多殺性巴氏桿菌基因組分泌蛋白的預測分析

摘要：分泌蛋白對于細菌自身的生命活動以及在介導病原體與宿主之間相互作用的過程中發揮著重要的作用，深入研究分泌蛋白將有助于明確細菌的生命活動及與病原微生物互作的分子機制，利用多殺性巴氏桿菌(Pasturella multocida)基因組學研究成果，結合信號肽分析軟件signalP v3.0、跨膜螺旋結構軟件TMHMM v2.0、亞細胞器蛋白定位軟件PSORTh和GPI—錨定位點軟件GPI—SOM這4個軟件，對多殺性巴氏桿菌2105個編碼蛋白的ORF進行預測分析，最終獲得了136個分泌蛋白。對其信號肽長度、氨基酸組成、相應ORF長度進行了統計。運用Blast P對其功能進行同源性分析，發現11個蛋白為多殺性巴氏桿菌所特有，這對多殺性巴氏桿菌的臨床診斷具有一定的潛在應用價值。

關鍵詞：多殺性巴氏桿菌；分泌蛋白；信號肽；生物信息學

中圖分類號：S852.61⁺2；Q78

文獻標識碼：A

文章編號：0439—8114(2009)11—2642—04