蛋白質(zhì)組學(xué)研究中傅立葉變換離子回旋共振質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方法的比較

摘 要 探討了線性離子阱傅立葉變換離子回旋共振質(zhì)譜（LQF）的數(shù)據(jù)采集模式對(duì)蛋白質(zhì)組鑒定結(jié)果的影響，比較和分析了針對(duì)不同復(fù)雜程度樣本的最佳采集模式。對(duì)于α乳清蛋白種標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)酶切肽段混合物的簡單體系，在傅立葉變換離子回旋共振腔中選3個(gè)最強(qiáng)母離子進(jìn)行選擇離子監(jiān)測掃描后， 再實(shí)施二級(jí)碎裂的方法(SIM3) 得到的肽段覆蓋率， 分別是直接選1個(gè)最強(qiáng)母離子進(jìn)行二級(jí)碎裂(F1)方法得到的肽段覆蓋率的1.~1.9倍。另外對(duì)酵母蛋白酶切肽段混合物的復(fù)雜體系鑒定時(shí)，只采集雙電荷和三電荷母離子進(jìn)行二級(jí)掃描的方法（F1_23）比單電荷、雙電荷和三電荷都采集的方法（F1_123）得到的圖譜鑒定成功率提高6.1%。實(shí)驗(yàn)還對(duì)不同數(shù)據(jù)采集模式下圖譜的特點(diǎn)進(jìn)行了考察。本研究表明，針對(duì)不同復(fù)雜程度的樣本，應(yīng)采取不同的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方法。

關(guān)鍵詞 蛋白質(zhì)組學(xué)； 質(zhì)譜采集模式； 線性離子阱傅立葉變換離子回旋共振質(zhì)譜