沙城龍眼葡萄園土壤中酵母菌多樣性研究

李 艷，盧 君，張利中

沙城龍眼葡萄園土壤中酵母菌多樣性研究

李 艷1,2，盧 君1，張利中3

(1.河北科技大學生物科學與工程學院，河北 石家莊 050018；2.河北省發酵工程技術研究中心，河北 石家莊 050018；3.中國長城葡萄酒有限公司，河北 沙城 075400)

為分離篩選具有產區特色的菌種，本實驗采用梯度稀釋和劃線分離技術，從沙城地區3個龍眼葡萄園土壤中共分離得到210株酵母菌。按照形態表型分為9類，又利用核糖體5.8S rDNA-ITS區域RFLP方法將這9類酵母在分子水平上進行了區分，其中兩類酵母為常見酵母，分別為東方伊薩酵母(Issatchenkia orientalis)和熱帶假絲酵母(Candida tropicalis)。實驗證明了該地區土壤中酵母菌的多樣性。

龍眼葡萄；土壤；酵母；形態表型；RFLP方法；生物多樣性

沙城葡萄酒產區地處懷涿盆地，為我國著名的葡萄產地，位于北緯40°附近，是釀酒葡萄種植最理想的黃金地帶和我國重要的葡萄原料基地之一，也是我國地理標志產品“沙城葡萄酒”的原產地。

土壤是各種微生物的天然棲息地，其中蘊含著豐富的酵母菌資源。從葡萄園土壤中分離酵母菌是開發和利用優良釀酒酵母菌種的基礎。本實驗對沙城產區龍眼葡萄園土壤進行酵母菌的分離和鑒定，旨在探索土壤中酵母菌的生物多樣性，并確定其優勢酵母菌種。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

于2008年10月從河北省沙城釀酒葡萄產區的懷來縣沙城鎮葡萄園采集土樣。2009年4月和10月分別于沙城鎮所屬沙營、夾河和東水泉3個自然村的龍眼葡萄園采集土樣。采樣方法是每個葡萄園按照三點采樣法，每個采樣點分別采集3個土壤樣品，7個來源的土壤樣品合計63份。

正向引物：ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)，反向引物：ITS4 (5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′) 委托上海生工生物工程技術服務有限公司合成；Taq DNA聚合酶、限制性內切酶cof I，HinfI，HaeIII均購自Promega公司。

1.2 培養基

YEPD液(固)體培養基(g/L)：酵母浸粉10、胰蛋白胨20、葡萄糖20、瓊脂15，固體培養基可加入2%瓊脂。

WL瓊脂培養基(%)：酵母浸粉0.4、胰蛋白胨0.5、葡萄糖5、KH2PO40.055、KCl 0.0425、CaCl20.0125、MgSO40.0125、FeCl30.00025、MnSO40.00025、溴甲酚綠2.2、瓊脂2，pH5.5[1-3]。

1.3 方法

1.3.1 土壤樣品處理

稱取1g土壤，置于20mL YEPD液體培養基中搖勻，28℃搖床富集培養12h，搖床轉速180r/min，取1mL富集培養液作為分離菌種的樣品。每份土壤樣品富集培養兩次作為平行實驗。

1.3.2 酵母菌分離流程

無菌條件下取1mL含菌的富集培養液 → 用無菌生理鹽水梯度稀釋(10～107倍)→ 將合適梯度的稀釋液涂布于YEPD固體培養基平板，28℃培養3d → 菌落計數 →隨機選取不同形態的酵母單菌落15個，經多次劃線培養，純化單菌落 → 接種于 WL培養基平板，28℃培養5d后根據菌落形態和細胞的顯微形態進行酵母菌的初步表型分類。

1.3.3 酵母菌DNA提取

酵母菌DNA的提取采用SDS裂解法[4]。

1.3.4 酵母菌PCR-RFLP分析

酵母菌5.8S-ITS rRNA 基因的擴增PCR反應體系及反應條件見參考文獻[5-8]。采用3種限制性內切酶cofI、HaeIII和HinfI對PCR擴增產物進行酶切分析，反應體系及反應條件見參考文獻[5]。

2 結果與分析

2.1 酵母菌形態的表型分類

利用YEPD培養基對葡萄園土壤樣品進行菌種的分離，共分離得到210株酵母菌，經WL培養基培養，根據菌落形態和細胞的顯微形態將其表型區分為9個不同的培養類型，結果見表1。

表1 酵母菌形態分類統計Table 1 Morphological features of yeast isolates

根據表1的結果，參考楊瑩等[1]和Cavazza等[3]描述的酵母菌在WL培養基上的菌落特征, 可以推測出以上酵母菌可能的種屬分類，類型4與文獻[3]中描述的紅色，球形突起，突面，表面光滑、黏稠，黃油狀的酵母菌相似，推測其可能為紅酵母(Rhodutorula)，類型6與文獻[1,3]中描述的綠色，扁平，表面光滑不透明，黃油狀的酵母菌相似，推測其可能為有孢漢遜酵母(Hanseniaspora uvarum)，類型7為異常漢遜酵母(Hansenula anomala)，類型9與文獻[1,3]中描述的奶油色帶綠色球形突起，表面光滑、不透明，奶油狀的酵母菌相似，推測其可能為釀酒酵母(Saccharomyce scerevisiae)，類型1、2、3、5、8的酵母菌沒有查到相關文獻所匹配的菌落類型。由以上結果可以看出利用WL培養基雖然不能將全部酵母鑒定到種屬水平，但是在酵母的形態分類方面具有較好的識別能力。

從表1還可看出，在不同年份、不同季節和不同地理位置的葡萄園中出現的酵母菌種類不同。2008年釀酒季節從沙營葡萄園土壤中分離得到2種形態的酵母菌，而在2009年的釀酒季節就得到了4種形態的酵母菌，在非釀酒季節的春季得到2種形態的酵母菌。夾河和東水泉葡萄園土壤中2009年春季分別分離到2種形態的酵母菌，都少于釀酒季節，2009年10月夾河和東水泉葡萄園土壤中分別分離到5種和3種形態的酵母菌。3次采樣的結果為沙營龍眼葡萄園土壤共分離得到了6種形態的酵母菌，夾河和東水泉分別為6種和5種形態的酵母菌。在2009年春季3個葡萄園土壤中都分離到形態3酵母菌，2009年釀酒季節3個葡萄園土壤中都分離到形態2、6、9酵母菌。3個葡萄園均處沙城鎮，相距不太遠，土質和氣候基本相似，均為沙石土壤、地域開闊、通風良好、光照充足。但是因地理位置不同，土質和微氣候略有差異，東水泉是中糧酒業長城桑干酒莊所在地，土壤中含沙量高、礫石較大。夾河是“萬畝葡萄示范園”所在地，葡萄園背靠大山位于西坡側光，坡度約30～40度，海拔約50～100米。沙營和東水泉均為開闊的平地，但沙營的土質沙礫較小。

2.2 酵母菌群組成

本研究對分離得到的各種形態的酵母菌落進行了菌落計數和分析，不同地理位置的葡萄園、不同年份、不同季節采集的土壤樣品，經過富集培養，培養液中酵母菌種類及各種酵母菌占總酵母菌數的百分比見表2。由此可以反映土壤中常見的酵母菌類型及分布情況。

由表2可看出，不同來源的土壤樣品中酵母菌群組成各不相同，優勢菌種的類型也不相同。2009年釀酒季節降雨少于2008年同期，2009年的氣候更適合龍眼葡萄的生長，同期采集的葡萄成熟度高于2008年，含糖量高，故酵母菌種類也較豐富。春季采集的土壤樣品中酵母菌落總數少于秋季，是由于該地區風沙較大、氣溫偏低，不適宜酵母菌的大量繁殖。在涉及到連續兩個年份兩個季節的3次采樣中，只有形態2的酵母菌在3次采樣中都分離到，形態1的酵母菌在連續兩個釀酒季節出現，說明這兩種酵母菌是沙營葡萄園土壤中最常見的酵母菌。

表2 不同采集地點的土壤富集培養液中酵母菌出現頻率Table 2 Distribution of 9 classified yeast groups in the enrichment culture of vineyard soil

2.3 酵母菌5.8S-ITS基因RFLP分析

在形態表型分類的基礎上，利用分子手段對酵母菌進行分類鑒定，根據核糖體5.8S rDNA-ITS區域的RFLP分析結果，得到了9種不同的酶切片段圖譜，根據酶切產物片段大小的不同，將分離得到的酵母菌在分子水平上進行了區分，對比Guillamón等[9]和Esteve-Zarzoso等[10]學者建立的初始酵母菌數據庫，將其中5種酵母進行了分類鑒定，結果見表3。

表3 土壤中酵母菌株5.8S rDNA-ITS區域的RFLP分析結果Table 3 RFLP analysis of 9 classified yeast groups

從表3可以看出，利用HaeIII、Hinf I和cof I這3種限制性內切酶對擴增產物進行酶切，酶切片段大小范圍為70～750bp，顯示出這9種酵母菌株的基因多樣性。將本實驗中分離得到的9類酵母菌的酶切產物片段與數據庫中模式菌株進行比對，能夠鑒定出5類酵母菌，另外4類酵母菌需要進一步的研究，如比對數據更全的數據庫(http://www.yeast-id.com/)，該數據庫每年都在更新[10]。

由以上結果可知，通過對比數據庫得到的鑒定結果與利用WL培養基得到的鑒定結果一致，說明WL培養基在鑒定酵母菌種類方面具有較高的準確性。

不同季節分離得到的酵母菌株，其PCR擴增圖譜和酶切圖譜分別見圖1～3。

圖1 2008年10月沙營、夾河、東水泉葡萄園土壤酵母菌5.8S-ITS區域PCR-RFLP圖譜Fig.1 5.8S ITS RFLP patterns of yeast strains isolated from the soils from Shaying, Jiahe and Dongshuiquan vineyards in October, 2008

圖2 2009年4月沙營、夾河、東水泉葡萄園土壤中酵母菌5.8S-ITS區域PCR-RFLP圖譜Fig.2 5.8S ITS RFLP patterns of yeast strains isolated from the soils from Shaying, Jiahe and Dongshuiquan vineyards in April, 2009

圖3 2009年10月沙營、夾河、東水泉葡萄園土壤中酵母菌5.8S-ITS區域PCR-RFLP圖譜Fig.3 5.8S ITS RFLP patterns of yeast strains isolated from the soils from Shaying, Jiahe and Dongshuiquan vineyards in October, 2009

從以上電泳圖能夠看出，每種形態類型的酵母菌都對應一種獨特的酶切圖譜類型，在2009年10月，分離得到的酵母菌類型最豐富，有6種，而在2008年10月的土壤樣品中只有兩個不同類型的酵母菌。有些酵母菌在兩個釀酒年份均可分離得到，并具有相同的電泳圖譜類型，說明這些酵母菌可能來自于不同菌源，是該地區相對普遍存在的酵母菌種。

2.4 酵母菌5.8S-ITS基因序列分析

在以上研究結果的基礎上，對于兩個年份的釀酒季節都分離到的形態1和2酵母菌，以及在2009年出現在3個葡萄園中，相對出現頻率較高的形態9酵母菌進行核糖體5.8S-ITS基因序列分析[9-11]，對這3種酵母菌5.8SITS基因RFLP的鑒定結果進行驗證，結果見表4。

表4 酵母菌5.8S-ITS區域的基因序列分析結果Table 4 5.8S-ITS sequence analysis of three selected yeast stains

由表4可見，菌落類型1、2的酵母菌，其序列分析鑒定結果與酵母菌5.8S-ITS基因RFLP分析的鑒定結果完全一致，菌落類型9的酵母菌通過序列分析被進一步鑒定為釀酒酵母的雜交菌株(Saccharomyces bayanus× Saccharomyces cerevisiae)。序列分析的結果驗證了5.8 SrDNA-ITS基因RFLP分析鑒定酵母菌種屬的準確性。以上結果能夠確定沙城產區龍眼葡萄園土壤中最常見的酵母菌種分別為東方伊薩酵母(Issatchenkia orientalis)和熱帶假絲酵母(Candida tropicalis)。釀酒酵母(Saccharomyces bayanus×Saccharomyces cerevisiae)是2009年釀酒季節土壤中普遍存在的酵母菌。

3 討 論

本實驗在連續兩年內對沙城產區三個龍眼葡萄園采集土壤樣品進行菌種分離，對分離得到的酵母菌進行分類鑒定采用的是傳統形態表型觀察與分子鑒定相結合的方法，確保了分類鑒定結果的可靠性。實驗最終確定了沙城產區龍眼葡萄園土壤中酵母菌的生物多樣性組成，及常見的酵母菌種屬。龍眼葡萄是原產于我國的特色優良釀酒和鮮食兩用葡萄品種，適合于釀造干白葡萄酒、白蘭地和起泡葡萄酒，在沙城地區有400年的種植歷史，在該地區分離篩選酵母菌，研究它們的生物多樣性對篩選和利用本土酵母菌并開發具有我國特色的葡萄酒產品具有實用價值。

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Biodiversity of Yeast in Soils from Longan Grape Plantations in Shacheng Region

LI Yan1,2，LU Jun1，ZHANG Li-zhong3
(1. College of Bioscience and Bioengineering, Hebei University of Science and Technology, Shijiazhuang 050018, China；2. R&D Center for Fermentation Engineering of Hebei Province, Shijiazhuang 050018, China；3. China Great Wall Wine Co. Ltd., Shacheng 075400, China)

To isolate and screen characteristic yeast strains, 210 yeast strains were isolated from soils from three Longan grape plantations in Shacheng region by gradient dilution and streak plate methods. These stains were classified into nine groups according to their morphological phenotypes, and the nine groups were identified by 5.8S ITS restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis, and two of them, Issatchenkia orientalis and Candida tropicalis, were common yeast strains. This study confirms the biodiversity of yeast in the oil of this region.

Longan vineyard；soil；yeast；morphological phenotypes RFLP method；biodiversity

TQ92

A

1002-6630(2010)19-0313-04

2010-05-31

河北省2009年科技支撐計劃項目(092210003D)

李艷(1958—)，女，教授，本科，主要從事傳統發酵工程創新技術研究。E-mail：lymdh5885@163.com