196-200,209.

[3] 唐雷,原林,黃文華,等.“虛擬中國人”(VCH)數(shù)據(jù)采集技術研究[J].中國臨床解剖學,2002,05(1):324-326,329.

[4] 諸葛斌,周荷琴,唐雷,等.中國數(shù)字人數(shù)據(jù)集斷層圖像自動配準算法[J].中國生物醫(yī)學工程學報,2005,24(4):443-447.

R319

A

1674-6708(2010)18-0050-01

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