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基于Pearson系數(shù)的芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理方法

2006-12-31 00:00:00王修竹劉自偉競(jìng)
計(jì)算機(jī)時(shí)代 2006年11期

摘 要:數(shù)據(jù)預(yù)處理可以大大降低數(shù)據(jù)挖掘算法的成本和提高數(shù)據(jù)挖掘的效率,尤其對(duì)于海量和高維的基因表達(dá)數(shù)據(jù)更為重要。針對(duì)K-means算法對(duì)數(shù)據(jù)預(yù)處理手段敏感的問題,文章提出了一種以管家基因法初始化數(shù)據(jù)、Pearson系數(shù)度量芯片數(shù)據(jù)相似性的預(yù)處理方法。具體的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)證明了該方法能很好地解決上述問題并有效地提高k-means算法的收斂速度。

關(guān)鍵詞:管家基因法;Pearson相關(guān)系數(shù);K-均值聚類;芯片數(shù)據(jù)

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