區偉佳,王 榮,李敏清,袁英英,李華興
(華南農業大學資源環境學院,廣州 510642)
華南地區大豆根內拮抗菌AF-67篩選與鑒定*
區偉佳,王 榮,李敏清,袁英英,李華興**
(華南農業大學資源環境學院,廣州 510642)
篩選生防菌共436株,有生防性能71株,占16.3%,抑菌效果較好8株,占1.8%,能快速高命中率的獲得具有防病效果好、抑菌譜廣的生防菌株。內生菌AF-67與Fusarium oxysporum共培養時,能使其菌絲體及其分生孢子生長明顯畸變。經16S rDNA基因序列分析,AF-67被初步鑒定為Bacillus amyloliquefaciens。
大豆根腐病;根內拮抗菌;篩選;鑒定;16S rDNA
大豆根腐病(Soybean root rot)在國內外大豆產區均有發生,是土傳病害,危害較重[1]。該病對產量影響大,感病品種產量損失一般為5%~10%,嚴重的可達90%以上,甚至絕產。每年給國家造成巨額經濟損失[2,3]。華南大豆產區高溫多雨的氣候環境,土壤緊實粘重、偏酸等均有利于根腐病的發生[4],關于解決華南產區大豆根腐病的研究越來越受科研工作者的關注。
生物防治手段普遍應用于植物病害防治。許多根際或根內微生物同時具有防病、促生作用。土壤施用含有該生防菌株的生物肥料能減少農藥的用量,降低成本,同時還能改善土壤條件及農產品品質[5]。在生防菌株的篩選源上,考慮生防菌在植株根部的定殖效果,著重研究從植株根際或根內中篩選。有研究表明,從根際或根內分離篩選出的拮抗菌能更好的定殖在植株根系[6,7]。
芽孢桿菌作為目標菌群,更能適合于生物肥料工業生產的要求。研究通過對有效生防菌的16S rDNA序列分析,確定生防菌的種類和來源。旨在提供一種快速、準確的生防菌選鑒方法。
采自華南農業大學博羅、寧西大豆試驗田的大豆植株。
尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum) 3個高致病性菌株 F1、F2、F5;
絲核菌(Rhizoctoniasp);
小核菌(Sclerotium rolfssii);
以上供試菌種由華南農業大學資源環境學院根系中心分離與提供。
選取健康強壯大豆植株根系,表面消毒后,無菌狀態置于滅菌研缽,加入適量LB培養基和滅菌石英砂,充分研磨后轉入含50mL LB液體培養基中,150rpm富集培養30min。取出,置于80℃恒溫水浴10min。培養液稀釋后,取適當濃度涂布LB平板,36℃培養48h后挑取形態不同、長勢較好的菌落,劃線純化。
距PDA平板中心3cm處互相垂直四個方向點接拮抗細菌,平板的中央接種經過活化的尖孢鐮刀菌菌塊(直徑5mm),28℃黑暗培養12d后記錄菌圈直徑,設5個重復。公式如下:
同時按上述的方法對絲核菌、小核菌進行拮抗性測定。

菌間相容性采用交叉劃線法:取待檢拮抗菌液依次兩兩交叉劃線,在劃線的交叉處出現透明不生長,為菌間不相容;無出現透明點,能正常生長為菌間相容[8,9]。
形態鑒定參照《伯杰氏鑒定細菌學手冊》[10];AF-67鑒定方法采用分子生物學16S rDNA序列分析:取培養至對數期菌液,用細菌DNA提取試劑盒提取AF-67的總DNA。配制擴增體系50uL,其中,正向引物K01(FC27):5’AGAGTTTGATCCTGGCTCA G 3’;反向引物K02(RC1492):5’TACGGCTACCTT GTTACGACTT 3’。PCR產物由北京奧科生物技術有限責任公司測序。序列結果通過BLASTN程序在GenBank核酸數據庫中進行分析,確定其分類地位。
將尖孢鐮刀菌(F5) 菌塊(直徑5mm)與AF-67菌懸液3mL加入50mLKB培養液中,28℃,150rpm培養3d。吸取少量培養液,顯微鏡下觀察真菌菌絲的生長情況。對照接病原菌塊的KB培養液。
從大豆根內篩選出候選生防菌共436株,其中具有生防性能71株,占16.3%,其中對大豆根腐病原菌具明顯抑制作用8株,占1.8%,抑菌效果見表1。
試驗證明該法能高命中率的獲得具有防病效果好、抑菌譜廣的生防菌株。由表1可知,所得菌株對峙試驗后15d仍保持高抑菌效果性能。

表1 生防菌對大豆根腐病菌抑菌效果 %
生防菌間相容性測試結果顯示(見表2),菌株AF8與其他大部分生防菌顯示不相容性,其他菌株均顯示可以共存。

表2 生防菌間相容性測試結果

圖1 拮抗菌AF-67的16S rDNA電泳條帶及其測序峰圖片段
優選有代表性,編號為AF-67拮抗細菌,16S rDNA序列比對結果經GenBank(NCBI)比對,登記號為lcl58891。根據同源性比較(見表3),與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis subsp) 同源性最高,達99%,與地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)、短小芽孢桿菌 (Bacillus pumilus) 同源性也達97%。

表3 AF-67 16S rDNA在GenBank(NCBI)比對結果
拮抗菌16S rDNA的PCR擴增條帶單一、清晰,位于約1.5kb處。其序列峰圖效果理想,無出現錯峰套峰,測序結果可靠性高(見圖1)。
測序結果在GenBank核酸數據庫中分析,構建系統發育樹(見圖2),分析遺傳距離,其種間親緣關系表明AF-67與B.Amyloliquefaciens的親緣關系最近,且在同一個分支中,這再次驗證了AF-67最可能為解淀粉芽孢桿菌。
拮抗菌AF-67與鐮刀菌共培養后發現,能明顯抑制病菌菌絲的生長(見圖3)。菌絲體局部明顯膨大、腫脹,菌絲不發育,同時有畸形、斷裂現象,菌絲體分隔數顯著增多。細胞內含物大量凝聚,部分形成大且透明的空泡。與對照相比,經共培養的鐮刀菌產孢量明顯減少。

圖2 AF-67的系統發育樹

圖3 AF-67對尖孢鐮刀菌菌絲發育影響
鑒于芽孢桿菌屬的生物安全性、耐熱特性和生產上的可操作性,試驗能快速直接篩選出目標生防菌。結合分子生物學技術,對于難于培養、生化反應不明顯及遺傳表型等手段不能鑒定的細菌,采用此法提供快捷可行的解決方案。
造成大豆根腐的致病菌種類繁多雜亂,地域差異性大[11]。篩選的8株生防菌對幾種華南地區的常見致病菌均顯示較好抑菌效果。靶標菌中,國內以Fusarium oxysporum的出現頻率最多[12,13],大豆項目科研基地的感病植株,其5號高致病性菌株的分離率最高。篩選的AF-67對Fusarium oxysporum菌絲生長有一定的抑制作用,具開發利用潛力。
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In this study,the improved traditional screening methods could quickly obtain strains which showed antagonistic activity against soybean root rot and broad antagonistic spectrum.The activity of 436 strains assayed,16.3%of them showed antagonistic activity againstF.oxysporumf.sp.soybean and one of them,strain AF67 isolated from soybean roots was the best.Co-culture with Fusarium oxysporum,mycelium and conidia were evident distortion.Based on the sequence of 16S rDNA,strain AF67 was identified asBacillusamyloliquefaciens.
Soybean root rot;Antifungal Entophytic Bacteria;Isolation;Characterization;16S rDNA
S432.4+4
B
1674-3547(2010)02-0018-04
2009-12-22;修回日期:2010-01-12
國家自然科學基金項目(40971155);廣東省“十一五”攻關項目(2006B20301050),廣東省教育部產學研結合項目(2009B090300330),廣東省農業廳科技項目(粵農土肥(2004)28號)。
李華興,男,教授,華南農業大學資源環境學院,E-mail:huaxli@scau.edu.cn