豬圓環病毒分子生物學研究進展

葉 芬，蔡家利

（1.西南大學動物科技學院，重慶 400715；2.重慶理工大學化學與生物工程學院，重慶 400050）

1 病毒基因組結構及其編碼的主要蛋白

1.1 病毒的基因組結構和特點 PCV基因組為單鏈環狀DNA分子，根據PCV的致病性、抗原性及核酸序列，將PCV分為PCV1和PCV2兩個血清型。PCV1的基因組全長為1 759bp，基本沒有致病性，PCV2的基因組全長為1767bp或1768bp。兩個血清型的核苷酸的同源性低于80%，由基因序列推出的氨基酸的序列同源性小于76%。PCV2分離株間核苷酸的同源性大于94%，而PCV1分離株間核苷酸的同源性大于99%。

PCV基因組中含有圓環病毒所特有的莖環結構（Stem-loop structure），它是一保守的9核苷酸基序，序列為 TAGTATTAC（PCV1）或 AAGTATTAC（PCV2），這一序列對病毒DNA的復制非常關鍵，DNA的環復制就是從這里開始。莖環結構下游有4個六聚體重復（5′-CGG-CAG-3，H1 H2 H3 H4），這些序列是病毒復制酶蛋白的結合位點。

Hamel等（1998）應用軟件對PCV基因組進行分析，發現PCV1和PCV2均可能含有11個開放閱讀框（ORF）。其中 ORF1、2、3、4、7和 8具有一定的同源性，其余ORFs無任何同源性。編碼的蛋白大小從36 kDa～2 kDa不等。現已證實，PCV有兩個主要的閱讀框:ORF1和ORF2，二者在長度上都大于600bp。ORF1編碼與病毒復制相關的Rep蛋白，該蛋白氨基酸序列相當保守，是PCV1和PCV2產生抗原交叉性的主要原因；而ORF2編碼病毒的主要結構蛋白Cap，它是主要的免疫蛋白。

PCV2基因組的11個閱讀框大小相差懸殊（見表1）。其中 ORF1、ORF5、ORF7、ORF10，5′～3′方向相同；ORF2、ORF3、ORF4、ORF6、ORF8、ORF9、ORF11，5′～3′方向相同。這些閱讀框表現為重疊基因，從而充分利用了圓環病毒有限的遺傳物質，這可能是生物進化過程中自然選擇的結果。

表1 PCV2基因組的閱讀框概況

1.2 病毒編碼的主要蛋白

1.2.1 Rep蛋白 Rep蛋白……